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司同
作品数:
4
被引量:10
H指数:1
供职机构:
中国科学院
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相关领域:
生物学
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合作作者
蒙海林
中国科学院深圳先进技术研究院
刘陈立
中国科学院深圳先进技术研究院
乔宇
中国科学院深圳先进技术研究院
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作者
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司同
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乔宇
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刘陈立
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蒙海林
传媒
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1篇
2022
1篇
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面向合成生物学的机器学习方法及应用
被引量:10
2021年
机器学习的目标是设计可以根据先验知识和观测数据不断改进其性能的算法.该算法可以帮助机器从大量的数据中提取知识,从而提升其在特定任务上的性能.作为数据驱动的方法,机器学习可以有效利用高通量实验技术产生的大批量生物数据,实现合成生物体的功能预测与智能化设计,改变合成生物学的研究范式.本文首先介绍机器学习在合成生物学领域广泛应用的几个模型及方法,如支持向量机、神经网络、生成式对抗网络、深度强化学习等.然后介绍机器学习方法在合成生物学领域的典型应用,如启动子预测、酶催化设计、代谢途径构建、基因线路设计等.本文综述面向合成生物学的机器学习方法及应用,并试图启发读者如何选择和设计机器学习方法用于合成生物学的研究.
胡如云
张嵩亚
蒙海林
余函
张建志
罗小舟
司同
刘陈立
司同
关键词:
合成生物学
羊毛硫抗生素高通量筛选方法
本发明提供了一种羊毛硫抗生素高通量筛选方法,该方法包括:构建羊毛硫肽定点饱和突变文库,并提取质粒转化表达菌株,获得突变体;利用自动化平台对所有突变体进行抑菌活性表征及样品检测;其中,所述进行抑菌活性表征包括通过抑菌法获得...
司同
郭二鹏
张雅婷
付立豪
张建志
陈永灿
张智彧
一种自动化微生物涂布的装置和方法
本发明属于微生物涂布技术领域,公开一种动化微生物涂布的装置和方法;所述装置,包括:涂布棒;涂布棒包括相互配合的涂布杆和套筒;套筒包括相互连接的套筒主体和夹取部;夹取部设置于套筒主体的上端;夹取部的直径大于套筒主体的直径;...
张智彧
司同
蓝云泉
庞任维
一种自动化微生物涂布的装置和方法
本发明属于微生物涂布技术领域,公开一种动化微生物涂布的装置和方法;所述装置,包括:涂布棒;涂布棒包括相互配合的涂布杆和套筒;套筒包括相互连接的套筒主体和夹取部;夹取部设置于套筒主体的上端;夹取部的直径大于套筒主体的直径;...
张智彧
司同
蓝云泉
庞任维
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