侯越
- 作品数:4 被引量:6H指数:1
- 供职机构:东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 染色质构象解析技术——Hi-C及染色质构象信息提取被引量:5
- 2015年
- 真核生物染色质在核内的空间组织形式能影响DNA的空间分布,因而对基因转录、DNA复制等生物学过程具有调节作用。目前对这种空间上高度有序的基因组结构的认识还是粗糙的、碎片式的和不完整的。近年,利用染色质构象捕获技术发展起来的衍生技术——Hi-C技术,是一种研究全基因组范围的染色质相互作用以及探明全基因组的三维结构的分析技术。利用Hi-C技术能够对染色质内部或所有染色质之间的相互作用进行精细分析,从而把基因表达调控引入到空间的、全局性的研究层面,为全面解析与DNA有关的生物学过程的机理开启新的契机。本文主要阐述染色质构象解析技术Hi-C的实验原理、数据处理以及染色质构象信息提取,包括染色质内相互作用情况分析、全基因组基因活性分类、拓扑关联结构域(TAD)和染色质环(chromatin loop),介绍染色质构象信息与基因调控研究方面的国际前沿进展。
- 胡文桥侯越张峰刘宏德孙啸
- G-四链体与染色质结构相互作用关系的研究进展被引量:1
- 2022年
- G-四链体(G-quadruplex,G4)是最早在体外条件下观察到的一类特殊的核酸二级结构,基因组DNA上的G4以多种方式调控染色质结构与状态,其在DNA复制、基因转录、染色质构象变化等生物学过程中发挥着重要作用。本文概述了G-四链体DNA(G4-DNA)的基本结构特征和功能,重点综述了G4与染色质结构之间的相互作用关系,包括G4在染色质开放区域的富集现象,G4与表观修饰之间的相互作用关系,G4对染色质高级结构的影响。对G4与染色质结构相互关系的研究不仅能够帮助我们更深入地探究G4的功能,还能进一步地了解G4与疾病的关系,并以G4为靶标开展新药研究。
- 杨婧侯越舒慧灵孙啸
- 两核苷酸同时合成DNA测序方法的解码模型研究
- 两核苷酸同时合成DNA测序方法(sequencing by dinucleotide-synthesis,SBDS)是一种全新的测序方法,其原理与传统二代测序技术有很大不同.本文针对SBDS独特的测序原理,建立具有容错特...
- 张睿雄侯越夏超孙啸
- 文献传递
- 基因组G-四链体与疾病的关系
- 2021年
- G-四链体(G-quadruplex, G4)是一种特殊的核酸二级结构,形成于单链DNA或者RNA的富含鸟嘌呤的区域。其广泛存在于基因组中,多位于端粒、启动子和UTR等区域。G4结构检测的生物物理学方法可以获取G4具体的空间结构信息,而生物学检测方法通常与高通量测序技术结合,可以对G4做全基因组范围内的测序分析。G4结构在生物体内有着非常重要的调控功能,它可以影响染色质结构、基因调控以及基因组稳定性,因此与人类疾病密切相关,包括癌症、神经系统疾病、贫血症等。G4可以作为药物的靶标,迄今已有许多G4特异的配体被研发出来,在疾病治疗方面无疑具有很好的应用前景。
- 李浩张荣鑫侯越孙啸
- 关键词:基因调控疾病