张纪阳 作品数:39 被引量:84 H指数:6 供职机构: 国防科学技术大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 自动化与计算机技术 理学 文化科学 更多>>
课程教学虚拟实验系统的设计和应用 随着计算机技术的发展,虚拟实验在很多课程的教学中得到了应用.在实际应用中,课程虚拟实验系统的设计需要结合课程背景,深入分析课程教学需求,不仅仅需要完成管理系统和界面的设计,更重要的是课程相关实验对象的建立,以及基于虚拟实... 张纪阳 孙志强 刘伟关键词:课堂教学 虚拟实验系统 文献传递 分子生物学实验技术仿真应用研究进展 2010年 分子生物学实验技术的仿真应用开始于上个世纪七十年代,仿真应用中电泳和色谱技术是研究最多的仿真对象,分子杂交、聚合酶链式反应、质谱、测序和标记等实验技术的仿真也有一定的进展。仿真建模方法主要是基于实验机理和实验经验构造模型,并且两种方法相互渗透,在一定程度上弥补了各自的不足之处。生物学实验技术的仿真运用较多的随机理论和统计理论,能够更为客观地描述实验过程中分子的运动。仿真应用既能辅助进行实验设计,也能够为实验技术的发展提供指导性意见。 刘辉 张纪阳 朱云平 谢红卫关键词:分子生物学 仿真 电泳 色谱 蛋白质组学中质谱数据标准研究进展 被引量:3 2011年 质谱分析是蛋白质组学的一项支撑技术。质谱数据处理过程具有多策略、多处理步骤、多种处理软件的特点,数据处理过程中数据格式不统一的问题给数据交换和整合带来了一定的困难,也给质谱分析平台和质谱数据库的建设带来了挑战。研究质谱数据分析中的质谱数据标准,不仅可以系统地梳理归纳目前分析方法中需要使用的全部数据信息,而且有利于质谱数据分析平台的建设。本文介绍了近几年制定的一些质谱数据标准,总结这些标准各自的特点、不足及应用情况,并展望质谱数据标准可能的发展方向。 马海滨 张纪阳 刘辉 孙汉昌 谢红卫推力式倾转旋翼飞机 一种推力式倾转旋翼飞机,包括机身、旋翼、机翼、尾翼、尾桨系统、起落架以及动力系统,左旋翼以及右旋翼分别通过左旋翼倾转机构以及右旋翼倾转机构以机身轴线为中心线左右对称安装在机身两侧的机翼上,尾旋翼通过尾旋翼倾转机构安装在机... 张代兵 张纪阳 向绍华 吕飞 沈林成 方强 胡天江 胡豆 肖乃经 习业勋 李腾祥 赵树龙 安臣 潘崇煜 陈超文献传递 可隐藏于机翼的倾转机构 一种可隐藏于机翼的倾转机构,所述倾转机构设置在机翼上,所述机翼内预留有一个能够容纳倾转机构的回收空间,所述倾转机构包括舵机、倾转座、电机以及折叠桨,电机以及折叠桨固定在倾转座上,所述舵机与倾转座之间通过连杆机构连接。该机... 张代兵 张纪阳 向绍华 吕飞 沈林成 方强 胡天江 胡豆 肖乃经 习业勋 李腾祥 赵树龙 安臣 潘崇煜 陈超文献传递 蛋白质组质谱分析中基于串并联支持向量机的肽段色谱保留时间预测方法 被引量:1 2012年 基于质谱的大规模蛋白质鉴定中,在线液相色谱分离发挥了重要作用。色谱保留时间(retention time,RT)是肽段鉴定和定量的重要信息。由于整个色谱分析运行时间中,流动相中的有机相采用了非线性浓度曲线以及样品中肽段之间的相互影响等因素,基于肽段序列的RT预测还存在精度不高、模型推广性能差等问题。本文提出了一种基于串并联支持向量机(serial and parallel support vector machine,SP-SVM)的RT预测方法,能够表征洗脱过程中有机相浓度的非线性变化和肽段之间的相互影响,显著提高了肽段保留时间预测的精度。利用复杂样本数据集验证结果表明,预测RT和实验RT之间的决定系数达到了0.95,超过95%的鉴定肽段的RT预测误差范围小于总运行时间的20%,超过70%的鉴定肽段的RT预测误差范围小于总运行时间的10%。本文提出的模型的性能达到了目前已知的最好水平。 张纪阳 张代兵 张伟 谢红卫关键词:液相色谱-质谱 基于局部回归的色谱保留时间对齐可逆算法 被引量:1 2011年 提出并实现一种基于局部回归的对齐算法,选择鉴定结果最多的一次实验作为参考,实现色谱保留时间的可逆对齐,将n次实验的对齐建模次数从n(n-1)/2次减少为n-1次。该算法还实现不同实验间色谱保留时间的非线性对齐,并且能够克服少量从色谱柱中多次流出肽段的影响。研究结果表明:该方法计算时间复杂度远比现有算法的低,对齐精度也能够满足后续计算的需要。 李龙 张纪阳 史秀建 孙汉昌 谢红卫 欧阳辰星关键词:定量蛋白质组学 可隐藏于机翼的倾转机构 一种可隐藏于机翼的倾转机构,所述倾转机构设置在机翼上,所述机翼内预留有一个能够容纳倾转机构的回收空间,所述倾转机构包括舵机、倾转座、电机以及折叠桨,电机以及折叠桨固定在倾转座上,所述舵机与倾转座之间通过连杆机构连接。该机... 张代兵 张纪阳 向绍华 吕飞 沈林成 方强 胡天江 胡豆 肖乃经 习业勋 李腾祥 赵树龙 安臣 潘崇煜 陈超文献传递 生物信息学课程研究性教学的实践与思考 被引量:9 2011年 作为新兴交叉学科,生物信息学处于蓬勃发展阶段,来自不同学科的理论和观点不断融合,技术和方法迅速更新,这些特点决定了在课程建设和教学中,非常适合实施开放式的研究性教学。但与此同时,这也为课程的建设和施教带来了挑战和困难。结合《生物信息学》课程的教学实践,从确定课程的目标与定位、选择和组织教学内容、设计和实施研究性教学、准备和推荐扩展阅读材料等方面,探索了这一类课程建设与施教的特点和方法。 张纪阳 刘伟 谢红卫关键词:课程建设 研究性教学 生物信息学 应用于Bottom-up蛋白质鉴定的质谱数据采集策略研究进展 被引量:3 2013年 蛋白质组的高度复杂性给基于质谱的蛋白质鉴定提出了很大的挑战。技术需求促进质谱技术不断向前发展。仪器平台在软硬件方面的进步,为高通量蛋白质鉴定提供了更多选择和支撑。但是,仪器性能的充分发挥,还需要根据生物学问题的需求和分析样本的特性,设计高质量的数据采集策略。本文对目前高通量蛋白质鉴定中已开发的质谱数据采集策略进行了综述,重点介绍了Bottom-up策略中使用的简单重复、离子排除和监测、在线智能化扫描和分段扫描等技术,并关注了这些策略对高通量蛋白质鉴定的影响,总结了各种策略的优缺点并展望了其未来发展方向。 徐长明 张纪阳 张伟 谢红卫关键词:蛋白质鉴定 质谱