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一种与绿鳍马面鲀生长性状相关的SNP分子标记及其应用: 本发明公开了一种与绿鳍马面鲀生长性状相关的SNP分子标记，其位于绿鳍马面鲀5号染色体的第896561位碱基处，其突变类型为A/G，命名为Chr5:896561A>G；所述生长性状为包括体重、体长和体高，其中，AA基...; 张晋石琼张凯卞超

基于肠道宏基因组对弹涂鱼两栖适应性的研究被引量：1: 2022年; 【目的】从基因组水平上报道两种有代表性的两栖鱼类大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris,BP)和大鳍弹涂鱼(Periophthalmus magnuspinnatus,PM)对陆地生活的适应性,以揭示胃肠道微生物群对弹涂鱼在陆地生活的适应性及其特殊免疫力具有关键作用。【方法】采用16S扩增子测序和宏基因组技术,利用两种有代表性的弹涂鱼和3种典型水生鱼类(草鱼Ctenopharyngodon idellus、鲢鱼Hypophthalmichthys molitrix和鳙鱼Aristichthys nobilis)的宏基因组数据,比较两栖鱼类和水生鱼类肠道的微生物组成、多样性、丰度和功能,并研究潜在陆生标志微生物群。此外,通过查阅大量文献得到具有代表性的海水鱼类、淡水鱼类、两栖动物和陆生动物的胃肠道微生物群数据,比较弹涂鱼的肠道菌群组成和功能。【结果】在弹涂鱼的胃肠道微生物群中,厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和梭杆菌门占主导地位。这些菌的含量在大鳍弹涂鱼、大弹涂鱼和水生鱼类之间存在显著差异。草鲢鳙和弹涂鱼二者胃肠道微生物群之间最大的区别是CKC4门(一种推测与宿主脂质代谢相关的胃肠道细菌门类)的比例,草鲢鳙中该比例从4%~27%不等,而在弹涂鱼中则没有发现。此外,弹涂鱼的胃肠道微生物群中同时具有陆生动物、淡水和海水鱼类以及两栖动物的典型细菌家族,这与它们在水陆过渡咸淡水交界处的生活特征相吻合。与陆生动物相比,鱼类拥有更高比例的梭状杆菌和变形杆菌,而陆生动物则具有更多的拟杆菌。在大弹涂鱼和大鳍弹涂鱼中还发现了此前被认为仅存在于陆生动物的S24-7菌株。【结论】推测弹涂鱼胃肠道微生物群落相比水生性鱼类具有复合和多样性特征,可以通过病原体相关分子模式PAMP刺激宿主在进化中形成多样性更高、拷贝数更多的天然免疫受体基因家族,以此适应更为复杂的两栖生活环境。; 董博邓涵逸孙艺秋房元杰彭淼曦石琼石琼魏文康陈庄; 关键词：宏基因组学

中国正式启动水产生物“十百千”组学育种计划: 2017年; 2016年6月17日,中国水产科学研究院（Chinese Academy of Fishery Sciences,CAFS）和深圳华大水产科技有限公司（Shenzhen BGI Fisheries Sci＆Tech Co.Ltd.;BGI Fisheries）在中国深圳揭牌成立＂水产生物基因组研究中心＂,正式启动中国水产生物＂十百千＂组学育种计划（the China Aquatic 10-100-1000 Genomics Program,以下简称＂十百千＂计划）,; 刘英杰徐跑徐军民黄玉刘永新方辉胡隐昌游欣欣卞超孙敏顾若波崔利锋张显良徐鹏石琼; 关键词：水产生物育种计划水产科技日本沼虾基因组研究

一种与绿鳍马面鲀生长性状相关的SNP分子标记及其应用: 本发明公开了一种与绿鳍马面鲀生长性状相关的SNP分子标记，其位于绿鳍马面鲀5号染色体的第896561位碱基处，其突变类型为A/G，命名为Chr5:896561A>G；所述生长性状为包括体重、体长和体高，其中，AA基...; 张晋石琼张凯卞超

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石琼

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