杨洋
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：湖南师范大学物理与信息科学学院更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金国家自然科学基金中南大学博士后科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 复杂疾病模型快速参数求解算法被引量：1
- 2012年
- 全基因组关联研究(GWAS)是在探究人类复杂疾病相关基因的重要方法,实用有效的算法是GWAS成功的关键,因此根据疾病模型生成模拟数据对GWAS算法进行比较测试具有重要的意义。模拟测试要求根据各种输入的控制量计算出疾病模型的相关参数,但是目前缺乏相关公开的算法。提出了一个求解这些参数的分支限界算法。大量实验测试表明该算法能快速精确地计算出疾病模型的相关参数,可用于搭建GWAS算法测试平台。
- 谢民主杨洋
- 关键词：发病率
- 两位点疾病模型的快速参数求解算法
- 2012年
- 生成模拟数据对全基因组关联分析(GWAS)算法进行测试时,要求按单位点边缘效应大小计算出疾病模型的相关参数,而目前缺乏对应的公开算法。为此,基于二分搜索提出一个数值算法,根据单位点边缘效应和人群疾病发病率计算出3个典型的两位点疾病模型的控制参数。实验结果表明,该算法能快速精确地进行疾病模型参数求解,便于对GWAS算法进行大规模模拟测试。
- 谢民主刘新求杨洋
- 关键词：单核苷酸多态性发病概率全基因组关联分析二分搜索
