毕潇潇
- 作品数：5 被引量：106H指数：4
- 供职机构：中国海洋大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技基础条件平台建设计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 松江鲈线粒体DNA控制区结构和遗传多样性分析被引量：7
- 2016年
- 为探讨松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)线粒体控制区特征及其群体遗传结构,研究测定分析了中国和日本沿海共8个群体的线粒体控制区序列,分析了其结构特征,识别出终止序列区(ETAS)、中央保守区(CD)和保守序列区(CSB)的特征序列。遗传多样性分析结果显示:69个松江鲈个体共检测到47个单倍型,呈现出核苷酸多样性(0.0079)较低和单倍型多样性(0.978)较高的特点。单倍型邻接关系树和单倍型网络关系图均显示松江鲈分为中国和日本两大世系。遗传分化系数(F_(st))和分子方差分析(AMOVA)结果表明,松江鲈中国群体和日本群体之间存在的遗传差异较显著,中国沿海各群体之间亦存在着一定程度的遗传差异,该分化主要由历史环境变动、当代环境因素和自身生态习性等原因造成。
- 赵林林毕潇潇宋林高天翔
- 关键词：松江鲈控制区结构遗传分化
- 4种鳕鱼线粒体16SrRNA、COI和Cytb基因片段序列的比较研究被引量：52
- 2009年
- 对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539bp(16S rRNA)、601bp(COI)和385bp(Cytb),其基因片段的A+T含量都较高。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cytb>COI>16S rRNA。Cytb基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene)。根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。
- 毕潇潇高天翔肖永双李永振
- 关键词：鳕鱼COI基因CYT
- 松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的形态学与遗传学研究
- 松江鲈（Trachidermus fasciatus Heckel）隶属于鲉形目（Scorpaeniformes）、杜父鱼科（Cottidae）、松江鲈属（Trachidermus），为小型降河洄游性鱼类，是我国野生动物...
- 毕潇潇
- 关键词：松江鲈形态学地理群体
- 基于线粒体Cytb基因全序列的松江鲈群体遗传结构分析被引量：39
- 2013年
- 对松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)中国沿海7个群体和日本有明海群体的线粒体Cytb基因全序列进行了测定、分析。结果显示:47个个体共检测到31个单倍型,8个群体均呈现出较高的单倍型多样性(0.60—1.00)和较低的核苷酸多样性(0.0005—0.0041)的特点。AMOVA分析结果及单倍型邻接关系树和单倍型网络关系图均显示松江鲈分为中国和日本两个世系,而中国世系的7个群体未呈现出明显的地理遗传结构。基于核苷酸Kimura双参数替代模型计算得出的中国和日本两个世系的净遗传距离,再参照其他硬骨鱼类线粒体Cytb基因2%/Ma(百万年)的分歧速率,推测松江鲈中日两个世系间分化时间约为41万年前。对中国世系进行群体历史动态分析,中性检验结果均为负值且显著,核苷酸不配对分布呈单峰型,表明松江鲈中国世系曾发生过群体扩张,其扩张时间大约为12万年前。
- 高天翔毕潇潇赵林林李创举
- 关键词：松江鲈CYTB基因全序列
- 松江鲈(Trachidermus fasciatus)种群的形态学与遗传学研究及四种鳕鱼的遗传学研究
- 松江鲈(Trachidermus fasciatus Heckel)隶属于鲉形目(Scorpaeniformes)、杜父鱼科(Cottidae)、松江鲈属(Trachidermus)，为小型降河洄游鱼类，是我国水生野生二...
- 毕潇潇
- 关键词：松江鲈形态学线粒体DNA控制区细胞色素
- 文献传递
