郑丽明
- 作品数:3 被引量:10H指数:1
- 供职机构:中国水产科学研究院南海水产研究所更多>>
- 发文基金:广东省海洋渔业科技推广专项项目国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 斑节对虾金属硫蛋白基因cDNA克隆与表达分析被引量:10
- 2011年
- 采用RACE-PCR方法从斑节对虾(Penaeus monodon)总RNA反转录产物中获得了502 bp的金属硫蛋白(Pm-MT)基因cDNA序列。该序列包含69 bp的5′非编码区(UTR)和256 bp的3′非编码区(UTR)以及177 bp的开放阅读框(ORF),可编码58个氨基酸。在其编码的氨基酸序列中半胱氨酸含量丰富,不含芳香族氨基酸,存在有无脊椎动物金属硫蛋白的特征序列CKCXXXCXCX,预测的分子量约为6.05 kD,理论等电点7.75。序列比对分析表明Pm-MT与北美淡水蟹(Pacifastacus leniusculus)的相似性高达91.4%,与美国龙虾(Homarus americanus)的同源性最高为84.5%。实时定量PCR显示在所检测组织中,Pm-MT的mRNA在卵巢的表达量最高,其次为胃、肠、心脏、脑和肝胰腺;Pm-MT的mRNA在斑节对虾6个不同发育期的卵巢中的表达量都很高,其中在Ⅱ期卵巢中的表达量最高。实验所得结果以期为Pm-MT进一步在卵巢发育的功能研究提供基础材料。
- 郑丽明周发林杨其彬黄建华邱丽华苏天凤江世贵
- 关键词:斑节对虾金属硫蛋白克隆
- 斑节对虾金属硫蛋白全基因DNA克隆及生物学信息分析
- 2017年
- 为深入研究斑节对虾(Penaeus monodon)金属硫蛋白MT(Pm-MT)基因参与斑节对虾性腺发育调控的分子机制,根据Pm-MT基因的c DNA序列,利用普通PCR和染色体步移(Genome Walking)技术获得Pm-MT基因的DNA全长序列,该基因序列DNA全长为2 744 bp,由2个内含子和3个外显子组成。其中启动子区域为806 bp,2个内含子长度分别为1 194、242 bp,3个外显子长度分别为22、78、77 bp。在启动子区域预测到转录因子糖皮质激素应答元件和雌激素应答元件与卵巢发育密切相关。
- 周发林郑丽明杨其彬黄建华杨丽诗江世贵
- 关键词:金属硫蛋白
- 斑节对虾钙网蛋白基因cDNA克隆和表达分析
- 2012年
- 采用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNAends,RACE)获得了1 672 bp的斑节对虾钙网蛋白(Penaeusmonodon calreticulin,PmCRT)基因cDNA序列。该序列包含37 bp的5'非编码区(UTR)和414 bp的3'非编码区(UTR)以及1 221 bp的开放阅读框(ORF),可编码406个氨基酸。预测的分子量约为46.8ku,理论等电点为4.13。序列比对分析表明PmCRT与中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)的相似性和同源性最高,分别为100%和98.8%。实时荧光定量PCR对组织表达检测的结果可知,PmCRT的mRNA在卵巢、肝胰腺、肌肉、脑、心脏、胃、眼柄和肠均有表达,卵巢的表达量最高,肌肉次之;对卵巢发育6期变化检测可知,PmCRT的mRNA在Ⅲ期卵巢表达量最高,Ⅰ期的表达量最低。以期为进一步研究该基因在斑节对虾卵巢发育中的作用提供基础数据。研究亮点:目前对斑节对虾卵巢发育的分子调控机理还知之甚少,有大量卵巢发育相关基因还不为人所知。本文研究了钙网蛋白在斑节对虾卵巢发育各期的表达谱,为阐明斑节对虾卵巢发育分子调控机理提供基础数据。
- 郑丽明周发林杨其彬黄建华邱丽华苏天凤杨丽诗江世贵
- 关键词:斑节对虾钙网蛋白克隆