郑红梅
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：常熟理工学院生物与食品工程学院更多>>
- 发文基金：教育部留学回国人员科研启动基金江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 松江鲈MyoD基因cDNA部分片段的序列和表达特征分析
- 2012年
- 生肌决定因子MyoD是生肌调节因子MRFs家族的一个重要成员,在基因转录调控中起着重要的作用.本实验通过RT-PCR和3’-RACE等方法,以松江鲈肌肉总RNA为模板,扩增出957bp的MyoD基因部分序列,包含部分编码区长567bp,编码翻译188个氨基酸残基,3’-UTR区长390bp.系统发育分析表明,松江鲈MyoD与奥尼罗非鱼亲缘关系最近.不同组织半定量分析显示,松江鲈MyoD在各种组织中均有表达,在心脏中表达量最高,预示着在不同组织中该基因的功能广泛.
- 蔡宝平李风鸣郑红梅杨磊邵芳卢祥云顾志良
- 关键词：松江鲈
- 松江鲈MRF4基因克隆与组织表达分析
- 2013年
- MRF4(myf6或herculin)基因属于MyoD家族成员之一,为成肌细胞分化成肌管的重要调控因子.本实验以松江鲈(Trachidermus fasciatus)肌肉总RNA为模板,采用RT-PCR结合RACE的方法,获得1 049 bp全长cDNA序列,包含了1个含有720个核苷酸的开放性阅读框(ORF),共编码239个氨基酸.其编码区序列与石斑鱼同源性最高、为91.81%,其次是东方红鳍鲀、为83.40%,与哺乳类、鸟类的同源性在65%左右,与爪蟾同源性最低仅为59.65%.预测松江鲈MRF4蛋白具有保守的HLH结构域,bHLH结构域形成剪刀状α-螺旋二聚体.用荧光定量PCR方法检测发现,MRF4基因的mRNA在松江鲈6种组织中均有表达,但其在肌肉组织中表达量极显著高于其他组织,提示其在肌肉的生长发育过程中起着重要作用.
- 张燕萍邵芳郑红梅卢祥云徐建荣顾志良
- 关键词：松江鲈RACE组织表达分析
- 沙塘鳢线粒体基因组全序列的测定和分析被引量：2
- 2016年
- 为揭示沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组特征,采用PCR扩增和测序的方法获得沙塘鳢(Odontobutis)线粒体基因组全序列.通过生物信息学软件(t RNAscan-SE、RNAfold)定位沙塘鳢线粒体基因组基因结构及预测t RNA和r RNA的二级结构.沙塘鳢线粒体基因组全长16 930 bp,结构组成和其他硬骨鱼基本一致,包括13个蛋白质编码基因,22个t RNA,2个r RNA和1个D-loop区.13个蛋白质编码基因中,除了CO1是以GTG作为起始密码子,ND6以TTA作为起始密码子以外,其余都以ATG起始.沙塘鳢线粒体基因的终止密码子有3种类型,分别为完全密码子TAA、不完全密码子TA和T.除了t RNASer(AGN)和t RNACys外,其余20个t RNA基因的二级结构都是典型的三叶草结构.识别了沙塘鳢终止序列区、中央保守区D、E、F和保守序列区CSB-1、CSB-2和CSB-3.比较沙塘鳢cytb基因序列与其他物种同源性发现,沙塘鳢与平头沙塘鳢的同源性最高(87.03%),河川沙塘鳢次之(83.57%),与人的同源性最低(70.64%).该研究结果可为深入探讨沙塘鳢属及塘鳢科鱼类的系统分类提供依据,更真实地反映了沙塘鳢的分类地位和进化关系.
- 张燕萍郑红梅邵芳韩晓磊徐建荣顾志良
- 关键词：沙塘鳢线粒体DNA序列D-LOOP区系统进化
