段君
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:重庆医科大学更多>>
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- 基于RNA-seq技术分析慢性间歇性缺氧致认知障碍的机制
- 2023年
- 慢性间歇性缺氧(chronic intermittent hypoxia, CIH)是阻塞性睡眠呼吸暂停综合征(obstructive sleep apnea syndrome, OSA)的主要病理表现,也是OSA引起认知功能障碍的主要原因。本研究旨在基于RNA测序(RNA sequencing, RNA-seq)技术探索CIH致认知障碍在转录组层面的潜在机制。将24只SD大鼠随机分为对照组和慢性间歇性缺氧组(CIH组)。Y迷宫用于检测CIH对SD大鼠认知功能的影响。行为学测试结束后,提取大鼠海马组织总RNA进行高通量全转录组测序。R软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),并获得DElncRNAs (differentially expressed lncRNAs)、 DEmiRNAs (differentially expressed miRNAs)和DEmRNAs (differentially expressed mRNAs)。基于竞争性内源RNA(competitive endogenous RNA, ceRNA)理论,用生物信息数据库RNAhybrid、 miRanda和TargetScan预测lncRNA-miRNA相互作用对和miRNA-mRNA相互作用对。用Cytoscape构建特异性ceRNA网络。RT-qPCR和Western blot在非测序大鼠海马组织中验证测序结果。Y迷宫结果表明CIH损害大鼠的空间参考学习和记忆能力。RNA-seq筛选出4个DElncRNAs、 89个DEmiRNAs和774个DEmRNAs。基于基因间相互作用,成功构建由3个DElncRNAs介导的ceRNA调控网络。GO和KEGG富集分析结果提示ceRNA网络和神经元突触活性相关。RT-qPCR和Western blot结果表明关键DEGs表达改变和RNA测序结果基本一致。本研究探讨了关键lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控轴在CIH致认知障碍中潜在的生物学功能,为进一步阐明CIH致认知障碍分子机制提供了新见解。
- 黄尹裴刘智俐汪鑫刘恋李尧旭段君张峰李兵
- 关键词:慢性间歇性缺氧
- 应用CBCT分析不同骨面型安氏Ⅰ类患者下颌前磨牙位置的研究
- 目的: 1.探讨不同垂直骨面型安氏Ⅰ类患者下颌第一和第二前磨牙在牙槽骨中的位置是否存在差异,为正畸诊断、完美治疗计划的制定及治疗中精确调整牙齿的位置提供理论依据。 2.分别在相同垂直骨面型安氏Ⅰ类患者中比较下颌第一前...
- 段君
- 关键词:锥形束CT下颌前磨牙
- 文献传递