李享云
- 作品数：2 被引量：0H指数：0
- 供职机构：大连交通大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省教育厅高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- 蛋白质-RNA相互作用预测中的几类分类器
- 2015年
- 蛋白质-RNA相互作用的研究对于理解细胞生理过程是必不可少的,蛋白质-RNA相互作用的预测是蛋白质相互作用研究中的一项基本工作.蛋白质-RNA相互作用的机制十分复杂,单依靠传统方法无法解决这一问题,结合生物信息学方法,采用计算的方法预测蛋白质和RNA的相互作用备受关注.构建分类器模型是使用计算方法预测相互作用的主要方式,不同分类器建立的分类模型性能不尽相同.为了更深入了解不同分类器的分类性能,通过分析比较贝叶斯、SVM(支持向量机)与随机森林这3种分类方法,归纳总结它们分类性能的优缺点.
- 汪颖李享云
- 关键词：分类器
- 基于序列预测蛋白质和RNA的相互作用
- 2015年
- 从计算的角度出发,考虑到当前蛋白质和RNA相互作用数据的实际情况,基于蛋白质和RNA的序列成分信息,构建预测模型.通过来自PDB的3149个蛋白质-RNA相互作用对得到的氨基酸三联体-核苷酸的相互作用倾向性值,定义了一个权重倾向性度量,用来度量每一对蛋白质-RNA序列中三联体-核苷酸的相互作用倾向性.为了避免特征的冗余性,基于较高倾向性以及成分特征构建特征向量,用于预测蛋白质-RNA相互作用.计算结果显示文中预测模型(SVM模型)和算法的有效性.
- 汪颖李享云
- 关键词：蛋白质RNA相互作用
