陈朋
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
- 供职机构:安徽医科大学第一附属医院更多>>
- 发文基金:安徽省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基因芯片筛选肝细胞性肝癌的差异表达基因和通路被引量:3
- 2019年
- 目的 通过基因芯片和生物信息学的分析方法,筛选与肝癌发病相关的差异表达基因和通路,为进一步研究肝癌发生发展过程中的相关机制提供依据。方法 收集2对肝癌组织和对应的癌旁组织,提取总RNA,并与基因芯片行杂交检测,分析得到差异表达基因。使用DAVID数据库,对差异基因行GO功能注释和KEGG富集分析;应用String蛋白互作数据库分析差异表达基因的蛋白互作关系,构建蛋白互作网络并通过Cytoscape行可视化分析,运用网络分析插件CytoHubba筛选核心基因,最后结合TCGA (The Cancer Genome Atlas)数据库中肝癌基因表达数据,初步探究核心基因在肝癌中的表达情况。结果 按设定的标准,共筛选得到4 324个差异表达基因,上调表达的有2 552个,下调表达的有1 772个。GO分析显示差异基因主要参与血小板衍生生长因子结合、受体抑制剂和拮抗剂活性等相关的分子功能;KEGG富集分析提示这些基因与TGF-β、Rap1、PI3K-Akt以及趋化因子等信号通路相关。蛋白互作网络分析筛选得到6个核心基因,TCGA数据库验证发现核心基因DCN、COL1A1和COL1A2在肝癌组织中的表达存在显著差异(P<0.000 1)。结论 GO功能注释和KEGG富集分析揭示了肝癌潜在的发病机制,核心基因为肝癌的研究提供新方向,有可能成为肝癌诊断和治疗的潜在靶点。
- 江勇钱叶本陈朋朱良
- 关键词:肝癌基因芯片差异表达基因核心基因
- miR-9与肝癌的研究进展被引量:1
- 2015年
- 原发性肝细胞性肝癌(以下简称肝癌)是消化系统常见的恶性肿瘤,世界卫生组织WHO最新指出其年死亡率居肿瘤死亡率的第二位。复发和转移是肝癌等恶性肿瘤的突出特点,也是治疗的难点[1]。microRNA是常见的内源性非编码小分子单链RNA。迄今为止,人们已经发现了2500多种人成熟miRNA,大约有3%的基因能编码miRNA,同时miRNA能对约三分之一的基因表达进行转录后调控[2]。
- 陈朋孙景畅钱叶本
- 关键词:表观遗传
- 术前胆道引流对肝门胆管癌术后病人的影响的Meta分析被引量:7
- 2017年
- 目的术前胆道引流对肝门胆管癌病人术后是否有益一直存在争议,本篇meta分析就这一争议做出分析。方法通过检索Medline、Wiley Online Library、Cochrane library databases和CBM在2016年11月25日以前公开发表的英文文献,收集关于术前胆道引流对于肝门胆管癌病人术后的影响。按纳入与排除标准筛选文献、提取数据,采用Revman 5.3评估相对危险度和95%可信区间。结果术前胆道引流可增加肝门肝管癌患者术后的感染发病率(RR=0.57:95%CI=0.79~3.10,P=0.009)和降低术后肝衰的发病率(RR=0.45,95%CI=0.24~0.87,P=0.02)。采用外引流的术后并发症发病率更是相对于未引流更高(RR=1.32,95%CI=1.02~1.71,P=0.03)。在术后死亡率和发病率,包括一些非感染发病率引流组与未引流组无显著差异。结论术前胆道引流可以减少术后肝衰发病率,但会增加术后感染发病率,需根据时机选用。
- 郭晗陈朋袁鹏沈杭朱良钱叶本李锐
- 关键词:肝门胆管癌术前胆道引流
- miR-9与肝癌的研究进展被引量:1
- 2015年
- 原发性肝细胞性肝癌(以下简称肝癌)是消化系统常见的恶性肿瘤,世界卫生组织WHO最新指出其年死亡率居肿瘤死亡率的第二位。复发和转移是肝癌等恶性肿瘤的突出特点,也是治疗的难点[1]。microRNA是常见的内源性非编码小分子单链RNA。迄今为止,人们已经发现了2500多种人成熟miRNA,大约有3%的基因能编码miRNA,同时miRNA能对约三分之一的基因表达进行转录后调控[2]。
- 陈朋孙景畅钱叶本
- 关键词:表观遗传
- Talin-1与肝癌的研究进展
- 2016年
- 原发性肝癌是消化系统常见的恶性肿瘤,最新研究报道其年死亡率仅次于胃癌和肺癌而居肿瘤死亡率的第三位。复发和转移是肝癌的突出特点,同时也是治疗的难点。
- 陈朋郭晗朱良钱叶本
- 关键词:肝细胞癌整合素