王婷婷
- 作品数:3 被引量:4H指数:1
- 供职机构:东北农业大学园艺学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金黑龙江省博士后科研启动基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 番茄热激转录因子HSF家族的系统进化分析被引量:4
- 2016年
- 热激转录因子(heat Shock factors)普遍存在于整个生物界中,在调控植物生长发育以及对环境的响应中起重要作用。目前,已经对多个物种的HSF基因进行生物信息学分析,但未见对番茄中HSF基因家族的分析报道。通过番茄基因组数据库,鉴定和分析番茄HSF转录因子家族,获得24个HSF基因家族成员。多重序列比对发现番茄HSF基因具有保守的DBD结构域和广泛的保守基序。根据与拟南芥基因系统进化分析将这些基因分类,分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ支,又将Ⅰ支分成A、B、C 3个亚支,并且存在5对旁系同源蛋白和10对直系同源蛋白。染色体分布和遗传分析结果表明,番茄HSF基因存在于10条染色体上,呈不均匀分布。
- 王婷婷仇有文王沛文陈宏宇杨俊颖王窦逗伍淼王傲雪
- 关键词:番茄基因家族系统进化
- 牛粪堆肥中厌氧氨氧化菌分子生物学检测
- 2016年
- 研究利用PCR-DGGE方法对堆肥中厌氧氨氧化菌16S r RNA基因特异扩增,检测堆肥厌氧氨氧化菌种属及多样性水平。结果表明,牛粪堆肥中厌氧氨氧化菌群组成与海洋环境不同。海洋环境中Candidatus Scalindua属厌氧氨氧化菌为优势菌群,而牛粪堆肥中厌氧氨氧化菌中优势菌属为Candidatus Brocadia、Candidatus Kuenenia和Candidatus Scalindua,多样性相对较高。可为堆肥发酵过程中厌氧氨氧化过程提供分子生物学依据。
- 许修宏王婷婷孟庆欣孙雪微成利军张文浩孙瑜任广明朱丽平王紫琪贺宁
- 关键词:厌氧氨氧化菌堆肥
- 粉红粘帚菌几丁质酶基因cDNA克隆及表达
- 2015年
- 为研究粉红粘帚菌(Clonostachys rosea)生防机制并获得生物防治相关基因,文章利用RT-PCR方法克隆粉红粘帚菌1个几丁质酶基因T-ech42,对该基因进行生物信息学分析,并在大肠杆菌原核表达系统中进行外源表达。该基因长度为1 263 bp,编码420个氨基酸。推导T-ech42氨基酸序列以及蛋白质结构的生物信息学分析表明,该蛋白等电点为5.85,理论分子质量为45.13 ku,N端含信号肽,长度为20个氨基酸;T-ech42属于糖基水解酶18家族内切几丁质酶,包含SIGGW底物结合位点和FDGIDXDWE活性位点。将该基因构建到原核表达载体p ET-22b(+)上,转化至大肠杆菌BL21(DE3)菌株中,经终浓度1 mmol·L-1的IPTG诱导4 h后,可见酶蛋白活性表达。
- 王傲雪于秋王沛文王婷婷杨俊颖王窦逗伍淼
- 关键词:几丁质酶基因克隆