朱玲 作品数:28 被引量:87 H指数:5 供职机构: 中国水产科学研究院黄海水产研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家海洋公益性行业科研专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 环境科学与工程 文化科学 更多>>
一种海洋贝类生物沉积物总DNA的高效提取方法 本发明属于海洋贝类生物沉积物研究技术领域,涉及一种海洋贝类生物沉积物总DNA的高效提取方法,包括海洋贝类生物沉积物样品的预处理和样品总DNA提取两步,其中关键步骤为样品的预处理,依次使用3种不同成分的洗涤溶液对沉积物样品... 朱玲 孙安琪 李蒙海洋水母螅状体的整体原位杂交的检测方法 本发明属于细胞遗传学与分子生物学技术领域,涉及海洋水母螅状体的整体原位杂交的检测方法。包括以下步骤:将螅状体依次用多聚甲醛梯度海水溶液进行固定,再用乙醇溶液对固定样品脱水,将脱水的螅状体进行水化、固定、乙酰化处理;将处理... 朱玲 梁宇君 周春娅文献传递 一种埋栖型贝类南北接力三段式养殖方法 本发明涉及一种埋栖型贝类南北接力三段式养殖方法,属于水产养殖领域,所述方法为9‑11月份,在南方福建浙江沿海进行室内规模化育苗,于次年3月运输至山东,3‑5月在山东沿海进行海水池塘中间培育,经过2‑3个月时间培育至规格0... 薛素燕 毛玉泽 邱彦国 李加琦 房景辉 朱玲 刘龙镇小黄鱼(Larimichthys polyactis)线粒体基因组结构与特征 被引量:10 2010年 采用长片段扩增策略,获得鲈形目石首鱼科黄鱼属小黄鱼的线粒体基因组全序列。组装分析结果表明,其长度为16470bp,H链碱基组成呈明显反G偏倚,G含量仅为16%。13个蛋白质基因起始密码子均为ATG。COI基因的终止密码子为AGA,ND1和ND3基因为TAG,COII、ND4和Cytb基因为不完全终止密码子T,其余7个基因都是完整的TAA。在小黄鱼mtDNA中发现2个特殊发夹结构,一个是轻链复制起始区(OL)的发夹环,位于tRNA簇,环区T含量仅为9%,而G含量达45%,这与哺乳动物和爪蟾该区域富含T有所不同。另一个假定发夹结构位于ATP6基因末端,这种二级结构可能与准确转录有关。该mtDNA控制区长度为799bp,5′端含有9个连续TA串联重复和2个5′-ATGTA---TACAT-3′重复,与已报道的鱼类扩展终止相关序列模式恰恰相反;中央控制区仅识别出CSB-E结构;保守序列区含有CSB-1,2,3,其中CSB-2具有高度保守性。对小黄鱼和大黄鱼的mtDNA比较进化研究,根据分子钟假说,估计二者线粒体基因组的进化分歧时间为4.8百万年前。 柳淑芳 吴仁协 朱玲 庄志猛关键词:小黄鱼 线粒体基因组 暴发水母种群波动对渔业资源风险影响的量化评估方法 本发明涉及海洋动物学、渔业资源学、海洋动物生态学、水生动物保护学、渔业资源调查与评价和海洋环境生态学等相关领域,建立了一种暴发水母种群波动对渔业资源风险影响的量化评估方法,即引入表征暴发水母种群异常波动强弱的指标‑竞争优... 朱玲 戴芳群 孙安琪 李蒙魁蚶C型凝集素基因cDNA的克隆及表达分析 被引量:3 2018年 通过cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of c DNA ends,RACE)技术克隆得到魁蚶(Scapharca broughtonii)C型凝集素(C-type lectin,Sb-Lec1)基因,该基因全长为700 bp,其中,5′-UTR为29 bp,3′-UTR为167 bp,开放阅读框长度为504 bp,编码167个氨基酸,包括长度为23个氨基酸的信号肽序列、129个氨基酸的糖识别结构域(CRD)以及参与二硫键形成的6个半胱氨酸。预测蛋白分子量为19.11 k Da,理论等电点为4.74。多序列比对结果显示,Sb-Lec1基因CRD编码的氨基酸序列与长牡蛎(Crassostrea gigas)、紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)和海湾扇贝(Argopecten irradians)C型凝集素的同源性分别为38%~40%、34%~35%和38%~39%,Sb-Lec1基因编码的氨基酸序列与其他物种的凝集素基因具有相似的结构,均含有形成二硫键的4个保守半胱氨酸。系统进化分析结果显示,魁蚶先与贝类聚为一支,再与脊椎动物聚在一起,表明魁蚶Sb-Lec1基因在进化树上的位置与其传统分类所处位置一致。采用荧光定量PCR技术,检测了Sb-Lec1基因在组织中的表达情况,发现其在肝胰腺、血淋巴、鳃、外套膜、闭壳肌、斧足中均有表达,其中,肝胰腺表达量最高。同时,分析了Sb-Lec1基因在鳗弧菌(Vibrio anguillarum)刺激下的mRNA表达量变化情况。结果显示,与对照组相比,菌刺激组Sb-Lec1基因mRNA在各检测组织中的表达量均显著上调(P<0.05),随着刺激时间的延长,表达量呈先升高后降低的趋势。本研究表明,魁蚶Sb-Lec1基因在机体免疫防御方面发挥重要功能。 沈淑芳 朱玲 李加琦 薛素燕 薛素燕 陈琼琳 李阳 陈琼琳 毛玉泽关键词:C型凝集素 魁蚶 鳗弧菌 基因克隆 基因表达 海蜇(Rhopilema esculentum)Wnt5基因:cDNA克隆、基因组结构与表达 被引量:9 2013年 采用转录组454 GS FLX测序和RACE技术,首次解析了海蜇Wnt5基因的cDNA和基因组结构。结果表明,Re-Wnt5基因的cDNA全长1647bp,其中编码区长1059bp,编码了353个氨基酸的多肽;Re-Wnt5基因组含有4个外显子和3个内含子。SMART分析表明,Re-Wnt5具有Wnt家族共同的结构特征,包括一个由20个氨基酸组成的信号肽,2个N-糖基化位点和24个保守的参与二硫键形成的半胱氨酸。多序列比对和系统进化分析表明,Re-Wnt5基因与来自刺胞动物、无脊椎动物和脊索动物的Wnt5、脊椎动物的Wnt5a和Wnt5b具有高度相似性,Wnt5a和Wnt5b两个进化分支发生在脊索动物文昌鱼之后。实时荧光定量PCR显示,Re-Wnt5基因在海蜇四个发育阶段均有表达,其中横裂体阶段的表达量最高,分别是螅状体、碟状体和水母体表达量的12.38、9.99和13.01倍。 周春娅 朱玲 潘滢 谢明松 杨傲傲 陈四清 庄志猛关键词:海蜇 CDNA 基因组结构 实时荧光定量PCR 海蜇(Rhopilema esculentum)Notch基因的cDNA克隆和表达 被引量:1 2017年 基于转录组454 GS FLX测序结果,利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum)Notch基因的c DNA全长,并分析了其m RNA在海蜇不同发育阶段的表达差异,以探讨Notch基因对海蜇无性生殖的影响。结果显示,海蜇Notch基因的c DNA全长为6768 bp,包括90 bp的5?非编码区、6066 bp的开放阅读框及612 bp包含AATAAA加尾信号的3?非翻译区。SMART分析表明,海蜇Notch为分泌蛋白,其信号肽由21个氨基酸组成。成熟肽由2000个氨基酸组成,包括37个结构域、26个表皮生长因子样结构域、3个富含半胱氨酸的Notch/Lin-12(NL)结构域、1个NOD结构域、1个NODP结构域、1个跨膜结构域和6个锚蛋白结构域ANK,并含有25个N-糖基化位点。同源分析表明,海蜇Notch与来自刺胞动物门的海葵(Nematostella vectensis)的Notch相似性为39%,与无脊椎动物和脊椎动物的氨基酸相似度分别为35%–37%和34%–38%。RT-PCR分析表明,Notch基因在海蜇无性繁殖的4个发育时期均有表达,螅状体阶段的表达量最高,横裂体阶段表达量最低,螅状体的表达量是横裂体的1.85倍。这些研究结果为进一步研究Notch信号通路在海蜇无性繁殖中的调控作用奠定了基础。 骆晓蕊 朱玲 周春娅 庄志猛 范艳君关键词:海蜇 NOTCH CDNA 实时荧光定量PCR 象山港南沙岛不同养殖模式沉积物微生物群落结构分析 被引量:3 2014年 通过构建16S rDNA克隆文库对象山港南沙岛不同养殖模式(贝类养殖、藻类养殖及网箱养殖)表层沉积物微生物多样性和群落结构特征进行了比较和分析,共获取136个OUT。其中,贝类养殖区、藻类养殖区和网箱养殖区OTU分别为58、48和57个。各站位OTU分布差异明显,表现出高度的多样性。基于16S rDNA序列的生物多样性和丰富度分析表明,网箱养殖区丰富度指数ACE为739,香浓指数H?为3.8,均为最高值,丰富度指数Chao为245,略低于于贝类养殖区。贝类养殖区丰富度指数Chao为303,在各养殖区中最高。藻类养殖区丰富度指数ACE为174、Chao为89,香浓指数H?为3.6,均为最低值。系统发育分析表明,南沙岛各养殖区的优势种群均为变形菌门(Proteobacteria),但是藻类养殖区微生物群落结构与其他养殖区域相比,16S rDNA克隆文库差异显著,其中根瘤菌属(Rhizobium)及其他光合细菌在藻类养殖区分布较多。网箱养殖区沉积物表层微生物群落中出现了与环境污染密切相关的菌群,如志贺氏菌属(Shigella)、埃希氏菌属(Escherichia)和ε-变形菌纲的微生物种群,揭示网箱养殖对底质沉积物环境的影响较大。 孙超 朱玲 毛玉泽 范艳君 周春娅 杨傲傲 朱伟 庄志猛关键词:网箱养殖 贝类养殖 藻类养殖 微生物群落结构 象山港 七带石斑鱼染色体核型研究 被引量:29 2010年 采用PHA体内直接注射法制备了七带石斑鱼(Epinephelus septemfasciatus)头肾组织染色体标本并分析其核型。结果表明,七带石斑鱼二倍体染色体数为48,24对染色体均为端部着丝粒染色体,其染色体臂数(NF)为48,核型公式为:2n=48t,NF=48。未发现与性别相关的异型染色体,第24对染色体长度明显小于其他染色体。通过与其他22种石斑鱼染色体核型进行比较,发现七带石斑鱼具有石斑鱼属鱼类的原始核型特征,属于石斑鱼属鱼类的原始类群。 钟声平 陈超 王军 刘志鸿 柳淑芳 朱玲 庄志猛关键词:七带石斑鱼 染色体 核型