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计算方法研究HIV-1蛋白酶及其变异与小分子GRL-0519的相互作用: 2017年; 艾滋病病毒在世界范围内的传播,严重地威胁到人们的身心健康.HIV-1蛋白酶的残基变异严重地削弱了药物的治疗效果.为了研究残基变异D30N、I54M和V82A对蛋白酶结合抑制剂GRL-0519的影响,本研究进行了4个30 ns的分子动力学(MD)模拟,并采用溶解相互自由能(SIE)方法计算了蛋白酶和抑制剂的结合能.计算结果表明,极性相互作用不利于变异的蛋白酶结合抑制剂,而对于野生型的蛋白酶(WT),极性相互作用有微弱的贡献,极性相互作用是残基变异抗药性的主要原因,计算得到的总结合能与实验的数据一致.为了说明每个残基在抗药性中的贡献,采用分子力场的方法计算了每一个残基与小分子作用的范德华作用能,并分析了抑制剂与蛋白酶形成的氢键.范德华作用分析表明,V82A残基变异对结合模式的影响较小,相对于WT,D30N有5个残基的范德华贡献差异大于0.4 kcal/mol,I54M残基变异的蛋白酶有6个残基.氢键的分析说明,D30N和I54M变异丢失了几个氢键;范德华作用和氢键的分析结果与SIE的计算结果一致.研究结果为设计新的更有效的抗HIV-1蛋白酶变异的抑制剂提供了理论指导.; 李高峰扈国栋扈国栋季保华张晨; 关键词：抑制剂分子动力学模拟

DSS1 Effect the Conformational Stability of PCID2 by Molecular Dynamics Simulation: Background: DSS1 is a small acidic protein that regulates the functional integrity of multiple protein complex...; 刘倩君张晨扈国栋王吉华; 关键词：PROTEIN MOLECULAR DYNAMICS CHANGES BINDING

基于人工表面等离激元和介质集成悬置线的带通滤波器: 本发明公开了一种基于人工表面等离激元和介质集成悬置线的带通滤波器，包括顺序设置的五层介质层，每层介质层包括介质板和上下表面的金属贴片，顶层和底层结构对称；第二层和第四层结构对称，中心介质挖空形成镂空结构；第三层介质层四角...; 刘金海唐延柯盖宁贾冉张素珍王丽唐荣霞张晨宋国华祁胜文; 文献传递

基于人工表面等离激元和介质集成悬置线的带通滤波器: 本发明公开了一种基于人工表面等离激元和介质集成悬置线的带通滤波器，包括顺序设置的五层介质层，每层介质层包括介质板和上下表面的金属贴片，顶层和底层结构对称；第二层和第四层结构对称，中心介质挖空形成镂空结构；第三层介质层四角...; 刘金海唐延柯盖宁贾冉张素珍王丽唐荣霞张晨宋国华祁胜文; 文献传递

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张晨