程丽
- 作品数：12 被引量：24H指数：2
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- 植物CPR基因密码子偏好性及聚类分析被引量：16
- 2017年
- 细胞色素P450还原酶(cytochrome P450 reductase,CPR)在植物的生长、发育、天然产物的合成和抵御外界刺激的过程中发挥重要作用。本研究通过利用12种植物的36个CPR基因,运用Codon W软件分析密码子的偏好性指标,并分别运用SPSS和MEGA5.0软件进行密码子偏好性和基因聚类分析。结果显示,单子叶植物和双子叶植物CPR基因的有效密码子数(effective number of codons,ENC)范围分别为52.92~58.17和46.85~53.58,密码子偏好性较弱。全部CPR基因位点在ENC绘图中均偏离ENC期望曲线,其密码子偏好性主要是受自然选择压力的影响。单子叶植物和双子叶植物CPR基因对同义密码子的偏好性存在差异;同种植物不同CPR基因的密码子偏好性也不同。在基于基因同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)的聚类中,单子叶植物CPR基因和双子叶植物CPR基因分别聚为一支,更接近于12种植物的传统系统分类,反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的重要补充。在基于基因编码序列(coding sequence,CDS)的系统进化树中,同种植物的CPR基因分别聚到两个支上,一定程度上反映了CPR基因的分类和功能。本研究结果从密码子偏好性和蛋白质水平上说明同种植物的不同CPR基因存在功能与进化差异,为植物CPR基因的分类与演化、功能预测与表达以及植物育种研究奠定了基础。
- 程丽李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟夏冰汪仁
- 关键词：密码子偏好性聚类分析
- 忽地笑CYP98A的分子克隆与表达分析被引量：6
- 2018年
- 利用RACE技术从忽地笑(Lycoris aurea(L’Hér.)Herb.)花葶中克隆获得细胞色素P450酶98A亚家族蛋白编码基因LaCYP98A。该基因cDNA全长1 794 bp,开放阅读框为1 518 bp,编码含有505个氨基酸残基的LaCYP98A蛋白。LaCYP98A具有细胞色素P450酶特征性的亚铁血红素结合结构域和半胱氨酸残基组成的活性中心。LaCYP98A与拟南芥、大豆等其他植物CYP98A氨基酸序列的一致性在60%以上,且具有CYP450的所有特征模序。LaCYP98A定位于植物细胞的内质网,其N-端29个氨基酸对于其亚细胞定位具有重要的作用。利用pET表达系统,通过截掉其N-端内质网定位区域,可以实现LaCYP98A在大肠杆菌中的诱导表达。本研究为LaCYP98A的功能鉴定和植物细胞色素P450的原核表达及其催化的次级代谢产物的异源合成奠定了基础。
- 钱彬彬李宜奎李洁程丽夏冰汪仁
- 关键词：忽地笑分子克隆亚细胞定位原核表达
- 从忽地笑鳞茎中分离筛选拮抗细菌的方法
- 本发明涉及一种从忽地笑鳞茎中分离筛选拮抗内生细菌的方法，该方法通过内生菌分离方法从忽地笑鳞茎中分离得到内生细菌，采用改进的对峙培养方法，将供试稻瘟病菌点在平板中央，培养2-3天，再在围绕稻瘟病菌十字交叉的四个角落分别接种...
- 李晓丹汪仁夏冰程丽
- 文献传递
- 一种反式肉桂酸－4－羟化酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及反式肉桂酸‑4‑羟化酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的反式肉桂酸‑4‑羟化酶，其具有良好的底物专一性和区域选择性，可以催化反式肉桂酸的4位C的羟基化生成对‑香豆酸。本发明还揭示了编码所述反...
- 李宜奎汪仁钱彬彬李晓丹徐晟程丽夏冰
- 石蒜科植物忽地笑细胞色素P450还原酶2及其编码基因与应用
- 本发明涉及细胞色素P450还原酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的细胞色素P450还原酶2，其具有良好的辅酶专一性，可以协助细胞色素P450酶发挥催化活性以氧化修饰其底物合成产物。本发明还揭示了编码所...
- 汪仁李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟程丽夏冰
- 文献传递
- 一种对香豆酸-3-羟化酶及其编码基因与应用
- 本发明涉及对香豆酸‑3‑羟化酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的对香豆酸‑3‑羟化酶，其具有良好的底物专一性和区域选择性，可以催化对香豆酸的3位C的羟基化生成咖啡酸。本发明还揭示了编码所述对香豆酸‑3...
- 汪仁李宜奎钱彬彬徐晟李晓丹程丽夏冰
- 文献传递
- 忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因的分子克隆与原核表达
- 2018年
- [目的]克隆忽地笑[Lycoris aurea (L’Hér.) Herb.]α-葡萄糖苷酶2编码基因。[方法]基于忽地笑的转录组数据库,分析功能注释为α-葡萄糖苷酶2的基因片段,通过设计特异性定量PCR扩增引物分析其在各组织中的表达丰度,利用RACE (rapid-amplification of c DNA ends)技术从高丰度组织中克隆获得忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因。[结果]忽地笑α-葡萄糖苷酶2编码基因Lau Agl2 c DNA全长3 185 bp,开放阅读框为2 961 bp,编码含有986个氨基酸残基的Lau Agl2蛋白质。Lau Agl2蛋白质氨基酸序列具有α-葡萄糖苷酶Ⅱ特征性的保守结构域和天冬氨酸残基组成的活性中心,还具有一些蛋白质糖基化的潜在位点(N-X-S/T共有序列)。Lau Agl2蛋白质与油棕、陆地棉等其他植物的α-葡萄糖苷酶2的氨基酸序列一致性为73.0%以上。利用p ET表达系统,可以在大肠杆菌中实现Lau Agl2蛋白质的诱导表达。[结论]成功从忽地笑花葶和花瓣中克隆到α-葡萄糖苷酶2编码基因Lau Agl2并在大肠杆菌中对Lau Agl2进行了异源表达,为Lau Agl2蛋白质的功能鉴定及其在忽地笑种子萌发与生长发育中的作用研究奠定了基础。
- 李宜奎李洁程丽钱彬彬汪仁
- 关键词：忽地笑分子克隆原核表达
- 石蒜根际拮抗细菌HH1的筛选鉴定及其抑菌活性研究被引量：2
- 2016年
- [目的]以小麦赤霉病菌(Fusarium gramiuearum)为筛选靶标,分离石蒜根部土样中的拮抗细菌并研究其抑菌特性及机制。[方法]通过抑菌活性筛选拮抗菌株,根据菌落及细胞形态观察、生理生化试验结果和16S rRNA基因序列分析进行菌种鉴定,并对拮抗菌株产活性抗真菌成分的最佳培养基和培养条件进行优化。通过显微观察拮抗菌发酵上清液对病原菌生长的影响,对活性物质的热稳定性、酸碱稳定性及对蛋白酶K敏感性进行测定。[结果]共获得有稳定拮抗效果的菌株7株。以其中1株对小麦赤霉病菌具有较好拮抗作用的细菌HH1作为进一步研究的对象,鉴定其为短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)。抑菌试验发现菌株HH1能够分泌抑制小麦赤霉病菌孢子和菌丝生长的物质。沉淀菌株HH1发酵上清液中活性物质的最适硫酸铵饱和度为60%。优化了菌株HH1产活性抗真菌成分的培养基和培养条件。对活性物质热稳定性、酸碱稳定性及对蛋白酶K敏感性的测定结果显示:拮抗物质在p H中性和低于70℃的条件下较稳定,70℃以上的温度和蛋白酶K处理抗菌物质,其抑菌活性显著下降。[结论]初步推测菌株HH1所产拮抗物质可能是蛋白质类。
- 李晓丹程丽夏冰汪仁
- 关键词：小麦赤霉菌短小芽孢杆菌拮抗细菌
- 忽地笑α-葡萄糖苷酶编码基因的分子克隆与原核表达
- 2019年
- 利用RACE技术从忽地笑(Lycoris aurea(L’Hér.)Herb.)花瓣中克隆获得一个α-葡萄糖苷酶编码基因Lau Agl。该基因cDNA全长2 810 bp,开放阅读框为2 613 bp,编码含有870个氨基酸残基的LauAgl蛋白质。LauAgl蛋白质氨基酸序列具有α-葡萄糖苷酶特征性的保守结构域和天冬氨酸残基组成的活性中心,其N端含有一个由21个氨基酸组成的信号肽序列,还具有一些蛋白质糖基化的潜在位点(N-X-S/T共有序列)。LauAgl蛋白质与石刁柏、椰子、油棕等其他植物的α-葡萄糖苷酶的氨基酸序列一致性达到63%以上。利用pET表达系统,通过截掉其N-端信号肽序列,可以实现LauAgl蛋白质在大肠杆菌中的诱导表达。本研究为Lau Agl蛋白质的功能鉴定及其在忽地笑种子萌发与生长发育中的作用研究提供理论基础。
- 李宜奎李洁程丽钱彬彬汪仁
- 关键词：忽地笑Α-葡萄糖苷酶分子克隆原核表达
- 石蒜科植物忽地笑细胞色素P450还原酶2及其编码基因与应用
- 本发明涉及细胞色素P450还原酶及其编码基因与应用。本发明首次揭示了石蒜属植物忽地笑的细胞色素P450还原酶2，其具有良好的辅酶专一性，可以协助细胞色素P450酶发挥催化活性以氧化修饰其底物合成产物。本发明还揭示了编码所...
- 汪仁李宜奎李晓丹钱彬彬徐晟程丽夏冰
- 文献传递
