张集
- 作品数:2 被引量:17H指数:2
- 供职机构:传染病预防控制国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 用16S rRNA基因克隆文库研究腹泻粪便中菌群分布被引量:5
- 2008年
- 目的建立16S rRNA基因克隆文库分析菌群的方法,用于临床标本菌群分布的检测。方法临床标本直接提取核酸,用16S rRNA基因的通用引物进行PCR扩增、纯化、连接、克隆和测序,建立16S rRNA基因克隆文库,序列与数据库进行比对分析。结果通过16S rRNA基因克隆文库分析,腹泻标本中检出4种细菌,脆弱拟杆菌为绝对优势菌,占91%;腹泻恢复后的粪便标本中菌群呈多样性,检出12种确定种属的细菌,其中脆弱拟杆菌占14%。结论16S rRNA基因克隆文库是一种较好地研究粪便标本菌群的方法,可直接进行粪便标本的菌群分析和研究各种细菌在腹泻中的作用。
- 张守印张集叶长芸李振军卢金星徐建国
- 关键词:RRNA基因厌氧菌腹泻
- 16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用被引量:12
- 2008年
- 目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结果:三株细菌的16S rRNA基因序列与Genbank比较,YC1序列与大肠杆菌相似性>99%,YC2序列与肺炎克雷伯菌相似性>99%,YC3序列与缓症链球菌相似性>98%。结论:16S rRNA基因序列分析的方法可以较好地鉴定常规方法难以鉴定的不典型菌株。
- 张守印李振军张集朱勇庞慧郑宵贺金荣海荣
- 关键词:RRNA基因