张文香
- 作品数:7 被引量:16H指数:2
- 供职机构:贵州师范学院更多>>
- 发文基金:博士科研启动基金贵州省自然科学基金国家棉花产业技术体系项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 棉花GhMADS29启动子克隆及表达分析被引量:7
- 2013年
- 以实验室克隆的GhMADS29(GeneBank登录号:JQ682642)基因的cDNA序列Blast搜索雷蒙德氏棉的基因组序列,根据Blast结果设计引物,克隆到起始密码子上游-19位开始的1316 bp的序列;利用PlantCARE启动子在线分析软件预测其含有核心启动子元件TATA-box和CAAT-box,并含有光、温、赤霉素、水杨酸、生长素等的响应元件。通过替换pBI121载体上的CaMV35S启动子构建了GhMADS29启动子与GUS基因的融合表达载体并转化拟南芥,组织化学染色分析发现其在14 d幼苗的根和叶中都有表达,在萼片、花瓣、雌蕊、果瓣中也表达,而在雄蕊和种子中不表达。综上所述,我们推测GhMADS29可能与各种开花途径有关,与萼片、花瓣、雌蕊等花器官的发育有关,还可能与果实是否开裂有关。
- 张文香范术丽宋美珍庞朝友魏恒玲喻树迅
- 关键词:启动子GUS染色
- 铁皮石斛快繁优化及不同时期生物碱积累的研究被引量:2
- 2018年
- 本研究以铁皮石斛无菌苗茎段为实验材料优化茎段培养的最适培养基,并对其愈伤组织形成后的10 d、15 d、20 d、25 d、30 d、35 d、40 d等不同时期的生物碱的含量进行测定。结果表明,以MS为基本培养基,原球茎诱导的最佳激素组合为NAA 1.5 mg/L+6-BA 0.5 mg/L,平均诱导率为95%;原球茎增殖的最佳激素组合为6-BA 1 mg/L+NAA 1 mg/L,原球茎分化的最佳激素组合为6-BA 5 mg/L+NAA 1 mg/L,平均分化率可达80%;生根壮苗的最佳组合为:IBA 1.5 mg/L+香蕉泥100 g/L+活性炭0.1%,其生根率为100%;愈伤组织形成后30 d左右时其总生物碱含量最高。
- 王自布张文香胡永菲张波
- 关键词:铁皮石斛培养基
- 马缨杜鹃MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析被引量:2
- 2018年
- MYB基因是一类大的转录因子家族,广泛参与植物的各种生命活动,但是杜鹃中关于此类转录因子的研究甚少,为杜鹃的分子育种提供基因资源,本研究在全基因组范围对马缨杜鹃MYB基因进行鉴定与分析。以马缨杜鹃基因组数据为基础,通过本地blast和HMMER search,全面鉴定MYB转录因子,通过MEME、HMMSCAN以及blastn比对,去除不含MYB结构域或者MYB结构域不完整的序列,以及冗余序列,通过Weblogo在线工具对R2和R3的保守基序进行分析,通过MEGA6分析了马缨杜鹃与拟南芥2R-MYB基因的进化关系。得到4条3R-MYB基因、81条2R-MYB基因、85条1R-MYB基因,保守基序分析发现马缨杜鹃MYB基因的R2和R3结构域具有典型的保守色氨酸残基和3个α螺旋结构,进化树分析将马缨杜鹃2R-MYB基因分为了29个亚组,基因复制分析发现有两对基因是复制关系。本研究获得的MYB基因序列和进化树分析,为马缨杜鹃甚至杜鹃属植物的MYB基因的功能研究提供了科学依据。
- 张文香张文香钱长江王自布
- 关键词:马缨杜鹃MYB全基因组生物信息学
- 一种陆地棉蛋白GhMADS22及其编码基因与应用
- 本发明公开了一种陆地棉GhMADS22蛋白及其编码基因与应用。该蛋白GhMADS22,是具有下述氨基酸残基序列之一的蛋白质:1)序列表中的SEQ ID №.2的氨基酸残基序列;2)将序列表中的SEQ ID №.2的氨基酸...
- 喻树迅张文香范术丽宋美珍庞朝友魏恒玲
- 文献传递
- 马缨杜鹃ARF转录因子家族的全基因组鉴定与生物信息学分析
- 2019年
- 以马缨杜鹃(Rhododendron delavayi)基因组数据为基础,以拟南芥ARF(AtARF)序列为参考,利用Blast比对程序,在马缨杜鹃基因组数据库中鉴定了15个ARF基因,命名为RdARF。使用生物信息学的方法对基因的结构、理化性质、系统进化关系以及表达模式进行了分析,以期为马缨杜鹃ARF基因的克隆及深入研究提供参考。结果表明:15个RdARF蛋白均含有保守的B3结构域和Auxin-resp结构域,部分蛋白含有Aux/IAA结构域,共有10个保守基序,均含有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点,均含有内含子和外显子结构,与23个AtARF蛋白一起可以分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅱa、Ⅱb和Ⅲ5个亚家族,15个RdARF基因在干旱胁迫前后具有4种不同的表达模式。
- 张文香张文香张荣祥钱长江刘树文王自布
- 关键词:马缨杜鹃ARF生物信息学分析
- 一种陆地棉蛋白GhMADS22及其编码基因与应用
- 本发明公开了一种陆地棉GhMADS22蛋白及其编码基因与应用。该蛋白GhMADS22,是具有下述氨基酸残基序列之一的蛋白质:1)序列表中的SEQ ID №.2的氨基酸残基序列;2)将序列表中的SEQ ID №.2的氨基酸...
- 喻树迅张文香范术丽宋美珍庞朝友魏恒玲
- 文献传递
- 棉花SVP-like基因GhMADS29的克隆与表达分析被引量:6
- 2015年
- [目的]研究棉花中SVP类基因的功能。[方法]通过同源克隆的方法在陆地棉中棉所36中克隆SVP的同源基因GhMADS29,对其进行Blast搜索比对和进化树分析以及荧光定量的表达模式分析。[结果]GhMADS29与猕猴桃的SVP4基因相似度最高,其cDNA序列含有9个外显子、8个内含子,不同时期顶芽的荧光定量结果表明它在花芽分化起始期的花芽中表达量最高,且不同组织的荧光定量分析表明它在叶片和顶芽中表达量较高。[结论]首次获得棉花SVP亚族基因,命名为GhMADS29,其GeneBank登录号为JQ682642。
- 张文香庞朝友范术丽宋美珍魏恒玲喻树迅
- 关键词:SVP荧光定量开花