陈佩珍
- 作品数：13 被引量：32H指数：4
- 供职机构：南京林业大学更多>>
- 发文基金：江苏高校优势学科建设工程资助项目江苏高校优势学科建设工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 珍珠黄杨BsGAI1基因的克隆及实时定量表达分析被引量：2
- 2016年
- DELLA蛋白是赤霉素信号传导通路中一类重要的负调节因子。本研究以珍珠黄杨叶片为试材,利用PCR技术和RACE技术克隆得到珍珠黄杨DELLA蛋白基因Bs GAI1。其c DNA全长2 576 bp,包括1 884 bp完整的ORF,能够编码含有627个氨基酸的蛋白。同时,蛋白相对分子质量为67.39 k D,等电点(p I)为4.99,并且总亲水性平均数为-0.162,预测该蛋白为亲水性蛋白。生物信息学研究表明,Bs GAI1编码蛋白具有DELLA蛋白的典型结构域。实时荧光定量表达分析表明,Bs GAI1基因在珍珠黄杨根、叶、茎和花中都有一定的表达,在根中表达量最低,茎中表达量最高。研究说明,Bs GAI1基因可能在珍珠黄杨茎节间缩短导致矮化的过程中扮演重要角色。
- 黄昊宫铭殳晓强陈佩珍吴晓刚韦蔷季孔庶
- 关键词：珍珠黄杨DELLA蛋白
- 一种马尾松PmCOMT基因的应用
- 本发明公开了一种马尾松PmCOMT基因的应用，属于植物基因工程技术领域。本发明为首次利用马尾松PmCOMT基因定向促进植物中S木质素单体合成，通过构建含有马尾松PmCOMT基因的载体并将其转化到农杆菌感受态细胞中，再侵染...
- 季孔庶吴晓刚朱沛煌吴帆陈佩珍
- 文献传递
- 马尾松PmSnRK2.3基因的克隆与实时荧光定量表达分析被引量：3
- 2018年
- 蔗糖非发酵相关蛋白激酶在植物胁迫应答过程中起着重要的作用。本研究以拟南芥SnRK2基因家族为材料,检索本实验室马尾松转录组数据库,获得一条马尾松SnRK2基因,经同源比对命名其为PmSnRK2.3。PmSnRK2.3基因的ORF全长1 089 bp,编码362个氨基酸,蛋白相对分子质量为40.86 kD,理论等电点(p I)为4.96,总亲水性平均数为-0.330,预测该蛋白为亲水蛋白。生物信息学研究表明,PmSnRK2.3具有典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶保守结构域和多处磷酸化位点。另外,实时荧光定量结果表明SnRK2.3基因在马尾松中的表达存在组织差异性,在叶中表达量最高,根中最低;经过ABA和PEG胁迫后的马尾松幼苗PmSnRK2.3基因表达量总体高于对照组,并在24 h内表现出一定的波动。研究表明,SnRK2.3基因在出现干旱和ABA胁迫时表达量上调,很可能在马尾松抗旱性能方面起着一定的作用。
- 韦蔷季子钧宫铭黄昊陈佩珍吴晓刚季孔庶
- 关键词：马尾松PMSN基因克隆生物信息学分析实时荧光定量
- 马尾松PmAOX基因克隆与不同逆境胁迫表达分析被引量：4
- 2020年
- 【目的】揭示马尾松(Pinus massoniana)抗氰呼吸途径的交替氧化酶(alternative oxidase,AOX)基因的功能。【方法】提取15年生马尾松不同组织RNA,运用RT-PCR及RACE技术克隆基因全长。以基因组DNA为模板,利用染色体步移法(chromosome walking,CK)克隆目的基因的启动子区域。通过qRT-PCR技术分析目的基因在不同组织及逆境胁迫下的表达。【结果】克隆获得基因全长为1 610 bp,开放阅读框(open reading finder,ORF)1 221 bp,编码406个氨基酸,推测氨基酸含有与拟南芥At AOX基因相同的双铁羧酸结构LET、NERMHL、LEEA和RADEH,将其命名为PmAOX。实时荧光定量PCR显示,PmAOX在马尾松花中表达量最高,根中最低;脱落酸(abscisic acid,ABA)(100μmol/L)胁迫后表达量逐渐下降,持续胁迫至24 h时,表达量增加至最大;经高温(42℃)、H2O2、NaCl(200 mol/L)、CO2(0.08%~0.10%)、低温(4℃)及干旱(10%PEG6000)处理后,表达量均呈现先升高后降低的趋势;高温42℃处理至3 h时表达量最高;H2O2处理4 h时,表达量最高;NaCl胁迫至6 h时,表达量最高;CO2、低温及干旱处理至12 h时,表达量最高。克隆得到PmAOX起始密码子上游1 081bp的启动子区域,经PlantCARE分析显示PmAOX启动子区域具有CAAT-box及TATA-box的基本顺式作用元件和低温、干旱等多个胁迫诱导元件,同时还包括脱落酸、茉莉酸甲酯、赤霉素、水杨酸在内的激素调控元件和光及昼夜节律响应元件。【结论】PmAOX可能与马尾松抗逆性相关,并受激素的诱导和调控。
- 孙晓波陈佩珍吴晓刚吴帆季孔庶
- 关键词：马尾松基因克隆逆境胁迫荧光定量启动子
- 马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析被引量：7
- 2019年
- 在木质素生物合成里,咖啡酸-O-甲基转移酶(caffeic acid-O-methyltransferase, COMT)起重要作用。本论文以马尾松幼苗作为材料,并通过PCR技术以及RACE技术从马尾松材料中克隆出Pm COMT基因的cDNA全长。该cDNA全长为1660bp,其中预测完整ORF全长为1125bp,可编码374个氨基酸的蛋白。蛋白相对分子质量为41.81 kD;等电点(pI)为5.03,总平均亲水性为-0.311。通过生物信息学的方法对其进行分析表明,Pm COMT基因具有典型的甲基转移酶的保守结构域。通过实时荧光定量表达分析表明,COMT基因在马尾松的不同组织均有表达,其中在新梢中的表达量最高,树皮中表达量最低。
- 吴晓刚陈佩珍韦蔷武星季孔庶
- 关键词：马尾松基因克隆
- 马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析
- 马尾松具有良好的纤维结构,在我国常作为制作高级纸张的纸浆材。在造纸产业中,木质素在生产过程中难以去除,产生大量废液,废液中的主要污染物就是木质素,木质素对生产出的纸张质量有很大影响。因此,了解马尾松木质素的生物合成途径有...
- 吴晓刚陈佩珍韦蔷武星季孔庶
- 关键词：马尾松基因克隆
- 文献传递
- 马尾松PmCOMT基因的克隆及实时定量表达分析
- 马尾松具有良好的纤维结构,在我国常作为制作高级纸张的纸浆材.在造纸产业中,木质素在生产过程中难以去除,产生大量废液,废液中的主要污染物就是木质素,木质素对生产出的纸张质量有很大影响.因此,了解马尾松木质素的生物合成途径有...
- 吴晓刚陈佩珍韦蔷武星季孔庶
- 关键词：马尾松基因克隆
- 马尾松PmPIN2基因的克隆及实时定量分析被引量：2
- 2018年
- PIN2基因在植物生根机理中起关键作用,对马尾松PIN2基因进行研究,可为解决马尾松无性系生根困难、促根壮苗培育提供帮助。本研究以马尾松幼苗全株为试材,利用PCR技术和RACE技术克隆了马尾松PIN2基因全长,并通过相关软件和实时荧光定量进行生物信息学和组织特异性分析。结果发现PIN2基因全长3 706 bp,包括2 103 bp完整ORF序列,编码700个氨基酸。生物信息学分析表明,PIN2蛋白为疏水性蛋白,相对分子量76.43 k D,等电点(p I)为9.06,总亲水性平均数0.023,PmPIN2编码的蛋白与PIN家族具有同样典型结构域。实时荧光定量分析结果显示,PmPIN2基因在马尾松根、茎、叶、花中均有表达,其中根中的表达量最高,花中最低。PIN2基因是参与植物生根过程的重要基因,对马尾松PmPIN2基因的研究为PIN基因家族在生根机制方面的作用探究提供帮助。
- 武星季子钧吴晓刚陈佩珍吴帆孙晓波季孔庶
- 关键词：马尾松
- 马尾松NAC转录因子基因PmNAC8的克隆及表达分析被引量：3
- 2022年
- NAC(NAM,ATAF1/2,CUC2)家族基因参与调控植物生长发育、响应非生物胁迫及激素信号转导。研究马尾松中NAC转录因子在非生物胁迫中的应答,为阐明基因功能提供理论依据。以马尾松(Pinus massoniana)为试验材料,通过RTPCR及RACE技术克隆一个NAC家族基因,并对其进行生物信息学分析。运用qRT-PCR检测其组织表达特性及对逆境胁迫的响应情况;以基因组DNA为模板,运用染色体步移(genome walking)技术克隆该基因上游启动子序列;通过农杆菌注射本氏烟草(Nicotiana benthamiana),观察其亚细胞定位。该基因全长1726 bp,开放阅读框为1209 bp,编码402个氨基酸,将其命名为PmNAC8,GenBank登录号为MZ291447;亚细胞定位结果显示,该基因定位于细胞核;其密码子使用偏性较弱,偏好使用A/T结尾的密码子,且烟草与酵母更适合作为PmNAC8的异源表达受体;qRT-PCR显示PmNAC8在根部表达量最高,且受机械损伤及植物激素GA、ABA的诱导;克隆获得PmNAC8上游1492 bp的启动子区域,含有多个胁迫诱导元件、赤霉素调控元件和光响应元件。PmNAC8参与多种逆境胁迫,可能在赤霉素信号途径中发挥重要作用。
- 镐青青姚圣刘佳禾陈佩珍张梦洋季孔庶
- 关键词：马尾松NAC密码子偏性亚细胞定位非生物胁迫
- 马尾松PmAP2/ERF基因及其表达蛋白和应用
- 本发明公开了马尾松PmAP2/ERF基因及其表达蛋白和应用，属于植物基因工程技术领域。本发明的马尾松PmAP2/ERF基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明以马尾松...
- 王登宝季孔庶张金凤姚圣陈佩珍镐青青
