李妮
- 作品数:3 被引量:41H指数:2
- 供职机构:湖北中医药大学更多>>
- 发文基金:国际科技合作与交流专项项目卫生行业科研专项卫生部卫生公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>
- 葫芦科和景天属植物的DNA条形码通用序列研究
- 目的:评价几个热点DNA条形码候选序列对葫芦科、景天属植物的鉴别能力。 方法:使用ITS2.rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对葫芦科、景天属植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、...
- 李妮
- 关键词:DNA条形码葫芦科景天属PSBA-TRNHRBCL
- 文献传递网络资源链接
- 葫芦科植物通用DNA条形码的筛选被引量:26
- 2011年
- 目的评价几个热点DNA条形码候选序列对葫芦科植物的鉴别能力。方法使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对葫芦科植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、种内和种间的变异、barcodinggap,并采取相似性探索BLAST 1和最近距离Nearest Distance方法评价不同序列的鉴别能力。结果 ITS2序列对葫芦科33个属、90个物种、182个样本进行分析,其鉴定成功率较高,在属水平为100.0%,在物种水平为88.5%;psbA-trnH序列对201个样本进行分析,其鉴定成功率在属水平为93.0%,在物种水平为73.1%,但其可以补充部分ITS2不能分析的物种区域。结论 ITS2和psbA-trnH是适合葫芦科植物鉴别的一个较好的DNA条形码序列组合。
- 李妮陈士林刘义梅陈科力
- 关键词:DNA条形码葫芦科PSBA-TRNHMATKRBCLITS2
- 景天属药用植物DNA条形码研究被引量:16
- 2010年
- 目的:评价DNA条形码候选序列对景天属药用植物及其混伪品的鉴别能力,探索景天属药用植物鉴定的新方法。方法:使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对景天属药用植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增效率、种内和种间变异的显著性,以及Barcoding gap,采取BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力。结果:ITS2序列在采集的景天属几种药用植物中扩增成功率为100%,其种内种间变异差异、Barcoding Gap较psbA-trnH、rbcL序列具有更明显的优势,而且纳入网上48个样品33个种的数据后鉴定成功率仍达到100%。结论:ITS2序列能够准确鉴定景天属药用植物,并将其与常见混伪品区别开,ITS2可推荐为景天属首选的DNA条形码序列。
- 李妮陈科力刘震叶丛进陈士林
- 关键词:DNA条形码景天属ITS2药用植物