董辰
- 作品数：10 被引量：7H指数：2
- 供职机构：复旦大学附属儿科医院更多>>
- 发文基金：上海市基础研究重大（重点）项目上海市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症1例报告并表型基因型关联性文献复习被引量：1
- 2016年
- 目的总结1例COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症（OI）的临床特征及基因突变的特点,为胎儿产前咨询提供依据。方法对产检B超检查示OI可能的胎儿流产组织抽提DNA进行基因型分析,自行设计COL1A1和COL1A2所有外显子及剪接区域的引物。利用Sanger测序法对胎儿行COL1A1和COL1A2基因外显子及剪接区域的测序分析并行父母验证。依据人类基因突变数据库（HGMD）专业版,对COL1A2突变所致疾病临床表型行文献复习。结果胎儿的COL1A1和COL1A2基因均检测出变异位点。COL1A2基因检测到杂合突变（c.3142G〉T,p.Glu1048Cys）在寡核苷酸多态性数据库、HGMD及Ⅰ型胶原蛋白突变数据库均未见报道,结合胎儿父母验证为新发突变,对比公共数据库及在线预测软件预测该突变类型为致病突变。在HGMD专业版中搜索COL1A2,共检索到387个COL1A2致病突变,与21种疾病及其亚型相关。92%的突变引起OI或其亚型,还可引起Ehlers-Danlos综合征或其亚型。结合COL1A2突变所致疾病临床表型行文献复习,本文报告胎儿符合Ⅱ型OI。结论产前通过超声影像结合基因分型诊断胎儿为COL1A2基因新发突变（c.3142G〉T,p.Glu1048Cys）所致Ⅱ型OI;COL1A2基因编码蛋白长链双螺旋的400~480氨基酸及MLBR 3区域中甘氨酸被天冬氨酸或谷氨酸替代,多导致严重表型的OI;本文为产前准确预测胎儿结局、指导临床决策提供依据。
- 董辰刘姜睿璇杨琳任芸芸周文浩
- 关键词：成骨不全症突变
- 椎体软骨发育不良伴免疫调节异常1例基因诊断及文献复习被引量：3
- 2016年
- 目的探讨1例罕见的矮小症伴多系统异常病例的临床和实验室诊断。方法采用全外显子组测序技术,结合高通量数据分析流程进行基因检测,并采用Sanger测序进行验证。结果患儿,男,14岁,发现身材矮小5年余。身高132cm,有面部色素沉着斑点和甲癣。外翻足已手术矫正,因自身免疫性溶血性贫血长期口服泼尼松治疗。头颅CT示两侧基底节、两侧额叶及左侧顶叶多发性钙化。脊柱平片示胸腰椎椎体变扁。全外显子组测序结合Sanger测序验证,发现ACP5基因纯合致病突变(c.643G>A,p.G215R),确诊为罕见的椎体软骨发育不良伴免疫调节异常(SPENCDI)。结论全外显子组测序是确诊疑难罕见病的有效方法之一。
- 董辰孙碧君杨琳吴冰冰周文浩王慧君
- 关键词：基因诊断
- 一例椎体软骨发育不良伴免疫调节异常的基因诊断和文献复习
- 目的:探讨一例罕见的矮小症伴多系统异常病例的临床和实验室诊断。方法:采用全外显子组测序技术,结合实验室建立的高通量数据分析流程,进行疑难病例的基因检测,并采用Sanger测序进行验证。结果:本例患儿为一个14岁的男孩,发...
- 董辰孙碧君杨琳吴冰冰周文浩王慧君
- 关键词：罕见病基因诊断
- 文献传递
- 基于单中心儿童样本库人群全外显子组数据的致病突变携带者分析
- 2016年
- 目的通过对比公共数据库和复旦大学附属儿科医院分子诊断中心(复旦儿科)样本库全外显子组测序(WES)数据中已知儿童致病突变频率差异,推测中国人群隐性遗传致病基因携带者频率分布。方法整理公共数据库(OMIM、Clin Var、HGMD)中常染色体隐性遗传病的致病基因和突变位点,计算复旦儿科样本库中的WES数据,基于公共数据库的致病基因的携带者频率。结果从公共数据库分析中共得到1 368个常染色体隐性致病基因上的60 209个位点。在复旦儿科1 147例临床WES样本中,共筛出408个基因上的1 016个突变位点。比较复旦儿科、人类外显子组整合数据库(ExAC)东亚(4 312例)和欧洲人群(33 301例)突变位点的出现频率,3个人群中均发现了人群特有的突变位点,相比ExAC欧洲人群,复旦儿科人群中的突变位点出现频率与ExAC东亚人群更为相近。在携带者频率>1%的基因中,复旦儿科和ExAC东亚人群相同的基因分别为70/81个(86.4%)和70/102个(68.6%);复旦儿科和ExAC欧洲人群相同的基因分别为37/81个(45.7%)和37/136个(27.2%)。结论通过与ExAC东亚和欧洲人群数据进行对比,中国人群中隐性致病基因及致病突变位点的携带者频率与ExAC东亚人群较为相似,与欧洲人群差异较大,建立针对中国人群特异性的常见遗传携带者突变位点筛查项目十分必要。
- 林伊凤王慧君吴冰冰杨琳董辰卢宇蓝周文浩
- 关键词：遗传病携带者
- COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症1例报道并表型基因型关联性分析
- 董辰周文浩
- 一例椎体软骨发育不良伴免疫调节异常的基因诊断和文献复习
- 目的:探讨一例罕见的矮小症伴多系统异常病例的临床和实验室诊断。方法:采用全外显子组测序技术,结合实验室建立的高通量数据分析流程,进行疑难病例的基因检测,并采用Sanger测序进行验证。结果:本例患儿为一个14岁的男孩,发...
- 董辰孙碧君杨琳吴冰冰周文浩王慧君
- 关键词：罕见病基因诊断
- COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症1例报道并表型基因型关联性分析
- 目的:总结1例COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症(OI)的临床特征及基因突变的特点,为胎儿产前咨询提供依据。方法:对胎儿流产组织抽提DNA进行基因型分析,自行设计COL1A1和COL1A2所有外显子及剪接区域的引物。...
- 董辰周文浩任芸芸
- 关键词：成骨不全症突变
- 儿童华法林药动和药效相关基因型频率和通路富集研究被引量：2
- 2016年
- 目的探讨华法林药动和药效相关基因位点的人群频率差异,为华法林药物基因组学研究提供基础数据。方法利用复旦大学附属儿科医院(我院)620例全外显子测序(WES)数据,对公共数据库中已报道的华法林药物相关位点计算等位基因频率。与千人基因组东亚人和欧洲人的等位基因频率进行比较。结果我院620例WES数据共检测到27个药物相关的多态性位点,涉及12个基因。27个华法林药物相关位点中,3个位点在这3组人群间差异无统计学意义(P≥0.01);10个位点在我院WES数据与千人基因组东亚人等位基因频率差异无统计学意义(P≥0.01)、与千人基因组欧洲人等位基因频率差异有统计学意义(P<0.01);1个位点我院WES数据与千人基因组东亚人等位基因频率差异有统计学意义(P<0.01)、与千人基因组欧洲人等位基因频率差异无统计学意义(P≥0.01);13个位点在我院WES数据与千人基因组东亚人、欧洲人等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.01)。结论华法林已报道的药物相关位点存在明显种族差异性,明确其变异为制定华法林个体化给药的精准医疗提供了基础数据。
- 杨琳董辰王慧君卢宇蓝周文浩
- 关键词：药物基因组学种族差异华法林
- 基于快速和常规全外显子组分析技术对遗传性疾病的诊断程序比较被引量：1
- 2016年
- 目的探索可被临床医生直接应用的全外显子测序(WES)数据分析平台及方法。方法选择复旦大学附属儿科医院(我院)临床诊断不明疾病的核心家系3例(例1～3)和仅先证者2例(例4和5)行WES分析,采用Wu Xi NextCODE临床测序数据分析系统(简称NextCODE平台)进行快速数据分析,并与我院分子诊断中心已建立的高通量数据分析流程(简称常规数据分析流程)进行参与人员及耗时的比较。结果例1～3基于表型相关候选基因联合遗传模式的分析方法,分别检测到FGFR2基因杂合突变、GBE1基因复合杂合突变及TBX1基因杂合突变;例4和5通过表型相关候选基因分析,分别检测到IL10RA基因纯合突变和复合杂合突变。NextCODE平台自动完成3/7个步骤,从输入表型至生成报告,WES数据分析用时30 min以内。常规数据分析流程自动完成1/7个步骤,6个人工完成步骤需要多个专业人员进行数据的筛选及解读,从输入表型至生成报告,熟练的专业人员用时2～8 h。结论 5例临床诊断不明病例通过WES明确了诊断;NextCODE是直接为临床医生所用、简单快速的WES数据分析平台,有助于协助临床医生直接利用高通量测序数据,准确锁定致病突变,提高诊断效率。
- 杨琳董辰魏泽峻卢宇蓝吴冰冰王慧君周文浩
- 关键词：WUXINEXT
- COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症1例报道并表型基因型关联性分析
- 目的:总结1例COL1A2新突变致胎儿严重成骨不全症(OI)的临床特征及基因突变的特点,为胎儿产前咨询提供依据。方法:对胎儿流产组织抽提DNA进行基因型分析,自行设计COL1A1和COL1A2所有外显子及剪接区域的引物。...
- 董辰周文浩任芸芸
- 关键词：成骨不全症突变
- 文献传递
