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潘雪莲
作品数:
2
被引量:17
H指数:2
供职机构:
南京大学环境学院污染控制与资源化研究国家重点实验室
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
生物学
环境科学与工程
天文地球
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合作作者
黄晟
南京大学地球科学与工程学院
陈旸
南京大学地球科学与工程学院
崔益斌
南京大学环境学院污染控制与资源...
郭晓峰
南京大学环境学院污染控制与资源...
徐军
南京大学环境学院污染控制与资源...
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甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA文库的构建与组成初步分析
被引量:2
2012年
对黄土高原西峰地区黄土沉积物中的有机质进行了总DNA提取和PCR(聚合酶链式反应)扩增,通过克隆测序技术构建了含有44个克隆子的细菌16SrDNA文库。对16SrDNA系统发育的分析表明,西峰地区的黄土沉积物中细菌可分属13个类群,包括:酸杆菌(Acidobacteria)、变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)、厚壁菌(Firmicutes)、疣微菌(Verrucomicrobia)、浮霉菌(Planctomycetes)、芽单胞菌(Gemmatimonadetes)、异常球菌—栖热菌(Deinococcus-Thermus)、硝化螺旋菌(Nitrospirae)、蓝细菌(Cyanobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)和Candidate division TG1。其中酸杆菌为最主要优势类群,变形菌为次优势类群,二者占黄土细菌总克隆数的70%,且大多为不可培养的基因型。
黄晟
陈旸
潘雪莲
崔益斌
季峻峰
陈骏
关键词:
黄土
细菌多样性
黄土高原土壤中细菌群落结构多样性的PCR-DGGE分析
被引量:15
2009年
利用细菌通用引物,对从黄土高原5个地区土壤样品以及西峰剖面26个土壤样品中提取的总DNA进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对PCR产物进行分析,以揭示黄土高原土壤中细菌群落结构的多样性。针对黄土高原土壤微生物特点进行DGGE试验条件优化,获得最佳变性梯度为40%~70%,最佳电泳时间为17h(100V)。对不同深度土壤细菌DGGE图谱的聚类分析表明,不同深度土壤细菌呈现2种不同的群落结构,推测其成因可能与季风性气候引起的温湿环境变化及冰期有关。在夏季风加强而冬季风减弱的时期,气候温暖潮湿,风化成壤作用强烈,在DGGE图谱中表现为土壤样品条带多而密;反之,风化成壤作用较弱,在DGGE图谱中表现为条带少而疏。对洛川、西峰等5个地区土壤细菌Shannon—Weiner指数的测定结果表明,Shannon—Weiner指数受条带亮度及迁移率的影响。
潘雪莲
黄晟
方昊
徐军
郭晓峰
陈旸
崔益斌
关键词:
黄土高原
微生物多样性
群落结构
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