尹传林
- 作品数：6 被引量：16H指数：3
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生自动化与计算机技术生物学更多>>
- 昆虫基因组数据库InsectBase的构建与应用
- 随着测序技术的进步,大规模基因组测序数据和海量RNA-Seq数据不断涌现,昆虫学研究逐步追赶人类后基因时代研究的步伐,迎来了生物数据的大时代.目前,已有155种昆虫基因组序列可从公开数据库中获得,共发表昆虫基因组研究论文...
- 尹传林沈耕宇郭殿豪王书平马行洲肖花美刘金定张赞刘莹张艺群黄水清李飞
- 关键词：昆虫基因组转录组数据库信号通路基因家族
- 中国及欧洲各国的苹果蠹蛾种群遗传多样性分析被引量：3
- 2021年
- 为研究不同国家和地区苹果蠹蛾Cydia pomonella种群的遗传多样性,对采自我国新疆维吾尔自治区和黑龙江省,以及德国、法国和西班牙等欧洲国家的11个种群共60个苹果蠹蛾个体进行基因组重测序,有效测序样本数为56个,共获得8455843个群体单碱基突变(single nucleotide polymorphism,SNP)位点。利用SNP数据进行了苹果蠹蛾群体遗传进化树的构建、主成分分析以及遗传结构分析。结果显示,入侵我国黑龙江省的苹果蠹蛾与德国BD种群更为接近,我国新疆维吾尔自治区与黑龙江省苹果蠹蛾种群有一定的分化,前者种群遗传多样性更低。表明我国东北地区和西北地区的苹果蠹蛾种群具有不同的遗传多样性特征,入侵我国的苹果蠹蛾种群可能来源于欧洲。
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- 关键词：苹果蠹蛾种群多样性
- InsectBase平台构建及两种昆虫的基因组数据分析
- 测序技术的发展带动了生命科学研究领域翻天覆地的改变，催生了生物大数据时代的到来。目前，已有300多种昆虫基因组被测序，大数据组学分析已经成为科学研究重要的途径。本文围绕昆虫基因组数据挖掘，依托构建的基因组数据Insect...
- 尹传林
- 关键词：植物虫害腰带长体茧蜂苹果蠹蛾入侵性免疫逃避
- 寄生蜂细胞色素P450基因家族进化分析被引量：3
- 2019年
- 寄生蜂是重要的天敌昆虫,被广泛应用于生物防治,但在实际生产应用中面临诸多问题,如环境适应性和耐药性问题。细胞色素P450是真核生物中广泛存在的超基因家族酶系,参与农药、植物次生代谢物及环境有害物质等的代谢,同时也参与昆虫体内多种内源性化合物的合成与代谢。本文通过对植食性榕小蜂和9种寄生蜂基因组数据的生物信息学分析,共获得615个P450基因,分析表明不同寄生蜂P450基因家族的差异主要发生在CYP3和CYP4簇,而CYP2和Mito簇相对保守;相较于外寄生蜂,内寄生蜂的P450超基因家族有明显的收缩现象;此外,发现了2个在寄生蜂中1:1:1高度保守的P450基因,CYP18和CYP314,以及茧蜂特有的CYP304基因和内寄生蜂特有的CYP28基因。本研究从基因组水平系统地分析了寄生蜂P450超基因家族的进化,为寄生蜂的遗传改良和规模化饲养等提供理论基础。
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- 关键词：寄生蜂P450基因
- 昆虫基因组数据库InsectBase的构建与应用
- 随着测序技术的进步,大规模基因组测序数据和海量RNA-Seq数据不断涌现,昆虫学研究逐步追赶人类后基因时代研究的步伐,迎来了生物数据的大时代.目前,已有155种昆虫基因组序列可从公开数据库中获得,共发表昆虫基因组研究论文...
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- 关键词：昆虫基因组转录组数据库信号通路基因家族
- 昆虫基因组及数据库研究进展被引量：10
- 2017年
- 基因组序列为昆虫分子生物学研究提供丰富的数据资源,推动系统生物学在古老的昆虫学中蓬勃发展。昆虫基因组学研究已经成为当前的研究热点,目前在NCBI登录注册的昆虫基因组测序计划有494项,其中已提交原始测序数据的昆虫有225种,完成基因组拼接的有215种,具有基因注释的有65种,公开发表的昆虫基因组有43篇。本文综述了测序技术发展的历史及其对昆虫基因组研究的推动作用、昆虫基因组的组装和注释及其存在的问题、昆虫基因组测序进展、昆虫基因组数据库的发展及基因数据挖掘利用的基本思路和对策,以及昆虫基因大数据在害虫防治和资源昆虫利用中的应用前景。
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- 关键词：昆虫基因组基因组数据库害虫防治
