扈国栋
- 作品数：14 被引量：4H指数：1
- 供职机构：德州学院更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金国家自然科学基金山东省“泰山学者”建设工程项目更多>>
- 相关领域：生物学文化科学医药卫生环境科学与工程更多>>
- 基于石墨烯生物传感器检测鸟嘌呤核糖开关亲和力的方法
- 本发明公开了基于石墨烯生物传感器检测鸟嘌呤核糖开关亲和力的方法，其石墨烯生物传感器由玻璃基底和石墨烯层组成，所述玻璃基底的上表面两侧设有氧化铟锡(ITO)，两侧氧化铟锡的部分上表面被石墨烯层覆盖，一侧未被石墨烯覆盖的部分...
- 许士才田蒙王吉华扈国栋宋瑞洪
- 文献传递
- 一种病毒RNA保护剂及其制备方法与应用
- 本发明提供一种病毒RNA保护剂及其制备方法与应用，属于RNA保护剂制备技术领域。所述病毒RNA保护剂包括以下组分：异硫氰酸胍、十二烷基肌氨酸钠、β‑巯基乙醇、聚乙二醇200、曲拉通X‑100和柠檬酸钠。该保护剂可以对采集...
- 任景李孝文樊铭玉高文超刘健沙玉杰扈国栋于家峰王吉华
- 文献传递
- 计算方法研究HIV-1蛋白酶及其变异与小分子GRL-0519的相互作用
- 2017年
- 艾滋病病毒在世界范围内的传播,严重地威胁到人们的身心健康.HIV-1蛋白酶的残基变异严重地削弱了药物的治疗效果.为了研究残基变异D30N、I54M和V82A对蛋白酶结合抑制剂GRL-0519的影响,本研究进行了4个30 ns的分子动力学(MD)模拟,并采用溶解相互自由能(SIE)方法计算了蛋白酶和抑制剂的结合能.计算结果表明,极性相互作用不利于变异的蛋白酶结合抑制剂,而对于野生型的蛋白酶(WT),极性相互作用有微弱的贡献,极性相互作用是残基变异抗药性的主要原因,计算得到的总结合能与实验的数据一致.为了说明每个残基在抗药性中的贡献,采用分子力场的方法计算了每一个残基与小分子作用的范德华作用能,并分析了抑制剂与蛋白酶形成的氢键.范德华作用分析表明,V82A残基变异对结合模式的影响较小,相对于WT,D30N有5个残基的范德华贡献差异大于0.4 kcal/mol,I54M残基变异的蛋白酶有6个残基.氢键的分析说明,D30N和I54M变异丢失了几个氢键;范德华作用和氢键的分析结果与SIE的计算结果一致.研究结果为设计新的更有效的抗HIV-1蛋白酶变异的抑制剂提供了理论指导.
- 李高峰扈国栋扈国栋季保华张晨
- 关键词：抑制剂分子动力学模拟
- 一种石墨烯核酸生物传感器、其制备方法及应用
- 本公开属于核酸生物传感器技术领域，具体涉及一种石墨烯核酸生物传感器、其制备方法及应用。本公开提供了一种改进后的石墨烯的核酸生物传感器，所述核酸传感器采用Ag/AgCl作为栅极(G)，氧化铟锡(ITO)作为源极(S)及漏极...
- 许士才田蒙扈国栋王吉华王铁军刘国锋宋瑞洪李迎仙刘建建
- 文献传递
- 长非编码RNA NRAV在泛癌中的表达和功能研究
- 2024年
- LncRNA NRAV是近年来新发现的lncRNA分子,仅少数研究显示其表达水平与肺癌、胰腺导管腺癌的发展紧密相关,但NRAV在其它癌症中的表达情况和功能尚不清晰。通过生物信息学的方法分析NRAV在不同癌症中的差异表达情况及其与癌症患者生存期的关系,并以肝细胞癌(LIHC)作为重点研究对象,基于转录组数据筛选与NRAV共表达的mRNA并进行GO和KEGG功能富集分析,探究NRAV在LIHC中的调控机制与功能。结果显示,NRAV在7种癌症与癌旁组织中差异表达显著,其表达量与5种癌症患者的总生存期以及4种癌症患者的无病生存期显著相关。另外,筛选出的479个共表达靶基因主要富集在DNA修复、蛋白质结合、细胞周期等通路上。该文为进一步了解NRAV与泛癌尤其是肝细胞癌的发生发展关系提供初步依据。
- 黄平平李若冰胡维博单亚男许梦阳周百灵扈国栋
- 关键词：肝细胞癌分子机制
- DSS1对蛋白质PCID2构象稳定性影响的分子动力学研究
- 2014年
- PCID2和DSS1是TREX2复合体中的成分,DSS1作为子复合体之间的粘合剂在复合体中主要与PCID2结合.研究发现,DSS1在复合体中起稳定PCID2的作用.利用分子动力学模拟研究无序蛋白DSS1与PCID2的相互作用,结果表明:未结合DSS1的单体PCID2蛋白构象不稳定,与DSS1结合后的PCID2蛋白构象明显变得更稳定,特别是与DSS1结合处的构象,与实验得出的结论一致.研究DSS1对PCID2的作用,不仅可以为了解PCI蛋白提供分子基础,也为深入了解TREX复合体在核酸输出中的功能提供帮助.
- 刘倩君扈国栋王吉华
- 关键词：分子动力学模拟构象变化
- 一种植物根际促生菌芽孢杆菌Lzh-5及其应用
- 本发明涉及一种植物根际促生菌芽孢杆菌Lzh‑5及其应用，植物根际促生菌芽孢杆菌Lzh‑5，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.13487，保藏日期为2016年12月23日。保藏机...
- 李正华展彬王金涛杜绍国宋峰王吉华曾强成周耀旗于家峰扈国栋
- 文献传递
- 一株蜡样芽胞杆菌Lzh-X7及其应用
- 本发明涉及一种蜡样芽胞杆菌Lzh‑X7及其应用，蜡样芽胞杆菌Lzh‑X7的保藏编号为CGMCC No.13488，保藏单位为中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏日期为2016年12月23日，分类命名为蜡样芽胞...
- 李正华王吉华付莹冉昆孙晓莉宋峰曾强成周耀旗于家峰扈国栋张晓飞孙云龙李刻秦师晓喆
- 文献传递
- 基于成果导向教育的嵌入式系统课程教学设计被引量：4
- 2018年
- 分析了目前嵌入式课程教学过程中存在的问题,结合我校的实际情况,运用成果导向的教育理念,考虑嵌入式课程的综合性和应用性特点,系统总结了我们在课程教学目标、理论课的内容设置、实验课的组织实施和课程考核方面的成功经验。本论文的内容对其他从事嵌入式教学或者是以应用为目标的课程教学设计具有很好的借鉴意义。
- 扈国栋栗军刘汉平
- 关键词：嵌入式系统教学设计
- 分子动力学模拟研究NCBD与TAD相互作用的构象变化
- 2016年
- P53是固有无序蛋白,在细胞信号转导网络中,起着非常重要的作用,它能引导细胞的降解死亡等.P53和CBP是多位点结合,其中P53的TAD的结构域与CBP的NCBD结构域之间的结合,对P53与DNA形成四聚体起到关键的作用.对apo-TAD,apo-NCBD和复合物进行了500ns分子动力学模拟,分析了三个体系的Cα原子的均方根偏差(RMSD)和均方根涨落(RMSF)以及回旋半径(Rg).分析结果表明复合物比apo-TAD和apo-NCBD单体更稳定,尤其是结合位点附近的残基.
- 梁涛马爱静扈国栋王吉华
- 关键词：P53蛋白分子动力学模拟构象变化
