张勇
- 作品数：3 被引量：5H指数：1
- 供职机构：中国科学院生物物理研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 针对SARS冠状病毒重要蛋白的siRNA设计(英文)被引量：4
- 2003年
- NA干涉 (RNAinterference ,RNAi)是一种特异性地导致转录后基因沉默的现象 ,在哺乳动物细胞中小分子干扰RNA双链体 (smallinterferingRNAduplexes ,siRNAduplexes)可以有效地诱导RNAi现象 ,为一些疾病的治疗开辟了新的途径 .针对SARS冠状病毒 (SARScoronavirus ,SARS CoV)中编码 5个主要蛋白质的基因 ,用生物信息学的方法设计了3 48条候选siRNA靶标 .在理论上 ,相应的siRNA双链体能特异地抑制SARS CoV靶基因的表达 ,同时不会影响人体细胞基因的正常表达 。
- 张勇徐静怡邓巍张楠蔡伦赵义卜东波陈润生
- 关键词：SARS冠状病毒蛋白SIRNA生物信息学RNA干涉
- 脊椎动物基因注释中的大基因问题被引量：1
- 2003年
- 为了找出编码蛋白质的基因,注释流程结合了“从头开始的基因预测方法”和“与已知基因相似性比较”这两种方法。“从头开始的基因预测方法”虽然有很高的假阳性但是假阴性却很低;相形之下,结合了相似性比对的方法之后虽然能够降低假阳性,但是却大大提高了假阴性。我们发现,在这当中与基因预测正确率相关的最重要因素就是基因大小(包括内含子在内)——大基因尤其容易产生预测错误。
- 王俊李胜霆张勇郑洪坤徐昭叶葭于军黄家树
- 关键词：脊椎动物基因注释编码蛋白质假阳性假阴性基因预测
- 用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5'/3'UTRs
- 2004年
- mRNA的5 /3 UTRs是在mRNA翻译过程中起重要调控作用的序列,在5 /3 UTRs上不正常的剪接模式可能导致多种严重疾病.提出了一种基于大规模序列比对分析搜寻5 /3 UTRs跨染色体剪接现象的方法,并用此方法得到8例可信度高的跨染色体的5 /3 UTRs剪接事件,从信息的角度证实了来自不同染色体序列剪接成为5 /3 UTRs的现象是真实存在的.对这8例跨染色体剪接产生的5 /3 UTRs用多序列比对在剪接区域没有发现一致保守的motif.同时,目前的预测算法也不能在剪接区域检测到特异性的RNA二级结构,因此很难确定引导5 /3 UTRs跨染色体剪接的信号.
- 张治华张勇石宝晨邓巍赵屹陈润生
- 关键词：染色体生物信息学剪接RNA二级结构嵌合多序列比对
