黄峻
- 作品数:2 被引量:5H指数:1
- 供职机构:福建农林大学植物保护学院生物农药与化学生物学教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 稻瘟病菌中HOPS复合体生物信息学分析及MoYpt7在MoVps41突变体中的定位分析被引量:1
- 2017年
- 据报道,酵母中HOPS复合体参与囊泡融合及运输。本研究分别以酿酒酵母HOPS复合体各亚基氨基酸序列,通过BLASTp在稻瘟病菌数据库中搜索得到了6个酿酒酵母HOPS复合体各亚基的同源蛋白,我们通过生物信息学方法对稻瘟病菌6个HOPS复合体亚基的同源蛋白的理化特性、蛋白质结构域和进化关系进行了分析。基于稻瘟病菌98-06菌丝阶段和孢子侵染水稻CO39不同阶段转录组测序数据,分别选取稻瘟病菌内吞和外泌途径相关的基因,制作了表达模式图。此外,MoYpt7蛋白在其假定下游效应因子ΔMoVps41突变体中的定位研究表明MoVps41可能影响了液泡融合。
- 张晓杰黄峻陈云云郑秀霞余盼朱明慧李源胡燕佩张冬梅王宗华
- 关键词:稻瘟病菌内吞
- 稻瘟病菌NUDIX水解酶家族的生物信息学及表达特性研究被引量:4
- 2016年
- NUDIX水解酶家族能够清除和调节细胞内产生的有害代谢产物,在机体保护、调节和信号传递等过程中发挥重要的生物学功能,大豆疫霉中的无毒蛋白Avr3b就具有NUDIX水解酶活性。为了探究稻瘟病菌中NUDIX水解酶家族的生物学功能,我们借助生物信息学手段对稻瘟病菌中鉴定出的18个NUDIX蛋白的结构、理化性质、系统进化关系进行了分析,结合RNA-seq和RT-PCR数据,我们发现其中的两个蛋白NUDIX15-1和NUDIX15-2同大豆疫霉无毒蛋白Avr3b高度同源,极有可能在稻瘟病菌的侵染过程中发挥功能。
- 陈龙洪永河吴晓贤黄峻陈美莲钟振晖陈晓峰张冬梅鲁国东
- 关键词:稻瘟病菌生物信息学