李海波
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：武汉轻工大学生物与制药工程学院更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- Rv1635c基因及其编码蛋白质基本特性及抗原表位的生物信息学分析被引量：1
- 2017年
- 对基因Rv1635c进行生物信息学分析,并对其T、B细胞的抗原表位性进行预测和筛选。用软件ProtParam、SingnalP、TMHMM分别对该基因编码蛋白质的理化性质、信号肽区进行分析预测。以NetMHC、Bimas、NetCTL和SYFPEITHI四个软件来预测分析Rv1635c的T细胞表位。采用IEDB和Bcepred来预测该基因的B细胞表位。分析结果为该基因编码的蛋白质原子总数8573,氨基酸数目556,分子质量60035.23,理论等电点9.84,理论分子式C_(2772)H_(4323)N_(747)O_(717)S_(14),估计半衰期30 h,不稳定指数39;由SignalP分析得到其不含信号肽;根据TMHMM分析可知Rv1635c为跨膜蛋白;T、B细胞表位预测显示该基因至少含有一个潜在的T、B细胞表位,可为未来疾病的预防、诊断和治疗提供理论基础。
- 赵隆麒李海波吴启航王心倩孙妍占卫红余晓丽
- 关键词：生物信息学
- Rv3457c基因及其编码蛋白基本特性及抗原表位的生物信息学分析
- 2016年
- 运用生物信息学对Rv3457c基因编码蛋白的主要特征进行分析,同时预测并筛选其T/B细胞表位。运用Prot Param、Singnal P、TMHMM来分析基因编码蛋白的理化性质、信号肽区、跨膜区;运用Net MHC、Bimas、Net CTL和SYFPEITHI对其T、B细胞进行细胞表位分析预测。得到该基因编码蛋白由1 044个氨基酸组成,原子数为10 498,理论分子式为C2980H4918N1044O1216S340,分子质量为85.7284 KD,等电点的理论值为4.99,半衰期估计值4.4 h,不稳定系数52.31,平均亲水性0.938,脂肪系数20.11;含有潜在T细胞表位和B细胞表位。得出至少含有一个T细胞和一个B细胞表位,可作为疫苗的研制提供基础。
- 赵隆麒王心倩孙妍占卫红吴启航李海波余晓丽
- 关键词：生物信息学
