孟飞
- 作品数:6 被引量:32H指数:3
- 供职机构:杭州致远医学检验所有限公司更多>>
- 发文基金:浙江省公益性技术应用研究计划项目浙江省医药卫生科学研究基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 多部位胃黏膜联合取样在幽门螺杆菌培养中的应用价值被引量:8
- 2017年
- 目的评价胃镜下多部位联合取样对幽门螺杆菌(HP)培养鉴定的价值。方法2014年8月至2015年5月间,258例有上消化道症状的患者,经13C尿素呼气试验后,分别在胃镜下进行胃窦小弯(A)、胃窦大弯(B)、胃角(C)和胃体(D)这4个部位的胃黏膜组织取样,通过体外HP培养鉴定试验,采用Nemenyi检验对比分析多部位联合取样与单部位取样两种模式下对刖,阳性率的影响。结果13C尿素呼气试验与HP分离培养的结果一致性达82.56%。除胃体外,其他单部位取样在HP阳性率上与两部位联合取样差异均存在统计学意义(P〈0.05)。单部位与3个部位联合取样在刎,阳性率上差异均有统计学意义(P〈0.05)。两部位联合取样胃窦小弯和胃体,胃角和胃体,胃窦大弯和胃体的联合取样与任意3部位联合取样差异无统计学意义(P〉0.05)。结论相比单部位取样和3部位取样,胃镜下胃窦小弯和胃体胃黏膜的联合取样在HP培养中的性价比最高。
- 王教常黄达栋徐贤坐林敏刘秋香杨宁敏孟飞吴建胜
- 关键词:幽门螺杆菌胃黏膜
- 台州地区幽门螺杆菌主要抗生素耐药趋势七年调查研究被引量:13
- 2018年
- 幽门螺杆菌(HP)对抗生素耐药受多种因素的影响,不同地区HP对不同抗生素的耐药率都有明显差异。此外,不同人群年龄段的健康状况、抗生素用药背景、临床合并用药副作用等因素,也会对不同年龄段的抗生素耐药造成影响。浙江省台州地区属于一类典型的低HP根除率地区,本研究对2009年至2017年该地区8个县(区)的抗生素耐药情况及不同性别、年龄段间的抗生素耐药情况进行了回顾性统计分析,旨在为临床医生、医疗管理和卫生决策部门提供最有利的数据支持。
- 章月桃黎宏章郑秀云刘珍珍李东汤清清孟飞叶丽萍
- 关键词:抗生素耐药幽门螺杆菌耐药趋势回顾性统计分析用药副作用HP根除率
- 基于全基因组测序对双重耐药幽门螺杆菌外排泵基因变异的研究
- 2021年
- 背景世界上50%以上的人口感染幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori).随着抗生素的广泛使用,抗生素耐药成为H.pylori感染患者根除失败的主要原因.目前有不少研究报道外排泵基因过表达和耐药的产生相关.目的为了未来的H.pylori感染治疗有更多方法,探索外排泵基因的变异与双重耐药菌株耐药性产生的内在联系.方法使用^(13)C呼气试验及药物敏感试验进行双重耐药菌株及敏感菌株的筛选,用特异性PCR的常规方法进行耐药基因突变位点的验证,基于MiSeq平台,对10例临床菌株进行全基因组测序,以鉴定双重耐药表型与敏感表型的外排泵基因的单核苷酸变体(single nucleotide variants,SNV)并分析,参考菌株使用ATCC26695.结果H.pylori药敏试验结果显示,丽水地区H.pylori对克拉霉素及左氧氟沙星都具有较高的耐药率.采用特异性PCR法在5株临床双重耐药菌株中检测到23S rRNA基因及gyrA的点突变,在5株临床敏感菌株中未检测到.全基因测序检测了涉及多耐药性的TolC同源物的四个基因簇(HP0605-HP0607,HP0971-HP0969,HP1327-HP1329和HP1489-HP1487)的遗传变异.在双重耐药性H.pylori菌株中发现一个突变的SNV.结论丽水地区抗生素使用应严格监控,避免滥用.TolC同源基因的基因簇与H.pylori菌株的抗生素耐药性相关.全基因组测序对基因型与表型的关系有了新的认识.
- 叶淑芳张剑美代飞蓝陈菊章小君周丽珍汤清清孟飞
- 关键词:幽门螺杆菌全基因组测序外排泵基因
- 幽门螺杆菌毒力基因与克拉霉素耐药基因突变相关性被引量:3
- 2018年
- 目的分析浙江省台州地区幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)cag A和Vac A为主的毒力基因型分布,探讨其与克拉霉素耐药基因突变类型的关系。方法招募存在上消化道症状患者,并行胃镜检查活检患者胃黏膜组织。通过Hp分离培养方法,培养出216株Hp。采用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测并分析cag A和Vac A的分型情况。采用PCR扩增和Sanger测序技术检测克拉霉素耐药基因(23S rRNA)2142和2143位碱基点突变情况。结果 Cag A基因的阳性检出率为99.54%(215/216),其中Cag A-D为95.83%(207/216)、Cag A-C为3.70%(8/216)。Vac A基因阳性检出率为97.22%(210/216),s1、s2、m1、m2亚型分别为97.22%(210/216)、0、35.19%(76/216)、60.65%(131/216)。本研究发现,浙江省台州地区毒力基因以Cag A-D和Vac As1m2型为优势基因型。此外,23S rRNA基因2142和2143位点均未突变的有93株。突变的有123株,其中A2142G位点突变4株、A2143G位点突变119株。毒力基因型与23S rRNA基因2142和2143位点突变类型无相关性(P>0.05)。结论台州地区为HP高毒力地区,且以Cag A-D和Vac As1m2型为主,其分布与克拉霉素耐药基因突变无密切相关性。
- 章月桃陈伟燕朱临江刘云惠孟飞
- 关键词:幽门螺杆菌毒力基因
- 幽门螺杆菌临床抗生素耐药表型与基因突变检测的比较研究被引量:8
- 2018年
- 幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)是许多消化道疾病的病因,因此在治疗此类疾病时根除HP感染具有重要意义。但是,HP的根除受许多因素影响,其中最主要的原因是细菌的耐药性,因此合理的使用抗生素是根除HP的重要保证。目前HP的耐药性检测主要通过药敏试验完成,包括琼脂稀释法和E-Test法。但是这2种方法对实验室培养具有较高要求且培养周期较长。研究表明,克拉霉素耐药主要是由于23S rRNA基因的2142或2143位突变导致的,左氧氟沙星耐药主要是由gyrA基因编码的蛋白在87、88、91和97突变导致的。本研究通过比较DNA测序得出的HP耐药性(基因型)与药敏试验得出的耐药性(表型)的差异,探讨HP耐药性检测的准确性。
- 季雪良叶丽萍孟飞杨宁敏黄智铭
- 关键词:RRNA基因幽门螺杆菌耐药表型抗生素耐药性检测E-TEST法
- 不同浓度乙型肝炎病毒全基因组高通量测序方法的建立及其应用被引量:3
- 2018年
- 目的建立一种适用于不同浓度乙型肝炎病毒(hepatitis B Virus, HBV)的全基因组高通量测序方法。方法分别采用HBV病毒核酸直接建库方法及巢式PCR扩增建库方法,对含高、中、低HBV拷贝的3个血浆样本进行文库构建。通过Illumina Miseq平台对HBV全基因组进行高通量测序。结果基于两种不同建库方法获得数据产量差异巨大。HBV病毒核酸直接建库方法只有很少数据可以匹配到HBV基因组。巢式PCR扩增能够成功扩增出HBV全基因组,文库经高通量测序后,HBV基因组匹配率接近80%,且样本覆盖度和深度不受HBV浓度影响。3个不同浓度HBV样本共发现27个宿主内单核苷酸突变(intra-host single nucleotide variations, iSNVs),其中13个是低频突变。逆转录(reverse transcription, RT)区域的突变出现在低拷贝数和中等拷贝数样品中,而在高拷贝数样品中没有发现。结论本研究建立的巢式PCR扩增结合高通量测序对HBV全基因组测序的方法,不仅可以快速准确的检测HBV感染,还可以发现低拷贝样品中整个HBV基因组的突变。
- 王贤军刘云惠孟飞杨宁敏
- 关键词:肝炎病毒乙型基因组聚合酶链式反应高通量测序