公共文化服务平台

徐俊: 作品数：30 被引量：120H指数：6; 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学天文地球医药卫生水利工程更多>>

合作作者

基于流场、声源场、声场精细分析的水动力声学研究: 水动力噪声是由不定常、不均匀水流场引起的水中传播的声压脉动，由流体流动过程中的相互作用和流体与固体边界的相互作用而产生。水动力噪声是舰船等水中航行体的水下辐射噪声和自噪声的主要来源之一。降低水动力噪声对水域声学环境保护，...; 徐俊; 文献传递

康氏菌科海洋细菌的系统发育与代谢潜能研究进展: 2021年; 康氏菌科(Kangillaceae)是海洋螺杆菌目(Oceanosprillales)下的科级分类单元,包含康氏菌属(Kangiella)、异康氏菌属(Aliikangiella)和Pleionea三个属。在康氏菌属高度精简的基因组中存在异常丰富的胞外蛋白酶编码基因,暗示此类海洋细菌对海洋颗粒有机物中的蛋白质成分降解具有重要贡献。鉴于已分离鉴定的康氏菌属模式菌株专一性利用蛋白类营养物质,我们建议将该属译为"食朊菌属"。本文将结合本实验室的研究进展,对康氏菌科细菌的分离培养过程、系统发育关系、代谢特点和潜在生态功能进行综述,为研究此类海洋细菌的生理生态功能提供思路。; 王佳华弋伊徐俊; 关键词：胞外蛋白酶海洋细菌

南海北部陆坡真光层海水中古菌的多样性被引量：2: 2017年; 选取中国南海北部陆坡真光层水柱中3个不同深度海水样本,采用荧光实时定量PCR技术、16S rRNA基因克隆文库方法以及系统发育分析,对近表层(SCS-S,水深30 m)、叶绿素最大层(SCS-M,水深65 m)、真光层和暮光层分界点(SCS-B,水深200 m)水层中古菌的多样性组成进行调查.结果表明,3个水层中的古菌16S r RNA基因拷贝数的数量关系为SCS-M层>SCS-B层>SCS-S层,分别为(4.49±0.01)×10~5、(3.37±0.02)×10~4、(9.70±0.10)×10~3copies/L.3个水层中的古菌由广古菌门(Euryarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)两个门构成.在30 m水层和65 m水层中,广古菌门的古菌占大多数;在200 m水层,奇古菌门约占85%.30 m和65 m水层中的广古菌门以Marine GroupⅡ为主,200 m水层中的奇古菌门以Marine GroupⅠ为主.南海北部陆坡真光层海水中不同深度古菌的丰度相差较大,群落组成略有差异,这种差异可能是由深度不同所引起的.其中比例较高的奇古菌门Marine GroupⅠ类群多为氨氧化古菌,可能参与南海中的氮循环.丰度较高的广古菌门Marine GroupⅡ则在系统发育树中表现出和Thermoplasmata有较近的亲缘关系.本研究以南海北部陆坡真光层水柱中16S rRNA基因的丰度及其系统发育关系确定其中古菌的多样性,可为进一步评估古菌参与该海区真光层中碳氮元素循环的作用提供基础数据.; 谢丽飒徐蕾何莹张宇王佳华徐俊; 关键词：真光层 RRNA基因古菌多样性氨氧化古菌

抗性基因报告系统辅助选育厦门霉素A高产菌株: 2022年; 【背景】厦门霉素A是厦门链霉菌(Streptomyces xiamenensis)318菌株的主要次级代谢产物,具有显著的抗纤维化活性及药用潜力。但野生型菌株中厦门霉素A的产量仅有14 mg/L,其生产水平亟待提升。【目的】通过随机诱变-抗性标记筛选获得高产菌株并进行培养基优化,以提高厦门霉素A的产量。【方法】在厦门霉素A的生物合成基因簇后融合一个抗性基因,用于报告整个基因簇的表达水平。对构建的基因工程菌株进行常压室温等离子体(atmospheric and room temperature plasma,ARTP)诱变,从抗性水平高的突变菌株中筛选高产菌株,并通过培养基优化,使厦门霉素A产量显著提升。【结果】构建携带卡那霉素抗性标记的产厦门霉素A的工程菌MT-XN作为出发菌株,对该菌株进行一轮ARTP诱变,使用90 mg/L卡那霉素筛选,得到了厦门霉素A产量为101.7 mg/L的突变菌株MA-8。进一步通过响应面法优化培养基配方,在最佳培养基中MA-8菌株产生的厦门霉素A达到134.2 mg/L,较野生型菌株提高了845.1%。【结论】采用随机诱变-报告基因筛选系统,可快速筛选出厦门霉素A产量大幅提升的高产菌株,为后续的药物开发奠定良好的基础。; 李嘉欣步绪亮张贵振江向海徐俊徐岷涓; 关键词：响应面法优化抗纤维化

海洋放线菌多样性及其生物活性物质的研究: 海洋是生命的摇篮,也孕育了地球上80％的物种;海洋占整个地球面积的3/4;广袤的大洋里不仅蕴藏着丰富的物质资源,还有蕴藏着可持续利用的独特生物资源。我国海岸线绵长,跨越热带、亚热带到温带的辽阔海域。红树林是热带或亚热带海...; 徐俊; 关键词：海洋放线菌生物活性微生物资源红树林生物合成基因; 文献传递

基于数值模拟的孔腔水动噪声机理及其控制研究被引量：5: 2014年; 孔腔水动噪声是水下航行体的主要噪声源之一。该文基于计算流体动力声学(CHA)的多步骤混合方法,对方形孔腔周围涡流场及其等效声源场和声场做了精细数值模拟和分析。文章对孔腔流动噪声源进行了细致空间定位,从而把孔腔流动声源区划分成对应不同发生机理的子区域;然后分别计算了各子声源区对声辐射的贡献,从而区分真假、主次声源;最后针对主要声源的发生机理提出了腔内加隔板的降噪方案。文中的流场计算采用CFD软件FLUENT和大涡模拟(LES)方法,声源场和声场计算采用声学软件ACTRAN,相关数值模拟方法和手段用经典实验数据进行了对比验证。该文所提出的孔腔内加隔板的降噪方案,由数值模拟可知其有显著降噪效果。; 徐俊唐科范张旭; 关键词：大涡模拟降噪

生命的本质和特例--“极端微生物专刊”序言: 2017年; 所谓极端微生物（extremophile）是站在人类的角度,对栖居于地球上所有＂非宜居＂空间中的微生物的统称。这些微生物包括嗜热、嗜冷、嗜酸、嗜碱、嗜盐、嗜压,以及仍然有待发现的其他嗜＂极＂微生物。沧海桑田,大千世界,微生物一直在地球和生命的协同演化过程中扮演着重要角色。; 徐俊; 关键词：极端微生物地球深部深部探测微生物资源热泉嗜盐菌

从假单胞菌1896中分离到的5个环二肽类化合物被引量：4: 2011年; 以海洋细菌假单胞菌1896(Pseudomonas sp.1896)为研究对象,对其发酵液的化学成分进行研究.从30 L发酵液乙酸乙酯提取物中分离到5个化合物,并通过1D,2D-NMR和ESI-MS光谱数据确定了化合物的结构.它们分别为cyclo-(L-pro-L-tyr)(Ⅰ)、cyclo-(D-pro-L-tyr)(Ⅱ)、cyclo-(D-pro-L-val)(Ⅲ)、cyclo-(D-pro-D-trp)(Ⅳ)、cyclo-(L-pro-D-met)(Ⅴ).研究结果表明,海洋细菌中蕴藏着丰富的具有生物活性的环二肽,是开发微生物药物的重要资源.; 石妞妞徐俊沈月毛; 关键词：海洋细菌假单孢菌次级代谢产物

海水中主要金属盐对4株Kangiella属细菌的生长及其蛋白酶相关基因表达的影响被引量：1: 2018年; 【背景】Kangiella是海洋专属的、营异养生长的革兰氏阴性菌。按16S rRNA基因系统发育分析,Kangiella属归属于γ-变形杆菌纲,但此类细菌的生理生态功能未知。推测该类海洋细菌产生的胞外丝氨酸蛋白酶在其利用有机氮源生长的过程中起重要作用。【目的】研究海水盐中主要金属离子Na盐、Mg盐、Ca盐、K盐对海洋来源的4株Kangiella菌株(K.aquimarina DSM16071、K.geojedonensis YCS-5、K.koreensis DSM 16069和K.profundi FT102)的生长及胞外蛋白酶表达的影响。【方法】测定Kangiella属4个不同种的模式菌株在2216E培养基及不添加Na盐、Mg盐、Ca盐和K盐的2216E培养基中的生长情况。以2%的酪蛋白为底物,采用福林酚法分别检测4株菌株的胞外蛋白酶酶活。克隆K.profundi FT102菌株中的3个丝氨酸蛋白酶编码基因以及phoP和phoQ基因,使用实时荧光定量PCR技术检测Mg盐对这些基因表达的影响。【结果】4株Kangiella菌株在不添加Na盐的2216E培养基中均不能生长;在不添加Mg盐、Ca盐和K盐的2216E培养基中,K.aquimarina DSM 16071、K.geojedonensis YCS-5和K.profundi FT102这3个菌株的生长差异较小;而K.koreensis DSM 16069菌株的生物量在不添加上述3类主要金属盐的2216E培养基中反而增高。各个菌株在对数期时的胞外蛋白酶活差异较大,最高可以达到11.23 U/mL,最低仅为0.99 U/mL。2216E培养基中不添加Mg盐时,K.aquimarina DSM 16071、K.geojedonensis YCS-5和K.profundi FT102这3株菌中的丝氨酸蛋白酶编码基因asp1、asp2和asp3以及phoP和phoQ基因的转录水平无显著差异,而在K.koreensis DSM 16069菌株中这5个基因的表达却显著上调。【结论】Na盐是4株海洋Kangiella菌株生长所必需的金属离子,Mg盐和Ca盐对4株菌株的生长及其中3个保守的丝氨酸蛋白酶基因表达的影响不同。在不添加Mg盐的2216E培养基中,K.koreensis DSM 16069菌株的生物量、胞外蛋白酶活和3个保守的丝氨酸�; 徐蕾徐蕾卢烨王佳华; 关键词：海洋细菌丝氨酸蛋白酶金属盐

恩拉霉素新产生菌及其高产突变株: 本发明涉及一种恩拉霉素新产生菌及其高产突变株。本发明利用针对肽类抗生素合成基因保守区域设计的引物筛选海洋环境分离得到的链霉菌，通过同源性比对获得肽类抗生素恩拉霉素的新产生菌。本发明还利用核糖体工程技术选育出恩拉霉素产量提...; 徐俊肖静马光辉

徐俊

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

徐俊

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈