庄筠昀
- 作品数：3 被引量：21H指数：2
- 供职机构：中国海洋大学海洋生命学院更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学理学更多>>
- 条斑紫菜超氧化物歧化酶全长基因序列分析
- 本实验室已有的条斑紫菜(Porphyrayezoensis)cDNA文库的EST分析结果,选择与紫菜抗逆性相关的超氧化物歧化酶(Superoxidedismutase,SOD)基因.对该克隆的插入片断进行测序,得一段10...
- 茅云翔王荣周晓君庄筠昀
- 关键词：条斑紫菜核苷酸序列
- 条斑紫菜锰超氧化物歧化酶基因克隆与序列分析被引量：15
- 2006年
- 为研究紫菜抗逆抗病的分子机制,以本实验室建立的条斑紫菜表达序列标签（EST）和全长cDNA富集文库,结合PCR技术,克隆了条斑紫菜编码锰超氧化物歧化酶（Mn-SOD）的cDNA及基因组DNA全长序列,并进行了序列特性相关分析.研究结果表明：该基因cDNA序列全长为958个核苷酸,包含一个完整Mn-SOD基因的ORF,编码224个氨基酸和终止密码子;该基因在基因组中序列长度为1416bp,包含4个外显子和3个内含子,这既不同于高等植物的6个外显子和5个内含子,也不同于人的5个外显子和4个内含子;该基因编码区密码子的平均GC含量为60.9%,第三位密码子的GC含量高达84.9%;序列中包含4个与Mn^2＋的结合位点及一个保守的金属结合结构域,预测分子量为24469.09Da,等电点为5.99;条斑紫菜Mn-SOD与人的相关蛋白具有类似的空间结构,都有6个跨膜α螺旋结构域;由cDNA序列推导的氨基酸序列与莱茵衣藻相似性为57.7%,系统发生分析表明条斑紫菜Mn-SOD与绿藻莱茵衣藻和硅藻海链藻的亲缘关系较近.这是该基因在红藻门中的首次报道.
- 王荣刘涛周晓君庄筠昀茅云翔
- 关键词：条斑紫菜
- 条斑紫菜孢子体cDNA文库构建及表达序列标签的初步分析被引量：6
- 2006年
- 用λ噬菌体载体构建了条斑紫菜Porphyra yezoensis丝状体cDNA表达文库,并对文库进行了随机测序,对随机测序形成的719条表达序列标签(EST)序列进行了初步分析。结果表明:该文库包含1.52×106个独立克隆,重组率为88.2%;EST的冗余率为54.2%,新EST的比率为65.7%。本研究为开展条斑紫菜的功能基因克隆、分析和功能基因组学研究提供了条件。EST序列已递交Gen-Bank,编号为CX873884到CX874602。
- 徐民俊茅云翔庄筠昀张学成
- 关键词：紫菜CDNA文库表达序列标签
