张敏
- 作品数：5 被引量：34H指数：3
- 供职机构：大连理工大学计算机科学与技术学院计算机科学与工程系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金大连市科技计划项目更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学更多>>
- 一种信息系统求核的新方法被引量：2
- 2004年
- 为简化用差别矩阵求核的计算方法,给出了差别矩阵与核关系的定理,并在此基础上给出了一种新的求核方法.新算法从差别矩阵中直接提取出核属性元素并利用该定理的结论给出信息系统中核的构成.经计算,该算法的复杂度为O(n2m).
- 闫德勤迟忠先张敏
- 关键词：信息系统差别矩阵粗糙集
- 生物序列比对算法研究现状与展望被引量：25
- 2004年
- 序列比对是生物信息学研究的一个基本方法,寻求更快更灵敏的序列比对算法一直是生物信息学研究的热点.本文给出了生物序列比对问题的定义,综述了目前常用的各类比对算法,并对每一类算法的优缺点以及应用范围进行了分析,最后指出序列比对算法目前存在的问题以及未来的发展方向.
- 张敏
- 关键词：生物信息学多序列比对分子生物学
- 基于迭代渐进多序列比对算法研究被引量：3
- 2005年
- 提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA。采用公共多序列比对数据库BAliBASE中142组蛋白质序列作为比对测试数据,并与ClustalW进行比较。比对结果的统计分析表明,IPMSA算法的比对准确率高于ClustalW。
- 张敏方伟武张俊华迟忠先
- 关键词：准确率
- 一种新的迭代渐进多序列比对算法被引量：3
- 2005年
- 该文提出一种新的迭代渐进多序列比对算法IPMSA。该算法先用渐进方法进行多序列比对,然后通过迭代策略,利用上一轮多序列比对结果修正指导树,产生新一轮比对。重复这一过程,直到指导树不再发生变化或满足事先设定的迭代次数为止。以比对数据库BAliBASE中多蛋白质家族1idy为例,对IPMSA算法和ClustalW算法进行的比较研究表明,该算法能更有效地比对分歧较大的序列,并改进其系统发育树。
- 张敏方伟武张俊华迟忠先
- 关键词：多序列比对
- 一个新的多序列比对算法(英文)被引量：1
- 2005年
- 多序列比对是生物信息学中基础而又重要的序列分析方法.本文提出一种新的多序列比对算法, 该算法综合了渐进比对方法和迭代策略,采用加权函数以调整序列的有偏分布,用neighbor-joining 方法构建指导树以确定渐进比对的顺序.通过对BAliBASE 中142组蛋白质序列比对的测试,验证了本算法的有效性.与Multalin 算法比较的结果表明,本算法能有效地提高分歧较大序列的比对准确率.
- 王占昌张敏迟忠先
- 关键词：生物信息学多序列比对准确率
