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植物应答非生物胁迫的蛋白质组学研究进展被引量：27: 2016年; 逆境对植物的生长发育产生不利影响,植物在长期适应环境中演化出了相应的机制。蛋白质是基因表达的最终产物,是细胞生命活动的基础,在逆境条件下,许多与逆境相关的蛋白质表达量发生变化。蛋白质组学技术的发展为鉴定和研究逆境响应相关蛋白提供了手段,为阐述逆境应答分子机理提供了重要的依据。本综述根据近年来采用蛋白质组学研究植物应答非生物胁迫(干旱,高盐和低温)的结果,总结并讨论了不同逆境下蛋白表达的组织特异性特点,旨在为理解植物的逆境胁迫响应机制提供更多信息。; 付晨熙肖自华高飞周宜君; 关键词：蛋白质组学植物抗逆性

甘草microRNA及其靶基因的生物信息学预测被引量：5: 2016年; 目的利用生物信息学手段预测甘草Glycyrrhiza uralensis的micro RNA(mi RNA),并实验验证其存在,确定相应的靶基因,为理解甘草mi RNA的生物学功能奠定基础。方法下载公共核酸数据库中的甘草高通量测序序列和表达序列、标签序列,使用Trinity和Assembler等软件拼接以获得转录本数据。基于mi RNA前体序列在植物物种间的保守性,将mi RBase数据库中的已知植物mi RNA前体与甘草转录组序列进行Blast比对,按照mi RNA前体应具备的标准进行筛选。通过stem-loop q RT-PCR实验验证mi RNA。使用ps RNATarget软件进行mi RNA的靶基因预测,并对靶基因进行功能分析。结果序列拼接获得88 263条甘草转录组数据。使用这些数据预测到分属于17个家族的49个mi RNA序列,以及相应的30个茎环结构前体,随机选取其中12个,经实验验证,确实存在。这些mi RNA靶向的172个基因主要参与基因转录调控、信号转导、发育调控和防御反应等生物学过程。结论新预测的甘草mi RNA及其靶基因为进一步研究mi RNA在甘草中的生物学功能奠定了基础。; 李华云王宁韦春香张彤付晨熙高飞周宜君; 关键词：甘草 MIRNA 靶基因生物信息学转录组

蒙古沙冬青miRNA的鉴定及与新疆沙冬青的比较转录组学分析: 基于前期蒙古沙冬青转录组和基因组测序基础,通过小RNA 测序鉴定了分属于34 个家族的166 个保守miRNA、53 个保守性较差或不保守的miRNA、100多个潜在的新miRNA,以及其前体。降解组测序确定了这些miR...; 高飞王宁李华云付晨熙肖自华韦春香冯金朝周宜君; 关键词：MIRNA

蒙古沙冬青叶蛋白质双向电泳体系的建立和优化被引量：1: 2017年; 开展蒙古沙冬青叶组织的蛋白质组学研究,需要建立和优化叶的蛋白质组双向电泳体系。本研究以蒙古沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)叶片为材料,比较了不同总蛋白提取方法(TCA-丙酮法和Tris-饱和酚法)、不同染色方法(考马斯亮蓝染色和硝酸银染色)和不同蛋白质上样量对双向凝胶电泳蛋白质得率和等电聚焦效果的影响。结果显示,采用TCA-丙酮法提取蒙古沙冬青叶片总蛋白,蛋白质上样量500μg,以硝酸银染色SDS-PAGE胶,双向电泳的分辨率最高,图谱清晰。该方法的建立为开展蒙古沙冬青叶片蛋白质组定量和定性分析奠定了基础。; 付晨熙肖自华高飞周宜君; 关键词：叶片蛋白质组双向电泳

干旱胁迫下蒙古沙冬青叶片蛋白质组学研究被引量：4: 2017年; 通过对蒙古沙冬青[Ammopiptanthus mongolicus(Maxim)Cheng.f]叶组织干旱胁迫下蛋白质组变化的研究,从蛋白表达水平阐释其应答干旱胁迫的分子机制。以20%PEG 6000胁迫处理1 h和72 h,以0 h为对照,提取叶片总蛋白,利用双向电泳和质谱鉴定技术分析差异表达蛋白。共鉴定了40个差异表达蛋白,按功能可分为9类:光合作用,ROS清除,蛋白的合成、加工与降解,物质运输,防御相关,RNA加工,氨基酸代谢,其他相关蛋白和功能未知蛋白质。蒙古沙冬青叶片应答干旱胁迫的核心是叶绿体结构和光合作用的维持。; 付晨熙肖自华高飞周宜君; 关键词：叶片蛋白质组差异表达蛋白

蒙古沙冬青根响应干旱的蛋白质组学研究: 蒙古沙冬青[Ammopiptanthu mongolicus(Maxim)Cheng f.] 属豆科(Leguminosae)蝶形花亚科(Papilionaceae)黄华族(Thermosideae)沙冬青属(Ammo...; 付晨熙高飞肖自华刘楠韦善君冯金朝周宜君; 关键词：干旱胁迫蛋白质组学

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付晨熙