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马和驴Y-SNPs筛选及多拷贝基因鉴定: 中国马和驴饲养历史悠久,种质资源丰富,在世界上有着重要的影响。目前有关中国马和驴品种遗传多样性的研究多数集中在线粒体DNA和常染色体DNA方面,对其Y染色体遗传多样性和起源进化的研究还比较缺乏。本研究以13个中国家马品种...; 徐苹; 关键词：家马家驴 Y-SNPS; 文献传递

玉树马和德保矮马SLC36A1基因多态性研究被引量：1: 2013年; 控制马香槟毛色的CH(Champagne gene)基因家族包含4个候选基因(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),研究发现SLC36A1基因外显子2的突变是造成马香槟毛色的关键位点。为揭示中国马SLC36A1基因遗传多态性,本研究以玉树马和德保矮马共74个样本为研究对象,以马DNA池为模板扩增SLC36A1基因的10个外显子及部分内含子序列并进行测序分析。共发现马SLC36A1基因5个SNPs,分别位于内含子3(g.26699953A>G,g.26699851G>C,g.26699850G>C),外显子4(g.26699562G>A)及外显子6(g.26697018C>T)。利用PCR-RFLP方法对74个家马样本进行基因分型,发现外显子6的SNP有基因型CC、CT;外显子4的SNP有基因型GG、GA;内含子3的g.26699850G>C突变有基因型GG、GC;内含子3的另外2个SNPs(g.26699953A>G,g.26699851G>C)通过测序,发现有AA、AG、GG与GG、GC、CC基因型。所有5个马SNPs均为野生型占主要优势。由此界定了马SLC36A1基因有9种单倍型(H1-H9),其中H5是最主要的单倍型。德保矮马遗传多样度为0.4190,比玉树马(0.2228)高,表明德保矮马香槟毛色遗传多态性比玉树马更丰富。玉树马与德保矮马的平均单倍型多样度为0.3160,表明其香槟毛色遗传多态性相对较低。; 徐苹黄洁萍王风巧党瑞华雷初朝; 关键词：多态性 SNP PCR-RFLP

中国黄牛Y-STRs遗传多样性与起源研究被引量：7: 2012年; [目的]研究中国黄牛Y染色体STRs的遗传多样性及父系起源。[方法]利用非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,选择2个牛Y-STRs位点INRA189和BM861,分析16个中国地方黄牛品种284头公牛与4头缅甸黄牛公牛的Y染色体遗传多样性。[结果]在中国16个黄牛品种中,2个Y-STR位点可以区分中国黄牛中的普通牛和瘤牛类型,表明中国黄牛有普通牛和瘤牛两种父系起源。4头缅甸黄牛均为瘤牛类型。在中国16个黄牛品种中,普通牛和瘤牛分布频率分别为57.0%和43.0%,其中普通牛频率在北方黄牛中占优势(98.3%),瘤牛频率在南方黄牛中占优势(76.1%),中原黄牛中普通牛频率较高为63.8%,瘤牛频率为36.2%。[结论]中国黄牛存在普通牛和瘤牛两种父系起源;普通牛频率自北向南逐渐减少,瘤牛频率自北向南逐渐增加,中原地区为普通牛和瘤牛的交汇处。; 常振华黄洁萍徐苹李冉张润锋陈宏雷初朝; 关键词：黄牛 Y-STRS 单倍型

黄牛Y染色体分子遗传多样性研究进展被引量：5: 2012年; Y染色体分子遗传多样性是追溯动物起源、驯化历史和迁徙路线的重要工具,也可以用来反映动物的父系遗传多样性及用于研究群体间父系介导的杂交情况。Y染色体单倍型多样性可以分别通过Y染色体单核苷酸多态性(Y-SNP)和Y染色体微卫星多态性(Y-STR)或这二者结合起来构建精确的Y染色体单倍型。黄牛有3种父系起源(普通牛Y1、Y2和瘤牛Y3单倍型组),可以通过Y-SNP来区分,通过-STR标记可以区分Y1、Y2和Y3所具有的丰富的精细单倍型。本文汇集了包括中国在内的国内外黄牛Y染色体遗传多样性与起源进化的研究进展。; 李冉常振华徐苹黄洁萍陈宏雷初朝; 关键词：黄牛 Y染色体单倍型

德保矮马与哈萨克马KIT基因多态性分析被引量：1: 2012年; 马毛色是品种鉴定和个体识别的重要依据。马KIT基因位于3号染色体,KIT基因突变影响马毛色及毛色的分布。对德保矮马和哈萨克马69个个体的KIT基因21个外显子及部分内含子直接测序,共发现了5个SNPs,其中1个位于5'-UTR区(g.91214T>G),1个位于内含子20(g.171356C>G),另外3个分别位于外显子15、20和21(g.164297C>T;g.170189C>T;g.171471G>A,p.Ala960Thr)。用PCR-RFLP方法对69个个体进行分型,发现外显子15有3种基因型TT、CT、CC;外显子20有3种基因型TT、CT、CC;外显子21有2种基因型GG与GA,且均为野生型占优势。德保矮马KIT基因多态性比哈萨克马更丰富。; 毛春春孙伟刘东花徐苹雷初朝; 关键词：KIT基因 SNP

新疆驴和青海驴MSTN基因多态性分析: 2012年; 为揭示中国家驴MSTN基因的遗传多样性,以新疆驴和青海驴为研究对象,根据GenBank上公布的马的MSTN序列,设计9对特异性引物,利用驴混合DNA池为模板对该MSTN基因部分序列进行PCR扩增和测序分析。结果显示,扩增出的驴MSTN基因部分序列长度为3242bp,包括5'-UTR区(671bp)、第一外显子(373bp)、第一内含子(1825bp)和第二外显子(373bp)。在该基因中共发现4个SNPs,分别为65bp处T→C(5'-UTR),872bp处A→G(第一外显子),2017bp处G→A(第一内含子),2395处C→G突变(第一内含子)。利用PCR-RFLP技术对新疆驴和青海驴共计80个样本进行基因分型,4个突变位点共检测到6种单倍型(H1-H6),其中H1是最主要的单倍型。两个家驴品种MSTN基因的遗传多样性很丰富(H=0.6044),这对中国驴的遗传资源保护具有重要作用。; 刘东花徐苹黄洁萍毛春春雷初朝; 关键词：家驴 MSTN基因单倍型

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徐苹