张寻
- 作品数:5 被引量:16H指数:2
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- 部分市售鲜切水果和现制果汁饮料微生物群落结构及耐药基因特征研究
- 2024年
- 目的 分析北京市部分市售鲜切水果和现制果汁饮料微生群落结构和耐药基因分布特征。方法 采用宏基因组测序技术对食品中细菌群落进行注释,使用综合抗生素耐药性数据库(CARD)对注释到的耐药基因进行比对。结果 使用宏基因组测序注释到13 239个菌种,其中相对丰度高于0.10%的共有51个菌种,食源性致病菌有金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,3.49%),屎肠球菌(Enterococcus faecium,0.35%),宋内志贺菌(Shigella sonnei,0.33%),单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,0.27%),粪肠球菌(Enterococcus faecalis,0.26%),艰难梭菌(Clostridioides difficile,0.12%),麦氏弧菌(Vibrio metschnikovii,0.12%)和肠道沙门菌(Salmonella enterica,0.11%)。33个样品中检测到属于38个抗生素类型的855个耐药基因。结论 本研究初步了解到市售鲜切水果和现制果汁饮料中微生物群落结构和耐药基因分布,为进一步开展食品污染物监测提供了依据。
- 刘玉竹张晓嫒崔霞王迪陆峥张诣王丽丽张鹏航张寻牛彦麟陈倩马晓晨
- 关键词:耐药基因
- 2014—2018年北京市人源性肠致病性大肠埃希菌耐药特征及分子特征研究被引量:6
- 2019年
- 目的了解北京市门诊腹泻病例肠致病性大肠埃希菌(enteropathogenic Escherichia coli,EPEC)分离株抗生素敏感性情况及分子分型特征。方法采用微量肉汤稀释法对2014—2018年北京市门诊腹泻病例EPEC分离株进行8类14种抗生素敏感性检测。参照PulseNet中非O157大肠埃希菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型方法,对不同区县不同采样时间分离的菌株采用随机抽样原则,对140株菌基因组经限制性内切酶XbaⅠ酶切后进行分子分型和聚类分析。结果2014—2018年北京市门诊腹泻病例EPEC分离株总耐药率为84.8%(391/461),氨苄西林、四环素、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑耐药率较高,分别为66.4%(294/443)、54.0%(249/461)、45.6%(210/461)。461株菌分为200种耐药谱,耐3类及3类以上抗生素的菌株数达249株(54.0%),有1株菌对7类12种抗生素耐药。常见耐药谱为萘啶酸耐药,占4.3%(20/461)。环丙沙星、萘啶酸、四环素、亚胺培南耐药率和耐药谱种类呈逐年缓慢上升趋势。其中140株菌共产生136种PFGE带型,带型分布较为分散,无优势带型,菌株之间的相似系数为53.3%~100.0%。结论2014—2018年北京市腹泻病例EPEC耐药情况严重,耐药谱复杂广泛,多重耐药菌株及耐药谱种类呈逐年增多趋势。菌株的基因型呈多态性分布。
- 王丽丽张寻张寻
- 关键词:肠致病性大肠埃希菌耐药性脉冲场凝胶电泳分子分型
- 北京市市售生禽肉及社区居民冰箱耶尔森菌污染状况及分子特征研究被引量:8
- 2020年
- 目的了解北京市市售生禽肉及社区居民冰箱中耶尔森菌污染状况、生物型、血清型、毒力基因携带情况、抗生素敏感性以及分子特征。方法分批采集北京市区超市和农贸市场冷冻冷藏生禽肉60件和同期社区居民冰箱涂抹60件,进行耶尔森菌病原学检测。对分离菌株进行生物分型、血清凝集、PCR毒力基因检测、抗生素敏感性、PFGE分子分型等研究。结果生禽肉和居民冰箱耶尔森菌检出率分别为21.67%(13/60)和6.67%(4/60)。17株耶尔森菌对氯霉素、环丙沙星等10种抗生素100%敏感,对头孢唑林、氨苄西林耐药率较高,分别为76.47%(13/17)、52.94%(9/17)。2株小肠结肠炎耶尔森菌对11种抗生素耐药。除2株中间耶尔森菌不能被Not I酶切外,其他15株耶尔森菌得到14种PFGE带型,相似度为0~100%。结论耶尔森菌是北京市市售生禽肉及社区居民冰箱潜在污染源,对头孢唑林、氨苄西林耐药率较高,PFGE带型多态性分布。
- 王丽丽张寻段然陆峥魏东陈倩
- 关键词:耶尔森菌生物型毒力基因脉冲场凝胶电泳
- 果蔬样品中诺如病毒快速检测方法的研究被引量:1
- 2017年
- 目的建立果蔬样品表面诺如病毒快速有效的检测方法,评价酸吸附-碱洗脱-PEG沉淀法对果蔬样品表面诺如病毒分离富集的适用性,为诺如病毒疫情的控制和食源性疾病的溯源提供可靠的实验室依据。方法在北京地区采集草莓样品,采用酸吸附-碱洗脱-PEG方法分离富集样品表面病毒颗粒,设计GⅠ和GⅡ的特异性引物和探针,以实时定量RT-PCR法检测病毒核酸。同时优化病毒提取方法,以Mengo病毒做为过程控制对照,制作不同浓度的标准曲线,计算病毒回收率。结果酸吸附-碱洗脱-PEG法病毒回收率为2.36%,符合病毒检测回收率的要求,与其他食源性病毒没有交叉反应,能够应用于日常检测。结论酸吸附-碱洗脱-PEG方法病毒回收率较高,灵敏度和重复性较好,进一步优化后可以应用于果蔬样品的日常检测。
- 张寻陈倩
- 关键词:诺如病毒草莓荧光定量PCR
- 2014~2018年北京市人源性肠产毒性大肠埃希菌耐药性与PFGE分子分型研究被引量:1
- 2019年
- 目的分析北京市门诊腹泻病例肠产毒性大肠埃希菌(enterotoxigenic Escherichiacoli,ETEC)分离株抗生素敏感性及分子分型特征。方法采用微量肉汤稀释法对2014~2018年北京市门诊腹泻病例ETEC分离株进行8大类14种抗生素敏感性检测。参照PulseNet中非O157大肠埃希菌脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型方法,对不同区县不同采样时间分离的菌株采用随机抽样原则,对178株菌基因组经限制性内切酶Xba I酶切后进行分子分型和聚类分析。结果 578株2014~2018年北京市门诊腹泻病例ETEC菌株总耐药率为94.29%,对萘啶酸、氨苄西林、头孢唑林耐药率较高,分别为61.58%、60.38%、36.19%。578株菌分为152个耐药谱,耐3种及3种以上抗生素的菌株数达340株(59.00%),有1株菌对12种抗生素耐药。常见耐药谱为耐喹诺酮类的萘啶酸,占20.18%,其次为耐β-内酰胺类的氨苄西林-头孢唑林-头孢噻肟,占12.29%,再次为耐β-内酰胺类的氨苄西林-喹诺酮类的萘啶酸-大环内酯类的阿奇霉素,占6.79%,且耐药谱种类逐年缓慢上升。其中178株菌共产生153种PFGE带型,带型分布较为分散,无优势带型,菌株之间的相似系数为31.60%~100.0%。结论 2014~2018年北京市腹泻病例肠产毒性大肠埃希菌耐药情况严重,耐药谱复杂广泛,多重耐药菌株占比呈逐年缓慢上升趋势。PFGE带型呈多态性分布。
- 王丽丽张寻陆峥张诣陈倩
- 关键词:病人肠产毒性大肠埃希菌耐药性脉冲场凝胶电泳分子分型