张艳霞
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
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- 4种昆虫基因组中的线粒体假基因
- 2012年
- 为了进一步了解昆虫核基因组中线粒体假基因(Numts)序列分布情况,避免Numts序列对基于线粒体DNA(mtDNA)进行系统发育关系研究结果的误导,利用Blast N对GenBank中已完成核基因组和mtDNA测序的4种昆虫核基因组中的Numts序列进行检索,结果表明:冈比亚按蚊Anopheles gambiae中没有Numts序列;黑腹果蝇Drosophila melanogaster中仅有少量Numts序列;赤拟谷盗Tribolium cast-aneum和意大利蜜蜂Apis mellifera基因组中Numts序列超过100条,尤其是意大利蜜蜂中的Numts序列涵盖全部mtDNA.ND2,ND4,ND5,COⅠ与lrRNA向核内转移频率高于其他mtDNA基因片段,因此,在使用其进行系统发育关系研究时需加倍谨慎.
- 杨明茹周志军常岩林张艳霞
- 关键词：MTDNANUMTS基因组
- 暗褐蝈螽不同地理种群间的遗传分化被引量：6
- 2011年
- 利用线粒体COI基因片段研究了我国吉林、辽宁、内蒙古、河北和四川的暗褐蝈螽(Gampsocleis sedakovii)12个地理种群间的遗传分化。结果表明:36条626bp的mtDNA-COI基因片段中共检测到单倍型29种,多态位点71个,其中简约信号位点37个,单一多态位点34个。分子变异等级分析(AMOVA)的计算结果显示,群体内变异仅占总变异的37.23%,明显小于群体间变异,Fst值为0.62770,各群体间呈现明显的遗传分化。最大简约法(MP)系统发育分析结果显示,暗褐蝈螽的12个地理种群以极高的自举支持度(100%)聚类,形成两个独立的分枝。由于两个分枝的聚类结果与基于形态学特征划分的两个亚种(Gampsocleis sedakovii sedakovii和Gampsocleis sedakovii obscura)并不对应。综合采集地的生境,初步推测暗褐蝈螽两个亚种间的形态学差异可能是由于它们所处生境不同所引起。在12个地理种群中,只有内蒙古通辽(NTL)的个体在两个分枝中均有出现。单倍型分布格局研究发现,单倍型H10是内蒙古通辽(NTL)、鄂温克(NEWK)和吉林吉林(JJL)3个地理种群的共享单倍型,说明它们来自于共同的祖先。研究结果支持我国的东北地区是暗褐蝈螽遗传分化中心的观点,但不支持基于形态学特征划分的两个亚种。
- 周志军张艳霞常岩林杨明茹
- 关键词：暗褐蝈螽单倍型地理种群遗传分化
