仇建烨
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：江南大学理学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金环境保护公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：生物学理学自动化与计算机技术更多>>
- 基于进化树理论的甲型流感病毒血凝素同源性及进化分析被引量：1
- 2012年
- 甲型流感病毒(influenza virus A)可以感染禽类,哺乳类等动物,威胁着人类健康.本文分别选取了甲型流感病毒的血凝素(HA)的16种亚型一定数量的序列,利用MEGA(Molecular Evolutionary Genetics Analysis)4.0软件对其做同源性分析,构建HA的系统进化发生树,找出它们进化的规律,并结合2010年我国从人体分离的甲型流感病毒株的情况,利用Genbank的BLAST功能做同源性搜索,结合HA的进化树分析了我国甲型流感病毒株的现状,从而预测了潜在的甲型流感病毒血凝素对人体的威胁.
- 王伟仇建烨吴艳朱平
- 关键词：甲型流感病毒血凝素同源性系统进化树
- 基于模糊邻近关系的p53抑癌基因家族聚类分析
- 2013年
- 模糊聚类技术在揭示数据的联系及数据间的依赖关系等方面占有重要作用。作者根据模糊等价关系的性质,利用加权汉明距离法,建立了序列间的模糊邻近关系,进而构造模糊等价矩阵进行聚类分析。选取了18条人类p53及其家族成员p63、p73肿瘤蛋白mRNA序列,以序列碱基的比例为指标,进行聚类分析。发现,当λ=0.951 59时,结果分为3类,p53、p63、p73各自成为一类。从聚类角度看p53、p63、p73的结构和功能是有区别的。此方法对预测未知基因的结构和功能有一定的生物意义。
- 仇建烨浦琰朱平
- 关键词：P53P63P73聚类分析
- P53基因蛋白质序列的相似性及其聚类分析被引量：2
- 2013年
- 基于详细HP模型,先把20种氨基酸分为四类。再建立一个连续的坐标空间,对蛋白质序列进行混沌游走(CGR),把蛋白质序列中的每个氨基酸映射到平面坐标系中,每个氨基酸对应着一个点。然后用四类氨基酸的坐标值的平均值组成8维特征向量对蛋白质序列进行数值刻画,并定义向量间欧式距离为序列间的距离。最后基于这种对蛋白质序列的数学描述,对包括人类在内的8个物种的p53基因蛋白质序列进行了相似性分析和模糊聚类。结果与实际相符,表明了用此方法研究蛋白质序列相似的合理性。这对研究蛋白质序列有着重要意义。
- 仇建烨朱平
- 关键词：特征向量P53模糊聚类
