陈小燕
- 作品数：2 被引量：23H指数：1
- 供职机构：龙岩学院生命科学学院更多>>
- 发文基金：福建省科技重大专项龙岩市科技计划项目福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 福建省新发猪圆环病毒3型流行病学调查及遗传变异分析被引量：22
- 2018年
- 猪圆环病毒3型(PCV3)是新发现的一种猪圆环病毒,该病毒可以引起猪皮炎与肾病综合征(PDNS)、母猪繁殖障碍和全身多器官的炎症反应。为了解福建省PCV3流行株的现状、分子生物学特征和遗传演化规律,本研究采集福建地区规模化猪场120份临床表现繁殖障碍和呼吸道疾病的组织样品,采用PCR方法对其进行PCV3检测。结果显示福建省猪场PCV3的感染率为12.5%。对福建省5株PCV3全基因组进行序列分析,结果显示,5株PCV3间核苷酸同源性为98.2%~99.6%,与国内PCV3分离株的核苷酸同源性为97.6%~100%,与美国分离株(PCV3-US/MO2015、PCV3-US/MN2016、PCV3-US/SD2016、PCV3 2164和PCV3 29160)的核苷酸同源性为97.8%~99.3%,而与PCV2的核苷酸同源性为43.8%~44.1%,与我国蝙蝠圆环病毒的核苷酸同源性为49.2%~51.1%。PCV3系统进化树结果显示,福建省5株PCV3处于3大亚群,1株属于3a亚群,1株属于3b亚群,3株属于3c亚群。其氨基酸序列分析显示PCV3 Cap蛋白比较保守,仅存在个别位点的氨基酸突变。本研究为福建省PCV3的分子流行病学、疫苗研究和有效防控提供实验依据。
- 刘建奎魏春华魏春华虞慧芸陈小燕范佳霖戴爱玲吴昌标杨小燕
- 2012年-2014年闽西地区PRRSV流行株ORF5基因遗传变异分析被引量：1
- 2016年
- 为了研究2012年-2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行毒株的分子生物学特性和变异规律，对分离自闽西多个地区25份疑似PRRS病料的10个PRRSV分离株，应用RT—PCR对其中ORF5基因进行扩增及序列分析，从而了解闽西地区PRRSV的遗传变异性。结果表明，10个毒株均为美洲型PRRSV，9株PRRSVORF5基因全长为603bp（FJ05为600bp），10个毒株ORF5基因之间的核苷酸同源性为88．4％～99．3％；与VR-2332、MLV和CH-1a毒株的核苷酸同源性为88．3％～98．8％，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．9％～99．0％，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为63．8％～65．09／6。ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9—40位和58—62位，10株PRRSVoRF5氨基酸同源性为88．5％～99．5％；与VR-2332、MLV和CH-1a的氨基酸同源性为87．5％～98．5％，与我国高致病性代表毒株JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．0％～99．5％，与欧洲型毒株代表毒株LV的同源性为56．6％～59．2％。遗传进化树表明，闽西地区PRRSV可以分为疫苗株（1株，10％）、中等毒力PRRSV（1株，10％）和HP—PRRSV（8株，809／6）3个亚群，其中以HP—PRRSV为主，表明闽西地区PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性。
- 黄春芳刘建奎龚丽珍杨炳辉曾建平陈安妮陈小燕
- 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因反转录-聚合酶链反应
