张春凤
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：北京大学医学部基础医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 抗癌生物活性肽对BGC-823细胞基因表达的影响被引量：1
- 2010年
- 目的:利用基因芯片技术分析一种新型抗癌生物制剂-抗癌生物活性肽对人胃癌BGC-823细胞的基因表达谱调控的影响,并对部分差异表达基因进行RT-PCR检测,从而验证芯片的有效性。方法:订制表达谱芯片,分别将400条和648条人类基因的PCR产物点样于特殊处理后的玻璃片上制备基因表达谱芯片。以加入不同浓度抗癌生物活性肽及处理不同时间的BGC-823细胞为实验组,以生理盐水处理的BGC-823细胞作为对照组,当确定最佳作用时间及抗癌生物活性肽有效作用浓度后,分别提取实验组与对照组细胞的总RNA,反转录成cDNA,以两种荧光素Cy5和Cy3标记后作为探针,与制备好的表达谱芯片进行杂交,以生物信息学方法进行数据的处理和分析,并将其中的差异表达基因p15和HSP701B进行RT-PCR的验证。结果:两张芯片上差异表达的基因共47个,其中上调27个,下调20个。这些基因按照功能分类涉及细胞周期、代谢酶、免疫相关、细胞凋亡、抑癌基因等类别,包括HSP701B、HSP75、HSP90、磷脂酶D2(PLD2)、凋亡抑制基因(IEX-1L)、人类杆状病毒IAP重复序列3、E2泛素耦联酶Ubch5c、人类缺氧诱导因子1α亚基、γ-干扰素、TNF诱导因子、人类黑色素瘤抗原p15基因等。同时RT-pCR结果验证了芯片的检测的有效性。结论:抗癌生物活性肽具有调控人胃癌BGC-823细胞基因表达的作用,其中对抑癌基因、热休克蛋白家族基因等有较明显的影响;基因芯片可以为阐明抗癌药物的作用机制提供有力的分子基础。
- 张春凤贾淑芹苏秀兰
- 关键词：基因芯片表达谱胃癌
