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苏荣坤
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
香港大学
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
杨丽莹
广东药科大学
叶永浩
广东药科大学
李书渊
广东药科大学
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叶永浩
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杨丽莹
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年份
1篇
2016
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落葵薯DNA条形码筛选及其近缘植物的分子鉴定
被引量:3
2016年
目的:利用DNA条形码鉴定落葵薯及其近缘植物。方法:对来自不同产地的28份落葵薯及其近缘植物的核基因ITS序列和ITS2序列、叶绿体基因matK序列、psbA-trnH序列和rbcL序列进行PCR扩增并测序,比较不同序列的PCR成功率及测序成功率,对各序列进行种内和种间变异分析,Barcoding gap检验,以及构建NJ树聚类分析,评估不同序列对落葵薯及其近缘植物的鉴别能力。结果:经PCR扩增、测序后发现落葵psbA-trnH序列出现碱基缺失事件,其他序列均扩增、测序成功;matK序列和rbcL序列的测序成功率均为100%,ITS序列和ITS2序列的测序成功率分别为78.75%和64.28%;4条序列中,ITS序列和matK序列的种内和种间距离分别在barcoding gap检验中明显分离;从NJ树来看,ITS序列、matK序列均可区分落葵薯及其近缘植物。结论:建议采用ITS序列及matK序列作为落葵薯及其近缘植物鉴定的DNA条形码。
杨丽莹
苏荣坤
蔡宇忆
叶永浩
李书渊
关键词:
DNA条形码
ITS2
MATK
RBCL
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