张婷婷
- 作品数：13 被引量：19H指数：3
- 供职机构：贵州医科大学更多>>
- 发文基金：贵州省科技计划项目贵阳市科学技术计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生文化科学轻工技术与工程更多>>
- 贵阳市5所医院呼吸科病房空气中曲霉菌种类及携带真菌病毒调查被引量：3
- 2016年
- 目的:分析贵阳市5所医院呼吸科病房空气中曲霉菌种类及携带真菌病毒的情况。方法:采用含50 mg/L头孢霉素的马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)平板敞口置于病房24 h后收集平板培养,检测5所医院呼吸科病房空气中曲霉菌株;采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取真菌病毒DNA、纤维素吸附的方法提取菌病毒双链RNA(dsRNA),琼脂糖凝胶电泳检测真菌病毒。结果:共收集到曲霉菌597株,其中黄曲霉菌株467株,烟曲霉菌株90株,黑曲霉菌株40株;CTAB法未检测到DNA病毒,纤维素吸附法检测到dsRNA病毒,90株烟曲霉菌株中有11株含有dsRNA病毒,病毒电泳条带类型有2种;467个黄曲霉菌株中有24株含有dsRNA病毒,病毒电泳的条带类型有3种;40个黑曲霉菌株有9株含有dsRNA病毒,病毒电泳条带类型只有1种。结论:烟曲霉、黄曲霉和黑曲霉菌株中携带有较多dsRNA病毒。
- 江银辉张彪吴昌学袁清官志忠张婷婷
- 关键词：曲霉菌抗真菌药真菌病毒RNA病毒
- 课程思政在生物技术与疾病诊断课程中的实践体会被引量：2
- 2021年
- 本文介绍结合生物技术专业特点推进生物技术与疾病诊断课程思政的建设,重点探讨如何立足专业特色转换教学思路,以专业课程教学为前提进行家国情怀及使命担当、服务地方生物医疗卫生事业、遵守职业道德等思政元素挖掘,在课程教学的专业知传授中结合课程思政元素的经验与体会,以期为相关专业课程思政建设提供一些思路和参考。
- 钟乃凤胡祖权刘丽娜张婷婷张洁
- 关键词：教学实践教学研究
- 短短芽孢杆菌几丁质酶BBChi4基因的原核表达及抑菌活性研究被引量：2
- 2019年
- 采用生物信息学方法分析短短芽孢杆菌GZDF3菌株几丁质酶BBChi4基因,以GZDF3菌株全基因组DNA为模版设计特异性引物,通过PCR扩增出BBChi4基因的全序列并对其测序验证。将测序验证无误的基因序列连接到原核表达载体(pET-28a),构建重组表达载体pET-28a-BBchi4,转入大肠杆菌BL21进行诱导表达,利用打孔法对诱导表达产物进行抑菌活性研究。生物信息学分析显示BBChi4基因全长为2 181 bp,编码726个氨基酸,分子量大小为77.69 kD,等电点为4.83,属于酸性几丁质酶。破碎重组表达菌体上清液SDS-PAGE电泳显示,重组蛋白质分子量大约为78 kD,与生物信息学预测结果一致。诱导表达最佳参数为1 mmol/L IPTG,30℃诱导4 h。破碎重组表达菌体上清液对半夏致病真菌(尖孢镰刀菌)有较强的拮抗作用。重组表达载体pET-28a-BBchi4的成功构建及表达为深入研究几丁质酶的功能提供科学依据。
- 陶小买曾丽娜贾化可张婷婷任建国张洁刘红美
- 关键词：几丁质酶基因原核表达抑菌活性
- 一种药物组合物及其应用
- 本发明公开了一种药物组合物及其应用，涉及医药技术领域。所述的药物组合物包括镰刀菌酸或镰刀菌酸型化合物与喹诺酮类、β‑内酰胺类和/或四环素类抗生素中的一种或多种抗生素以1:500～128:1的质量配比进行组合，应用于制备治...
- 徐国波刘俊雷丹丹张青艳肖耀华廖尚高周孟何迅张婷婷李靖李勇军
- 文献传递
- 一种黄花白芨的鉴别方法
- 本发明公开了一种黄花白芨的鉴别方法，属于中药材鉴别技术领域，该方法包括以下步骤：挑选一批不同种类的黄花白芨和紫花白芨，采用CTAB方法分别抽提白芨个体基因组DNA，然后设计引物对白芨核糖体大亚基基因的D1‑D3区DNA序...
- 刘红美张洁刘显义张婷婷曾丽娜
- 文献传递
- 稻曲病菌菌株GZ-14-07中携带的全病毒基因组特征研究被引量：1
- 2020年
- 稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原。从稻曲病菌菌株GZ-14-07中分离到一株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens RNA virus 6(UvRV6),对其进行了序列分析。通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-14-07中的真菌病毒UvRV6,采用随机引物扩增法获得UvRV6的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对UvRV6的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。研究发现UvRV6全基因组长度为5043个碱基,GC为48.8%,UvRV6基因组序列中存在两个开放阅读框(ORF1和ORF2),ORF1长2280个碱基,编码760个氨基酸(79.6 kD),ORF2长2385个碱基,编码830个氨基酸(91.5 kD)。ORF1和ORF2编码的蛋白,分别与全病毒科维多利亚属真菌病毒成员的衣壳蛋白和依赖于RNA的RNA聚合酶显著出较高的相似性。另外,UvRV6的ORF1和ORF2之间有一个AUGA序列,在AUGA序列上游存在一段能形成一个H型的假节序列,这两个序列元件的存在使UvRV6两个开放阅读框(ORF1和ORF2)能通过翻译终止后又重新启动翻译的机制,融合成一个大的开放阅读框。最后,通过UvRV6和其他全病毒科成员的依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白序列构建的系统进化树分析得出,UvRV6与属于全病毒科维多利亚属的成员聚集成一簇。明确了UvRV6属于全病毒科维多利亚属的新成员。
- 张婷婷滕丽蔡小姚龙慧李升愉刘红美
- 关键词：稻曲病菌真菌病毒DSRNA
- Rhodosporidiobolus odoratus菌株GZ2017中真菌病毒的分离和鉴定
- 2020年
- 为Rhodosporidiobolus odoratus菌株中病毒的鉴定提供参考,从Rhodosporidiobolus odoratus菌株GZ2017中,分离真菌病毒Rhodosporidiobolus odoratus Totivirus 1(RoTV1);获取并解析真菌病毒RoTV1的全长基因组序列;明确真菌病毒RoTV1的病毒学分类学地位。采用随机引物法扩增病毒的全长序列;使用接头引物扩增法获取病毒末端序列;获取的病毒片段通过DNAMAN软件进行拼接;序列同源性搜索使用NCBI网站的在线BLAST程序;使用MEGA7.0软件进行系统进化树的构建。结果表明:成功分离新型真菌病毒RoTV1,其携带3条病毒条带,分别为dsRNA1、dsRNA2和dsRNA3。获得RoTV1的全长基因组序列,其中,dsRNA1序列分析显示具有2个不连续的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),即ORF1和ORF2。ORF1和ORF2分别跟全病毒科(Totiviridae)全病毒属(Totivirus)真菌病毒编码的外壳蛋白(Coat Protein,CP)和RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)具有较高的相似性。ORF1和ORF2之间间隔92个碱基。ORF2有可能通过1个由移码序列(GGAUUUU)启动的-1核糖体移码机制跟ORF1融合成1个大的融合蛋白。对dsRNA2和dsRNA3序列进行分析,未发现编码有意义的大ORF,无已知的蛋白质与dsRNA2和dsRNA3具有序列相似性。此外,dsRNA1、dsRNA2、dsRNA3在菌株GZ2017中非常稳定和相互依赖,推测dsRNA2和dsRNA3可能是dsRNA1的卫星RNA(SatRNA)。另外,基于RoTV1的RdRp和CP序列进行的系统发育分析表明,RoTV1属于Totiviridae科Totivirus属的新成员。
- 张婷婷蔡小姚滕丽刘红美尚小丽
- 关键词：真菌病毒基因组分析
- 稻曲病菌菌株GZ-2中携带的病毒基因组特征
- 2020年
- 稻曲病菌是引起真菌类病害水稻稻曲病的病原。从稻曲病菌菌株GZ-2中分离到1株真菌病毒,命名为Ustilaginoidea virens Unclassified virus 2(UvUV2),对其进行了序列分析。通过CF-11纤维素粉法提取菌株GZ-2中的真菌病毒UvUV2,采用随机引物扩增法获得UvUV2的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对UvUV2的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。结果表明:UvUV2全基因组长度为2 887bp,GC含量为58.8%,UvUV2基因组序列中存在2个重叠的开放阅读框(ORF1和ORF2)。ORF1长561bp,编码186个氨基酸(20.06kDa),编码1种未知蛋白;ORF2长2 394bp,编码797个氨基酸(89.42kDa),编码依赖于RNA的RNA聚合酶。ORF2编码的蛋白与Purpureocillium lilacinum nonsegmented virus 1(PINV-1)RNA的RNA聚合酶关系最密切。另外,UvUV2病毒基因组序列中发现1个类似甲型流感病毒基因组中的滑动序列(CCC_UUU_UAG),使得UvUV2的ORF1和ORF2通过+1移码机制形成融合蛋白。通过UvUV2的依赖于RNA的RNA聚合酶蛋白序列构建的系统进化树分析得出,UvUV2是一种未分类的真菌病毒。综上所述,UvUV2属于一个未分类的科。
- 张婷婷滕丽蔡小姚刘红美
- 关键词：稻曲病菌真菌病毒DSRNA
- 棘孢木霉菌携带真菌病毒TaUV1的分离与鉴定
- 2020年
- 为棘孢木霉菌株(Trichoderma asperellum)中病毒的鉴定提供参考,在棘孢木霉菌株中分离到真菌病毒Trichoderma asperellum Unassigned Virus 1 (TaUV1);对其全长基因组序列进行了分析,明确真菌病毒TaUV1的病毒分类学地位。采用随机引物扩增法获得TaUV1的全长基因组序列,使用DNAMAN、BlastP和MEGA等软件对TaUV1的全长序列进行拼接、比对和系统进化树分析。结果表明:真菌病毒TaUV1携带1条病毒条带,其基因组长度为9 838bp,GC含量为47.8。经序列分析显示,具有2个不连续的开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),即ORF1和ORF2。ORF1长4 509bp,编码假定蛋白(Hypothetical protein,HP);ORF2长3 984bp,编码RNA依赖的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp)。ORF1和ORF2之间间隔113个碱基,在ORF1终止密码子TAA的5 684~5 686bp发现了1个移码序列七聚体(AAAAAAT),在此处发生了程序性-1的核糖体移码机制,使2个ORFS被通读,编码1个融合蛋白。基于TaUV1的RdRp序列进行的系统发育分析得知,TaUV1属于Unassigned Virus科的新成员。
- 张婷婷蔡小姚滕丽周静刘红美
- 关键词：真菌病毒全基因组
- 不同花色白芨四种DNA条形码的序列分析被引量：3
- 2018年
- 采用CTAB法提取2种花色白芨基因组DNA,选用trnH-psbA、rbcL、ITS、LSU D1-D3 4种植物DNA条形码通用引物进行PCR扩增,分析黄花、紫花白芨(Bletilla striata)4种DNA条形码的序列,扩增产物纯化后连接T载体并测序,用DNAMAN软件对测序结果进行多序列比对分析。再根据SNP位点设计引物,利用位点特异性PCR扩增进行鉴定。结果表明,4对植物DNA条形码通用引物均能进行扩增,其中trnH-psbA序列没有发现SNP位点、rbcL序列出现2个SNP位点、ITS序列出现62个SNP位点、LSU D1-D3序列出现3个SNP位点。根据LSU D1-D3序列上的2个SNP位点设计的引物DUAN5(5′-TAGTAACGGCGAGCGAAC-3′)和JDHH(5′-TTATCAGCTTCCTTGCGCCCG-3′)能准确鉴定出黄花白芨,成功获得鉴定黄花白芨的引物序列。
- 曾丽娜刘显义石建龙梁大勇张洁张婷婷张婷婷刘红美
- 关键词：DNA条形码PCRSNP
