孙添添
- 作品数：11 被引量：15H指数：2
- 供职机构：吉林师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金四平市科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生文化科学更多>>
- 表观遗传学药物诱导细胞凋亡机制系统生物学研究进展
- 2016年
- 表观遗传学药物就是通过改变表观遗传学修饰状态诱导肿瘤细胞发生凋亡的一类物质.表观遗传学药物能够在"线粒体呼吸链"等内源性凋亡相关通路内诱导特定基因发生时间特异性差异表达,并且表观遗传学修饰模式变化与基因表达和功能都密切相关.现阶段关于表观遗传学药物凋亡诱导机制的了解大部分是定性或描述性的,对于凋亡响应所涉及多个生物学过程的动态整合和内在调控机制的认识仍然十分缺乏.我们根据现阶段研究所存在的问题,提出合理化建议:首先,收集整理相关数据构建表观遗传学药物数据库.其次,基于跨组学数据分析的系统生物学建模策略,构建表观遗传学药物凋亡诱导模型.最后,评估不同表观遗传学修饰状态下细胞发生凋亡的时间和概率分布,从而促进表观遗传学药物诱导细胞凋亡机制的研究.
- 齐云峰王仁俊金太成杨丽萍孙添添关壬铨
- 关键词：细胞凋亡信号通路
- DNA甲基化数据的可视化分析
- 2017年
- DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,在生长发育、基因调控、染色质结构、分子印记以及许多疾病中起着至关重要的作用.随着各种测序技术的不断发展产生了大量的DNA甲基化数据,对其数据进行分析是目前DNA甲基化研究的一个热点和难点.目前针对于DNA甲基化数据的研究主要体现在基因组的局部区域上,而针对全基因组的分析则无法直观表现.为了更加直观的分析同一位点不同修饰信号的DNA甲基化数据间的差别,本文采用了一种专门针对表观遗传研究的数据库—WashU Epigenome Browser,针对人类表观遗传学药物数据库(HEDD)中的疾病数据,可视化的分析不同修饰信号间的差异并用数据波峰图来解释说明.
- 齐云峰郝树琳姜茜牛晓玲孙添添于长春
- 关键词：DNA甲基化表观遗传学可视化分析
- 基于系统生物学的干扰素-γ建模的信号转导模式分析
- 2016年
- 干扰素-γ是细胞因子超家族中干扰素家族的成员,具有抗微生物感染及免疫调节等多种生物学功能。系统生物学主要采用系统的方法研究生物体不同层次的建模与仿真、各种信号转导途径、基因调控网络等。本文采用系统生物学建模工具COPASI对干扰素-γ的信号转导进行模拟,并应用统计学方法进行检验,通过模拟分别改变干扰素-γ受体(IFNR)和磷酸酶PP2的初始浓度,研究二者浓度改变对细胞核内STAT同源二聚体浓度变化的影响。进而研究它们在干扰素-γ信号转导过程中的协同作用。
- 齐云峰孙添添常红玲
- 关键词：系统生物学干扰素-Γ信号转导
- 表观遗传因子在不同基因组区域的分布模式研究被引量：1
- 2019年
- 应用人类CD4阳性T细胞表观遗传因子高通量定位、DNA甲基化修饰和基因表达谱数据,对基因启动子、外显子和内含子区域间的表观遗传因子分布模式进行了分析;同时,研究了不同基因组区域基因表达状态与表观遗传因子分布模式的内在关系,并应用功能富集分析阐释了表观遗传因子协同调控模式与基因功能的相关性.结果表明:DNA甲基化等表观遗传因子的分布模式在启动子、外显子和内含子区域间存在显著差异,并且表观遗传因子分布模式与基因表达状态密切相关.DNA甲基化与其他表观遗传因子间存在组合调控,拥有特定调控模式的相关基因与人类CD4阳性T细胞所行使的免疫系统过程、免疫应答、白细胞活性和淋巴细胞活性等生物学功能显著相关.
- 齐云峰王仁俊金太成杨丽萍孙添添
- 关键词：表观遗传学基因表达
- ATP基因突变与乳腺癌相关性分析
- 2021年
- 对41例女性乳腺癌患者带毛囊毛发线粒体DNA的编码区ATP基因(ATP6和ATP8)进行测序,对比45例正常人群线粒体DNA基因序列,采用统计学分析软件筛选具有统计学差异的突变位点,共检测到ATP基因突变位点25个,其中在ATP6亚基上共发现18个(72%)基因突变,其中8584G-A、8701A-G、8794C-T、8860A-G、8865G-A、8964C-T、9053G-A、9180A-G位点具有统计学差异(P<0.05);ATP8亚基上发现7个(28%)基因突变,其中8414C-T具有统计学差异(P<0.05).结果表明,ATP基因突变与乳腺癌具有显著相关性,ATP基因突变可作为一种潜在的特异性分子标记,对乳腺癌早期诊断具有重要意义.
- 于长春孟飞孙添添
- 关键词：乳腺癌线粒体DNA突变
- 三个不同地区黑枸杞花青素的抗氧化活性分析被引量：9
- 2019年
- 以野生黑枸杞为原材料,对其花青素进行含量测定及抗氧化活性分析.对比酶解前后宁夏、新疆、青海地区的黑枸杞中花青素提取含量,发现酶解后提取液中花青素含量提高了40%左右.通过对黑枸杞中花青素的抗氧化能力测定发现三个地区的黑枸杞中花青素的抗氧化能力相接近且随着底物浓度的升高而增强,其中青海地区黑枸杞花青素的抗氧化能力较高于其他两个地区.
- 于长春孙添添
- 关键词：花青素抗氧化性
