王佳佳
- 作品数：24 被引量：16H指数：2
- 供职机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)近交系3个家系33个微卫星座位的遗传分析被引量：7
- 2017年
- 本研究以人工控制条件下采用兄妹交配方式建立的脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)近交系为实验材料,利用33个微卫星座位对近交系3个家系进行了遗传检测。统计各家系的等位基因组成,计算等位基因数(N)、杂合度(H)、多态信息含量(PIC)、平均基因纯合率等遗传参数,利用基因频率计算家系间的遗传距离,并进行聚类分析。结果显示,33个微卫星基因座上共检测到72个等位基因,总群体平均N、H、PIC分别为2.758、0.294、0.272;3个家系的平均N、H、PIC分别为2.258、0.226、0.214;2.469、0.283、0.300;2.219、0.268、0.207;可作为3个家系特异标志位点的基因座分别有2个、4个和1个。聚类分析表明,A系和B系先聚为一支,然后与H系聚在一起。研究结果揭示了脊尾白虾3个近交系在33个微卫星基因座上的遗传变异规律,表明近交家系已达到一定的近交程度;发现各家系潜在的标志基因座,各家系均已构成独立遗传群体。
- 王日芳李健李吉涛王佳佳刘萍
- 关键词：脊尾白虾近交系微卫星
- 中国对虾雌性特异性基因及其检测引物和应用
- 本发明公开了中国对虾雌性特异性基因及其检测引物和应用。所述特异性基因的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示，用于检测的特异性引物的序列为：Female‑specific‑F：5’‑TGGATGCAGCAGGATTAAG...
- 王琼何玉英任宪云吕建建王佳佳刘萍李健
- 十足目甲壳动物的EST-SSR分析
- 2019年
- 本研究应用生物信息学方法,对21种十足目甲壳动物EST-SSR的特点进行了归纳总结和分析。结果显示,不同物种间的EST-SSR丰度存在明显差异,腹胚亚目中脊尾白虾(Exopalaemoncarinicauda)的EST-SSR位点最为丰富(868.02个/Mb),拟穴青蟹(Scylla paramamosain)位点丰度最低(286.48个/Mb);枝鳃亚目中斑节对虾(Penaeus monodon)EST-SSR位点最为丰富(641.19个/Mb),白滨对虾(Litopenaeus setiferus)位点丰度最低(166.96个/Mb);腹胚亚目和枝鳃亚目中均是二、三、四核苷酸基元的SSR较为常见,在腹胚亚目中占总数的41.11%,在枝鳃亚目中占总数的28.00%;复合(Ⅰ)类型的SSR在腹胚亚目(51.38%)和枝鳃亚目(65.13%)中占很大比例;腹胚亚目二核苷酸基元的SSR中AC/GT分布频率最高,三核苷酸基元的SSR中ACC/GGT和AAT/ATT占优势;枝鳃亚目二核苷酸基元的SSR中AG/CT占优势,三核苷酸基元的SSR中AAT/ATT的分布频率高于其他三核苷酸基元。此外,对脊尾白虾含有SSR的EST进行GO分析后发现,细胞代谢过程、链接产物、细胞组分和细胞的比例分别在3个类型的注释中占优势。本研究加深了对十足目甲壳动物SSR分布规律的认识,可为甲壳动物EST-SSR标记的开发及实际应用提供参考。
- 高海钰李健王佳佳李吉涛
- 关键词：十足目甲壳动物EST-SSR
- 脊尾白虾EcERR基因的克隆与表达分析
- 2022年
- 雌激素相关受体(estrogen-related receptor,ERR)是一种真核转录因子,与雌激素的效应有密切关系,参与生物体的能量代谢、细胞增殖分化和性腺发育等生理过程。为了解ERR基因在脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)卵巢发育中的作用,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE)克隆获得脊尾白虾EcERR基因的c DNA序列,该基因全长为2025 bp,包括5′非编码区241 bp,3′非编码区410bp,开放阅读框1374bp,编码457个氨基酸。组织表达分析结果显示,EcERR在脊尾白虾各组织中均有表达,卵巢组织的表达量最高(P<0.05);EcERR在卵裂期的表达量显著高于胚胎及幼体发育时期(P<0.05);EcERR在卵巢发育过程中呈先降低后升高的趋势,卵巢发育Ⅰ期的表达量最高;5-羟色胺浸泡后,实验组EcERR的表达量显著高于对照组(P<0.05),同时,实验组卵巢发育关键基因卵黄蛋白原基因的表达量显著高于对照组(P<0.05)。研究表明,EcERR基因参与了脊尾白虾卵巢发育的调控,在脊尾白虾卵巢发育的早期发挥关键作用。
- 张春霞李健李吉涛王佳佳李文洋李明栋
- 关键词：脊尾白虾雌激素相关受体卵巢发育5-羟色胺基因表达
- 中国明对虾NHE3基因克隆及其在pH胁迫下的表达被引量：2
- 2018年
- 为研究钠/氢交换体(Na+/H+-exchanger,NHE)在中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)响应pH胁迫过程中发挥的作用,首先采用静水毒性实验方法确定了中国明对虾酸碱半致死pH,然后利用RACE技术克隆了中国明对虾Na+/H+-exchanger isoform 3(命名为FcNHE3)基因,并通过荧光定量PCR及RNA干扰技术分析了其在pH胁迫下的表达特征及功能。结果显示,72 h酸性半致死pH和碱性半致死pH分别为5.2和9.1。克隆获得FcNHE3基因(Gen Bank:MF373587)cDNA序列全长3508 bp,开放阅读框2805 bp,编码934个氨基酸,具有信号肽和12个跨膜结构域;蛋白同源分析发现,FcNHE3与青蟹(Carcinus maenas)同源性最高,达到74%;系统进化分析显示,FcNHE3与三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)和青蟹亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明,FcNHE3基因在鳃组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05);酸性半致死pH(pH 5.2)胁迫下,FcNHE3基因在整个胁迫过程中显著上调表达(P<0.05);碱性半致死pH(pH 9.1)胁迫下,FcNHE3基因在前48 h显著下调表达(P<0.05),12 h表达量最低,仅在72 h出现上调表达。RNA干扰后,FcNHE3基因表达受到抑制,pH 5.2胁迫下对虾存活率相比对照组显著下降。研究表明相较于高pH胁迫,FcNHE3基因在中国明对虾响应低pH胁迫过程中可能发挥更重要的调节作用。
- 李政道李健葛倩倩葛倩倩王佳佳何玉英
- 关键词：中国明对虾基因克隆PH胁迫RNA干扰
- 凡纳滨对虾微卫星标记的引物组合及应用
- 本发明涉及一种凡纳滨对虾微卫星标记的引物组合及应用，属于分子生物学技术领域，微卫星分子标记的核苷酸序列依次如SEQ ID No.1‑14所示，所述微卫星分子标记引物的核苷酸序列如SEQ ID No.15‑42；微卫星分子...
- 王佳佳李吉涛李健刘萍王琼秦桢
- 文献传递
- 盐碱水环境对脊尾白虾基因组DNA甲基化的影响被引量：1
- 2022年
- 为探讨盐碱水环境对脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)基因组DNA甲基化的影响,本研究利用MethylRAD-Seq技术探究了长期盐碱水养殖组(SAS)和正常海水养殖对照组(SW)脊尾白虾鳃组织中的DNA甲基化水平,并对关键通路和基因进行了差异表达分析。结果显示,脊尾白虾鳃组织基因组中CG和CWG位点(W=A或T)分别检测到2347003和416176处甲基化,甲基化普遍存在于基因组的基因间区和内含子区域,共筛选到8805个(8189个CG-DMSs和616个CWG-DMSs)差异甲基化位点,盐碱水环境下DNA甲基化水平略有增强。通过KEGG富集分析发现,DMS所在差异表达基因显著富集在HIF-1信号通路和剪接体通路,通路中hif-p、hk和sf3b1等关键基因在脊尾白虾盐碱水环境适应中可能发挥着重要作用;对SW和SAS组差异甲基化基因(DMG)进行筛选,得到158个CG-DMGs和94个CWG-DMGs,其中,富集到脂质代谢和囊泡介导的转运通路中的DMG最多;此外,有一些DNA甲基化位点与基因表达呈负相关,表明DNA甲基化与基因调控之间存在复杂的联系,大部分基因组DNA甲基化对基因表达有正调控效应。本研究结果首次分析了在盐碱水环境下脊尾白虾鳃组织的DNA甲基化水平特征,为解析甲壳类盐碱水环境适应机制提供了基础信息。
- 秦桢李吉涛李明栋王佳佳葛倩倩刘萍李健
- 关键词：脊尾白虾DNA甲基化差异表达基因
- 脊尾白虾水通道蛋白基因4和11在碱度胁迫过程中的作用被引量：1
- 2022年
- 水通道蛋白(aquaporin)是一种细胞膜上特异性转运水分子及其他中性代谢分子的膜蛋白家族,对生物的细胞内外渗透压稳定具有重要的调节作用。为了了解水通道蛋白在脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)应对碱度胁迫中的作用,本研究利用RACE技术成功克隆了脊尾白虾水通道蛋白4(aquaporin 4,EcAQP4)与水通道蛋白11(aquaporin 11,EcAQP11)基因cDNA全长,EcAQP4基因的开放阅读框为621 bp,编码206个氨基酸,预测分子量为21.673 kDa,理论等电点为8.30,为疏水性蛋白,具有5个跨膜结构域;EcAQP11基因的开放阅读框长度为783 bp,编码260个氨基酸,预测蛋白分子量为28.490 kDa,理论等电点为5.40,为疏水性蛋白,具有4个跨膜结构域。序列比对结果显示,EcAQP4基因与罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)同源性最高,为94.63%;EcAQP11与斑节对虾(Penaeus monodon)同源性最高,为81.47%。为验证水通道蛋白的功能,利用RNA干扰技术特异性沉默EcAQP4和EcAQP11基因,结果显示,碳酸盐碱度胁迫后,注射干扰后的脊尾白虾死亡率显著升高,EcAQP4干扰组72 h死亡率达到45%,EcAQP11干扰组72 h死亡率达到55%,与对照组差异显著(P<0.05)。同时发现,EcAQP4干扰组在碳酸盐碱度胁迫24、48与72 h时的血液渗透压变化幅度显著高于对照组(P<0.05),72 h时渗透压显著升高(P<0.05);EcAQP11干扰组血液渗透压在3个时间点均显著升高(P<0.05)。以上结果表明,水通道蛋白在脊尾白虾应对碱度胁迫过程中起到了调节渗透压、维持体内外离子平衡的作用。
- 李明栋王佳佳葛倩倩葛倩倩刘萍李健刘萍
- 关键词：脊尾白虾水通道蛋白基因克隆渗透压
- 凡纳滨对虾微卫星标记的引物组合及应用
- 本发明涉及一种凡纳滨对虾微卫星标记的引物组合及应用，属于分子生物学技术领域，微卫星分子标记的核苷酸序列依次如SEQ ID No.1‑14所示，所述微卫星分子标记引物的核苷酸序列如SEQ ID No.15‑42；微卫星分子...
- 王佳佳李吉涛李健刘萍王琼秦桢
- 文献传递
- 一种中国对虾核心育种群WSSV的净化方法
- 本发明公开了一种中国对虾核心育种群WSSV的净化方法，包括以下步骤：收集越冬池中中国对虾亲虾粪便进行WSSV检测，淘汰检测结果为阳性的越冬池中的亲虾；对选留的亲虾进行单个检测，淘汰检测结果为阳性的个体；选留亲虾产卵孵化后...
- 何玉英王琼常志强王佳佳李健
- 文献传递
