朱国忠
- 作品数：5 被引量：7H指数：1
- 供职机构：南京农业大学更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于基因组数据库的杂草稻叶绿体分子标记开发被引量：7
- 2015年
- [目的]杂草稻的起源与演化是一个未澄清的热点问题,分子标记技术是最重要的研究手段之一。由于已经应用的分子标记数量有限,与栽培水稻缺乏特异性,因此探索新的分子标记仍然十分必要。[方法]使用网络基因组数据库中13份栽培水稻和野生稻叶绿体全基因组序列进行比对和分析,针对其中的高频变异区域设计标记引物,进而对60份杂草稻样品的标记区域测序并进行多态性验证。[结果]13份样品叶绿体全基因组中存在1020个单核苷酸多态性(SNP)位点,111个插入/缺失(InDel)位点,表现出丰富的遗传变异;选定其中3个高频变异区域,分别针对trnG-trnfM基因间区、psbM-trnC基因间区和trnT-trnL基因间区设计了3对引物,对60份杂草稻材料进行了检测,发现3个片段总长1966bp,共存在7个SNP位点,6个InDel位点,总变异序列长度为34bp,占序列总长的1.73%。系统发育树结果显示,60份杂草稻被划分为4个类群。另外,将网络数据库中的13份栽培水稻和野生稻数据进行分析,发现不同栽培稻和野生稻的籼粳类型分别被聚到杂草稻的相应类群中。[结论]所开发的3对叶绿体分子标记可以对上述杂草稻进行良好的分类,因此可以作为研究杂草稻遗传多样性及演化的分子标记。
- 朱国忠戴伟民陈晓锋张晶旭强胜
- 关键词：杂草稻基因组数据库叶绿体基因分子标记
- 一种棉花抗旱相关基因GhDT2及其应用
- 本发明公开一种棉花抗旱相关基因GhDT2及其应用，属于生物技术应用领域。本发明涉及的GhDT2基因，其编码一个NAC转录因子。本发明提供了GhDT2在异源四倍体陆地棉遗传标准系TM‑1中的全长ORF核苷酸序列和氨基酸序列...
- 郭旺珍金暄翔张大勇尚小光朱国忠
- 一种改良棉花纤维品质的木葡聚糖内糖基转移/水解酶基因GoXTH及其应用
- 本发明公开一种改良棉花纤维品质的木葡聚糖内糖基转移/水解酶基因GoXTH及其应用，属于生物技术应用领域。所述的木葡聚糖内糖基转移/水解酶基因GoXTH存在两种单倍型，单倍型1的CDS序列为SEQ ID NO.1；单倍型2...
- 郭旺珍王海棠宋晓辉万宇朱国忠
- 基于叶绿体基因多样性的中国杂草稻起源进化研究
- 杂草稻一般多与栽培稻伴生,具有较强的竞争性,影响到水稻的产量和稻米的品质,危害十分严重。杂草稻广泛分布于世界的所有水稻产区。由于杂草稻形态和遗传背景上都与栽培稻有着高度的相似性,尚没有经济有效的防除杂草稻的方法。因此,通...
- 朱国忠
- 关键词：杂草稻叶绿体基因分子标记
- 文献传递
- 基于转录组测序和SNP芯片开展棉花耐盐特征分析
- 棉花是重要的经济作物。同时棉花作为盐碱地的“先锋作物”具有较强的抵御盐害能力。尽管如此，近年由于耕作区划调整和环境气候影响，对棉花耐逆能力的需求越来越高。以棉花耐盐优势为基础，揭示其耐盐机理，不仅有利于培育棉花耐盐品种，...
- 朱国忠
- 关键词：棉花耐盐机制转录组测序
- 文献传递
