王颖芳
- 作品数：3 被引量：17H指数：2
- 供职机构：广东药科大学中药学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选被引量：10
- 2017年
- 目的筛选适用于转录组测序的人参根组织总RNA提取方法。方法以15年生长白山人参为研究对象,比较RNAiso Plus法、Trizol法、改良CTAB法、植物总RNA提取试剂盒、多糖多酚总RNA提取试剂盒(RNA prep Pure Plant Kit)提取人参根组织总RNA,利用琼脂糖凝胶电泳、Aligent 2100Bioanalyzer对5种方法提取的总RNA进行质量检测。结果 Trizol法和RNAiso Plus法均能提取到总RNA,1%琼脂糖凝胶电泳显示28S、18S条带清晰稳定,D(γ)_(260 nm)/D(γ)_(280 nm)和D(γ)_(260 nm)/D(γ)_(230 nm)值均在2.0左右。Trizol试剂法提取总RNA的28S条带亮度明显高于18S,所得RNA浓度达485.66 ng/μL,经Aligent 2100 Bioanalyzer检测,28S条带亮度是18S的2倍。RNA prep Pure Plant Kit试剂盒及植物总RNA提取试剂盒提取RNA的条带模糊、弥散,RNA降解严重。改良CTAB法无法完成人参根组织总RNA的提取。结论 Trizol试剂法提取的人参根组织总RNA浓度、纯度及完整性与其他方法相比效果最佳,能满足转录组测序的要求,是人参根组织总RNA提取的首选方法。
- 王颖芳陈艳琳王文娟
- 关键词：总RNART-PCRRNA-SEQ
- 白花蛇舌草总RNA提取方法比较与优化被引量：2
- 2016年
- 目的探索白花蛇舌草总RNA最佳提取方法。方法以广东产白花蛇舌草为材料,选用Trizol法、多糖多酚总RNA提取试剂盒(RNA prep Pure Plant Kit)、植物总RNA提取试剂盒、改良CTAB法、RNAiso Plus法提取蛇舌草根和叶总RNA,经琼脂糖凝胶电泳及Aligent 2100检测,比较5种提取方法所得总RNA的完整性、纯度及产率。结果 RNA prep Pure Plant Kit及植物总RNA提取试剂盒均能提取到总RNA,1.5%琼脂糖凝胶电泳显示28S、18S条带清晰,前者亮度高于后者。RNA prep Pure Plant Kit中D(γ)_(260 nm)/D(γ)_(280 nm)和D(γ)_(260 nm)/D(γ)_(230 nm)值均在2.0左右,叶片组织RNA质量浓度为390.35 mg/L,经Aligent 2100检测,28S条带亮度是18S的2倍。改良CTAB法所得RNA 28S和18S条带稳定清晰,但受基因组污染严重。RNAiso Plus和Trizol法无法完成蛇舌草总RNA的提取。结论不同植物、不同品种或同一植物不同部位皆存在属性差异,要根据植物特性选择合适的RNA提取方法。RNA prep Pure Plant Kit提取蛇舌草根、叶片RNA效果较优,可满足后续试验要求。
- 陈艳琳王颖芳
- 关键词：白花蛇舌草总RNA
- microRNA定量检测方法研究现状被引量：5
- 2016年
- MicroRNA（miRNA）是一类由18-24 nt核酸构成的非编码内源性小分子RNA,主要参与真核生物的细胞分化、增殖与凋亡等转录后水平的基因表达调控。研究发现,miRNA与肿瘤、代谢调控、疾病发生及诊断等方面有密切的联系,因此准确且灵敏地进行miRNA的定量检测是深入研究miRNA功能的前提。目前,miRNA定量检测原理主要基于核酸杂交或扩增,包括Northern印迹、微阵列芯片、实时定量PCR、滚环扩增等。本文通过对传统miRNA检测方法、高灵敏度新型miRNA检测方法进行阐述与分析,为筛选合适的miRNA定量检测方法提供参考。
- 陈艳琳王颖芳
- 关键词：MICRORNA实时定量PCR滚环扩增NORTHERN印迹
