李想
- 作品数：5 被引量：9H指数：2
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省畜禽育种攻关项目四川省科技创新产业链示范工程中央高校基本科研业务费专项资金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 藏鸡THRSP基因的克隆及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 对藏鸡THRSP基因进行克隆、序列测定及生物信息学分析.结果表明:获得的藏鸡THRSP基因核苷酸序列为428 bp(Gen Bank登陆号:KT153607),在50-258 bp处存在1个Cp G岛,ORF长度为390 bp,编码129个氨基酸,其中Leu所占比例为10.9%.THRSP蛋白分子量为14.18 ku,等电点(p I)为4.61,属于不稳定酸性核蛋白,存在8个磷酸化位点和5个O糖基化位点.预测其二级结构中α螺旋占51.2%,β折叠占3.1%,无规则卷曲占45.7%.同源性分析结果表明:藏鸡与原鸡THRSP基因核苷酸及预测的氨基酸序列同源性为100%,两者亲缘关系最近.
- 聂晓庆徐亚欧吕明左璐璐李想林亚秋
- 关键词：藏鸡基因克隆生物信息学分析
- 藏鸡磷酸酪氨酸互作结构域1(PID1)的克隆及组织表达谱研究被引量：5
- 2016年
- 本研究旨在阐明藏鸡PID1基因在不同组织与时序表达谱,并研究PID1基因表达与肌内脂肪含量(IMF)的关系。利用RT-PCR技术克隆藏鸡PID1基因,用相关软件预测PID1蛋白的结构和功能,采用荧光定量PCR研究PID1基因在藏鸡不同组织、不同日龄的表达谱,并分析其与IMF的相关性。结果显示,克隆得到藏鸡PID1基因序列长度为654bp(GenBank登录号:KT000001),共编码217个氨基酸,是具有PTB结构域的不稳定亲水酸性蛋白质;有14个磷酸化位点、4个O-糖基化位点、1个N-糖基化位点、7种保守特异性蛋白激酶结合位点、3个二硫键;预测其二级结构中α-螺旋占26.73%,β折叠占20.74%,无规则卷曲占52.53%,属于混合型蛋白且主要存在于细胞质中。荧光定量PCR结果显示,PID1基因在藏鸡的不同组织中均存在表达,且在脂肪组织中表达水平最高(P<0.01);时序表达谱结果显示,PID1基因在1日龄公藏鸡胸肌中表达水平最高。在210日龄的公鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄的表达水平(P<0.01),在119日龄母鸡腿肌的表达量极显著高于其他日龄表达水平(P<0.01)。在119和154日龄公鸡脂肪组织中表达水平较高,在210日龄母鸡脂肪组织中的表达量最高(P<0.01)。相关性分析结果显示,PID1mRNA的表达量与藏鸡胸肌的IMF含量存在显著相关(P<0.05)。结果提示,PID1基因可能是影响藏鸡IMF沉积的候选基因。
- 聂晓庆林亚秋徐亚欧赵燕英吕明左璐璐张小玉李想
- 关键词：藏鸡克隆肌内脂肪
- 山羊CCRL2基因的分子克隆和表达分析
- 2017年
- 本研究旨在克隆山羊趋化因子(C-C基序)受体2(chemokine(C C motif)receptor-like 2,CCRL2)基因序列,并研究其组织和时序表达谱。以简州大耳羊为试验材料,应用RT-PCR方法克隆CCRL2基因并进行生物信息学分析,qPCR方法构建该基因在山羊不同组织表达谱和不同月龄背最长肌、股二头肌和臂三头肌中的表达水平,并将基因表达与IMF含量进行相关分析。结果显示:克隆得到山羊CCRL2基因(GenBank登录号:KT165378)长度为1 143bp,编码区长度为1 047bp;qPCR分析表明,CCRL2mRNA在24月龄山羊心、肝、脾、肺、肾、脂肪、背最长肌、股二头肌和臂三头肌中均有不同程度的表达,其中脾表达量最高(P<0.01);时序表达中,CCRL2基因在股二头肌和臂三头肌中的表达量均在8~10月龄极显著高于1~3和24月龄(P<0.01),在背最长肌中则为24月龄极显著高于1~3和8~10月龄(P<0.01);相关分析显示,股二头肌中CCRL2基因mRNA表达量与IMF含量呈极显著负相关(P<0.01)。CCRL2基因可能参与山羊IMF沉积作用。
- 廖红海林亚秋朱江江李倩李倩张小玉林森王永
- 关键词：山羊克隆表达谱肌内脂肪
- 藏山羊FGF21基因克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- 为探讨藏山羊FGF21基因的分子结构特征,利用RT-PCR技术对该基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明：获得藏山羊FGF21基因序列650 bp,ORF长度为634 bp,编码209个氨基酸。氨基酸序列分析显示,藏山羊FGF21编码蛋白属于不稳定酸性蛋白,分子式为C1 022H1 596N276O296S5,分子质量为22.65 ku。预测该蛋白含有13个磷酸化位点,并与多种蛋白存在相互作用;无跨膜结构域,有信号肽结构。在47~164位氨基酸残基存在FGF结构域。亚细胞定位显示,FGF21蛋白大部分位于细胞质内。同源性分析指出山羊FGF21氨基酸序列保守性较高,与Gen Bank中藏羚羊、牛、印度水牛及猪等的同源性在90%~99%。本研究结果为阐明FGF21基因在藏山羊中的作用提供重要的基础数据。
- 沈阅林亚秋梅寒李想张小玉
- 关键词：藏山羊克隆生物信息学分析
- 藏山羊DLK1基因的组织表达谱与肌内脂肪相关性分析
- 2016年
- 为了研究藏山羊DLK1基因组织表达谱和肌肉组织中DLK1 mRNA表达与肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的相关性,试验采用实时荧光定量PCR方法检测DLK1基因在藏山羊不同组织中的表达和与肌肉关联性分析。结果表明:DLK1基因在藏山羊心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌、腿肌和臂三头肌中均有表达,其中在肾脏中表达量最高,在肺脏中表达量最低。相关性分析结果表明,藏山羊背最长肌、腿肌和臂三头肌中DLK1 mRNA表达与肌内脂肪含量分别呈不显著正相关(R=0.226,P>0.05)、显著正相关(R=0.759,P<0.05)和显著负相关(R=-0.792,P<0.05)。说明DLK1基因可能对藏山羊肌内脂肪沉积具有重要的调控作用。
- 廖红海林亚秋李倩邬杨楠李想王永
- 关键词：藏山羊肌内脂肪
