潘伟光
- 作品数：25 被引量：89H指数：5
- 供职机构：广东医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金深圳市南山区科技计划项目深圳市科技局资助项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 一株利奈唑胺耐药粪肠球菌的全基因组测序和序列比较被引量：2
- 2014年
- 目的研究利奈唑胺耐药粪肠球菌的全基因组序列,并探讨与其它肠球菌序列的差异。方法从1例男性急性白血病患者的气管分泌物中分离到粪肠球菌株Deng1(E.fecalis Deng1)。通过Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+进行高通量全基因组鸟枪法测序(high-throughput whole-genome shotgun sequencing)。基因组Contigs和scaffolds通过Newbler汇编软件分析。基因组gap closures通过Sanger测序法确定。通过Phred/Phrap/Consed软件构建圆环型的基因组图,并通过软件Prokaryote Genomes Automatic Annotation Pipeline(PGAAP)进行基因组注释。参考序列和粪肠球菌Deng1基因组之间的系统发育分析(phylogenice analysis)通过muscle软件分析。结果 E.fecalis Deng1圆环形基因组包含2,961,043碱基对,GC含量37.5%。基因组含有2 854个编码序列(CDS),62个tRNA的编码基因,以及4个完整的rRNA基因编码的操纵子。E.fecalis Deng1基因组共有443个毒力因子。E.fecalis Deng1基因组致病岛(PAI)约170kb,含有编码溶细胞毒素、肠球菌表面蛋白Esp和Gls-24-样蛋白等的毒力因子,E.fecalis Deng1含有对链霉素高水平耐药的氨基糖苷类6-腺苷酰转移酶基因(aadK),以及与抗生素耐药相关的emea,lsa和tetM基因。结论完成了一株粪肠球菌完整基因组的测序分析,加深了对LZD耐药流行菌株的认识。
- 郑金鑫董琨陈重潘伟光李多云刘晓军邓启文余治健
- 关键词：粪肠球菌利奈唑胺高通量测序全基因组序列
- 利奈唑胺耐药金黄色葡萄球菌与克林霉素交叉耐药规律被引量：1
- 2015年
- 目的阐明体外诱导利奈唑胺耐药金黄色葡萄球菌与克林霉素交叉耐药的变化规律。方法收集2株金黄色葡萄球菌质控菌ATCC29213和ATCC25923,1株乳汁来源的金黄色葡萄球菌和1株血流感染的金黄色葡萄球菌(编号分别为S2、S3、S5和S7菌株,均为利奈唑胺敏感株),通过体外浓度倍增法诱导利奈唑胺耐药;挑取单克隆,37℃培养16h,经E-test条测定MIC值,获得各菌株的耐药浓度梯度,同时测定各菌株对克林霉素的MIC值,提取耐药菌株基因组DNA,PCR扩增23Sr RNA V区基因,扩增产物经测序后与野生株比较,获得V区的突变位点。结果经体外多步法诱导利奈唑胺耐药的不同MIC值金黄色葡萄球菌共20株。除S7系列诱导菌株外,其他系列诱导利奈唑胺耐药的菌株,均出现了克林霉素的交叉耐药,PCR测序分析4株母株均无变异位点,G2505A、U2500A、G2576U、C2610C等V区位点可能与克林霉素交叉耐药相关。结论体外多步法诱导产生的金黄色葡萄球菌利奈唑胺菌株,其与克林霉素交叉耐药的机制与23S r RNA V区的位点突变相关。
- 刘晓军陈重李多云程航邓向斌邓名贵潘伟光杨唯枝王红燕姚伟明邓启文余治健
- 关键词：金黄色葡萄球菌交叉耐药
- 225例肠球菌的临床分布及耐药性分析被引量：1
- 2014年
- 目的了解该院临床分离的肠球菌属的临床分布及对常用抗菌药物的耐药性。方法采用全自动细菌鉴定仪及配套鉴定与药物敏感试验试剂,检测临床分离菌的菌种分布、样本来源和构成比及对常用抗菌药物的耐药性及敏感性,并用WHONET5.4软件进行统计分析。结果 2010—2011年临床共分离到225株肠球菌,泌尿道分离的标本113株(50.2%),临床分布前三位分别是泌尿外科、重症医学科及新生儿科,粪肠球菌比屎肠球菌对大多数的测试药物的耐药率低,但对氯霉素及四环素的耐药率明显的高于屎肠球菌,未发现耐万古霉素及替考拉宁的肠球菌,此次监测发现1株耐利奈唑胺的粪肠球菌。结论不同种类的肠球菌耐药性差别较大,在治疗时,我们需根据药物敏感试验及耐药特点,合理选择抗菌药物治疗,防止出现替考拉宁、万古霉素及利奈唑胺耐药的菌株。
- 杨炯陈重杨晓勇潘伟光余治健马桂红邓启文
- 关键词：肠球菌属粪肠球菌屎肠球菌药敏试验
- 659例金黄色葡萄球菌耐药性分析被引量：1
- 2013年
- 目的了解我院临床分离的金黄色球菌对常用抗菌药物的耐药性,为临床治疗提供依据。方法采用全自动细菌鉴定仪及配套鉴定与药物敏感试验试剂,检测2010年至2011年临床分离的金黄色葡萄球菌,统计金葡菌感染的标本来源、科室分布及耐药率,并用WHONET5.4软件进行统计分析。结果 2010年至2011年临床共分离到659株金黄色葡萄球菌,其中上呼吸道(包括痰和咽拭子)分离的标本544株(82.5%),临床分布前三位分别是儿科、新生儿科及呼吸内科,以上三个科室分离的金黄色葡萄球菌占60.8%,金黄色葡萄球对青霉素耐药率最高(98%),未发现耐万古霉素、替考拉宁及利奈唑胺的金黄色葡萄球菌。结论金葡菌的感染部位以呼吸道、皮肤软组织及血流感染为主,在治疗时,我们需根据药物敏感试验及耐药特点,合理选择抗菌药物治疗,防止出现万古霉素、替考拉宁、利奈唑胺耐药的菌株。
- 杨炯陈重余治健潘伟光邓启文
- 关键词：金黄色葡萄球菌药敏试验抗菌药物
- 深圳南山医院2010年细菌耐药性监测被引量：11
- 2012年
- 目的了解某院2010年临床住院患者送检标本分离菌株对常用抗菌药物的耐药性。方法采用全自动细菌鉴定仪及配套鉴定与药物敏感试验试剂,检测临床分离菌对常用抗菌药物的耐药性,并用WHONET5.4软件进行统计分析。结果 2010年1—12月共分离病原菌2 192株,其中革兰阳性菌占32.03%,革兰阴性菌占67.97%。金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性葡萄球菌中,甲氧西林耐药株(MRSA和MRCNS)分别占19.69%和54.59%。葡萄球菌属中耐甲氧西林株对β-内酰胺类抗生素和其他测试抗菌药物的耐药率显著高于甲氧西林敏感株。MRSA对复方磺胺甲口恶唑、利福平、四环素、庆大霉素的耐药率分别为1.67%、41.54%、44.62%、58.46%;MRCNS对利福平、四环素的耐药率分别为17.27%和36.70%;未发现万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺耐药株。肠球菌属中,粪肠球菌对大多数测试抗菌药物的耐药率低于屎肠球菌;此次监测首次在该院发现1株耐利奈唑胺的粪肠球菌,未发现耐万古霉素菌株。大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌中产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)株分别为44.29%和15.79%。肠杆菌科细菌中产ESBLs株对抗菌药物的耐药率均比非产ESBLs株高。铜绿假单胞菌对亚胺培南和美罗培南的耐药率分别为26.73%和13.79%,不动杆菌属(鲍曼不动杆菌占92.91%)对二者的耐药率分别为31.35%和27.17%。结论细菌耐药性仍呈增长趋势,尤其革兰阴性杆菌;鲍曼不动杆菌及铜绿假单胞菌对碳青霉烯类抗生素耐药性的增加,对临床构成严重威胁。合理选用抗菌药物,及早检测泛耐药菌,加强感染控制措施是当务之急。
- 陈重廉婕潘伟光余治健马桂红邓启文
- 关键词：微生物敏感性试验葡萄球菌属非发酵菌耐甲氧西林超广谱Β-内酰胺酶
- 致婴幼儿腹泻的肠致病性大肠埃希菌血清分型和毒力基因检测被引量：5
- 2013年
- 目的了解引起婴幼儿腹泻的肠致病性大肠埃希菌血清分型情况及其毒力基因携带状况。方法采集2011年6月至2012年2月医院儿科婴幼儿腹泻患者的粪便标本进行大肠埃希菌的分离培养,通过血清凝集试验和细菌生化反应筛选出肠致病性大肠埃希菌,采用多重PCR检测毒力基因escV、bfpA、Stx1和Stx2。结果 503例粪便标本中共分离出47株肠致病性大肠埃希菌,检出率是9.34%。血清分型有9种,最多的血清型是O86:k61,占了阳性菌株的27.66%。毒力基因escV阳性合计22株,bfpB阳性合计17株,检出率分别是46.81%和36.17%,其中,(escV+bfpB)阳性14株,escV阳性8株,bfpB阳性3株,携带毒力基因的菌株阳性率为53.19%,未检出毒力基因Stx1和Stx2。结论肠致病性大肠埃希菌血清学分型与毒力基因携带有差异,有条件的实验室可以直接检测大肠埃希菌的毒力基因,为临床提供更准确的诊断依据。
- 潘伟光李一凡邓启文张健华
- 关键词：肠致病性大肠杆菌腹泻血清毒力
- 利奈唑胺诱导金黄色葡萄球菌耐药株50S核糖体蛋白突变位点分析
- 2015年
- 目的阐明体外诱导利奈唑胺耐药金黄色葡萄球菌的核糖体蛋白位点变异特征。方法收集2株金黄色葡萄球菌质控菌ATCC29213和ATCC25923、1株乳汁来源的金黄色葡萄球菌和1株血流感染的金黄色葡萄球菌(编号分别为S2、S3、S5和S7菌株,均为甲氧西林和利奈唑胺敏感株),通过体外浓度倍增法诱导利奈唑胺耐药;挑取单克隆,经E-test条测定MIC值,获得各菌株的耐药浓度梯度;提取耐药菌株基因组DNA,PCR扩增核糖体蛋白L3和L4(对应rpl C和rpl D基因),扩增产物经测序后与野生株比较,获得核糖体蛋白对应氨基酸的突变位点。结果经体外多步法诱导利奈唑胺耐药的不同MIC值金黄色葡萄球菌共24株。PCR测序分析4株母株均无变异位点,各菌株L3对应的氨基酸位点不尽相同,S2组菌株L4未见统一的氨基酸位点,余S3、S5、S7各组菌株普遍存在Ala56Asp氨基酸位点变异。结论体外多步法可诱导金黄色葡萄球菌利奈唑胺耐药,耐药机制与核糖体蛋白位点突变密切相关,但仍需进一步研究证实突变位点与耐药的关系。
- 刘晓军陈重李多云程航邓向斌邓名贵潘伟光杨唯枝王红燕姚伟明余治健邓启文
- 关键词：金黄色葡萄球菌利奈唑胺耐药
- 2009年深圳地区泌尿生殖道支原体属感染状况及耐药性分析被引量：23
- 2011年
- 目的了解深圳地区支原体属在泌尿生殖道中的感染和对抗菌药物的敏感率。方法使用商品化试剂盒对10 226份临床标本进行支原体属培养、鉴定和药敏试验,并进行统计学分析。结果支原体属培养总阳性率为45.1%,女性支原体属分离率明显高于男性(62.1%vs30.3%),解脲脲支原体(Uu)单一感染(86.2%)显著高于人支原体(Mh)单一感染(1.8%)和两种支原体(Uu+Mh)混合感染(12.0%);Uu、Mh和Uu+Mh对交沙霉素、多西环素、四环素的敏感率均≥80.2%;Uu、Mh和Uu+Mh的耐药谱存在一定差异,Uu对阿奇霉素、红霉素、罗红霉素和克拉霉素的敏感性均≥67.7%,而Mh、Uu+Mh对这4种抗菌药物的敏感性均≤10.3%;喹诺酮类药物的抗菌活性最弱。结论泌尿生殖道感染以Uu为主,女性感染率高于男性,Mh、Uu+Mh分离株多为多药耐药菌株,对泌尿生殖道感染患者应及时进行支原体属培养及药敏试验,指导临床合理用药,以有效提高治愈率和控制耐药菌株的产生。
- 廉婕邓启文潘伟光吴少苑
- 关键词：泌尿生殖道感染支原体属药敏试验
- 一对母婴同时携带的金黄色葡萄球菌同源性分析被引量：3
- 2013年
- 目的分析一对母婴同时携带的金黄色葡萄球菌的同源性,了解金黄色葡萄球菌在母婴之间传播的可能性。方法对分离的3株金黄色葡萄球菌(其中1株分离自受母乳喂养,患有脐炎的新生儿脐分泌物;另2株分别分离自该新生儿健康母亲左右两侧乳房分泌的乳汁)进行药敏试验表型分型和脉冲场凝胶电泳(PFGE)基因分型,分析其同源性。结果此对母婴携带的3株金黄色葡萄球菌对常用抗菌药物的药敏试验结果完全相同,PFGE图谱具有100%的相似度,PFGE结果聚类图处于同一分支。结论此对母婴携带的金黄色葡萄球菌是相同型别菌株,推测金黄色葡萄球菌在母婴之间传播的可能性大。
- 潘伟光陈重邓启文
- 关键词：金黄色葡萄球菌母婴传播脉冲场凝胶电泳同源性
- 全基因测序分析粪肠球菌利奈唑胺耐药相关变异位点的研究被引量：2
- 2015年
- 目的通过全基因组序列研究利奈唑胺敏感株和诱导耐药粪肠球菌之间基因位点差异,分析利奈唑胺耐药相关基因变异位点。方法粪肠球菌ATCC29212菌株用浓度梯度的利奈唑胺进行耐药性诱导,最终获得利奈唑胺耐药的粪肠球菌株LRS29212。提取其总DNA,进行PE(paired end或称双端)测序,采用软件SPAdes进行序列拼接,拼接获得原始scaffold,然后用Gapcloser及GapFiller对scaffold补Gap,采用PrInSeS-G进行序列校正,最终获得全基因组序列。获得的全基因序列与标准株ATCC29212菌株基因组序列(PUBMED公布序列)作比较,获得变异基因位点,并对变异基因功能进行注释。结果通过32代诱导,获得了粪肠球菌LRS29212,其MIC值为128μg/ml;粪肠球菌LRS29212全基因组包含3 010 552碱基对,GC含量37.3%。基因组通过注释后总共有2 918个编码序列(CDS),53个tRNA的编码基因,以及5个完整的rRNA基因编码的操纵子,获得PUBMED全基因序列号(PRJNA257022);总共找出152个SNP,其中错义突变的SNP有24个,包含结合糖ABC转运ATP结合蛋白。结论经LZD诱导成功获得耐LZD粪肠球菌LRS29212菌株,测序分析该菌株存在基因突变位点,为进一步研究LZD耐药机制奠定了基础。
- 陈重李多云程航邓向斌邓名贵潘伟光杨唯枝王红燕姚伟明余治健邓启文
- 关键词：粪肠球菌利奈唑胺全基因组序列
