刘雷
- 作品数:2 被引量:1H指数:1
- 供职机构:内蒙古工业大学理学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金内蒙古自治区高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- Recognizing Fold Types and Structure Classes of Protein Fold with Support Vector Machine
- The protein fold,which is a common 3-dimensional pattern with the same major secondary structure elements in t...
- 刘雷胡秀珍
- 文献传递
- 基于添加模体信息和功率谱密度的组合向量预测27类蛋白质折叠子被引量:1
- 2010年
- 以序列相似性低于40%的1895条蛋白质序列构建涵盖27个折叠类型的蛋白质折叠子数据库,从蛋白质序列出发,用模体频数值、低频功率谱密度值、氨基酸组分、预测的二级结构信息和自相关函数值构成组合向量表示蛋白质序列信息,采用支持向量机算法,基于整体分类策略,对27类蛋白质折叠子的折叠类型进行预测,独立检验的预测精度达到了66.67%。同时,以同样的特征参数和算法对27类折叠子的4个结构类型进行了预测,独立检验的预测精度达到了89.24%。将同样的方法用于前人使用过的27类折叠子数据库,得到了好于前人的预测结果。
- 刘雷胡秀珍
- 关键词:功率谱密度支持向量机