姜婷
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
- 供职机构：复旦大学更多>>
- 发文基金：上海市科委技术标准专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 使用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌被引量：8
- 2009年
- 目的:测试应用16S rDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性。方法:用16S rDNA基因的扩增引物,对从腹泻者、水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌(n=39)及临床分离的15种(n=181)常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应,产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序。序列通过blastn,在GenBank中比对,确定细菌属种并与表型法结果进行比较。结果:220株菌(220/220)扩增出870 bp的目的片段,平均测序长度752 bp。36/39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符,3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌(Staphylococcus cohnii),表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)和Oceanobacillus profundus。181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌,其中123株与生化培养法结果一致,58株有差异。结论:本文报告的16S rDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌,并可与15种临床常见分离菌区分。
- 王宏萍张继伦吴文娟姜婷鲍依稀周晓明
- 关键词：副溶血性弧菌临床菌株
- 汉族类风湿关节炎患者CD4+T细胞的全基因组DNA甲基化
- 何东仪陈广洁郭士成姜婷汪荣盛沈逸朱晓王岩白凤敏丁琴海亚美周晓东
- 使用16SrDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌
- 2010年
- 目的 测试应用16SrDNA序列分析鉴定副溶血性弧菌的适用性。方法用16SrDNA基因的扩增引物，对从腹泻者，水产品和环境中分离获得的副溶血性弧菌（n=39）及临床分离的15种（n=181）常见菌的基因组DNA进行聚合酶链反应，产物经琼脂糖凝胶电泳纯化后直接测序。序列通过blastn，在GenBank中比对，确定细菌属种并与表型法结果进行比较。结果220株菌（220／220）扩增出870bp的目的片段，平均测序长度752bp。36／39株副溶血性弧菌鉴定结果与生化培养法相符，3株菌株分别鉴定为科氏葡萄球菌（Staph3，lococcuscohnii），表皮葡萄球菌（Staphylococcusepidermidis）和Oceanobacillus profundus。181株其它临床分离菌无误判为副溶血性弧菌，其中123株与生化培养法结果一致，58株有差异。结论本文报告的16SrDNA基因序列分析可用于准确鉴定副溶血性弧菌，并可与15种临床常见分离菌区分。
- 王宏萍张继伦吴文娟姜婷鲍依稀周晓明
- 关键词：副溶血性弧菌临床菌株
- 副溶血性弧菌致病性标志基因tdh的实时荧光定量聚合酶链式反应的建立被引量：2
- 2008年
- 目的:建立一个用于副溶血性弧菌致病性定量测定的检测体系.方法:以多组tdh基因的保守序列为基础,设计实时荧光定量PCR扩增适用的引物和TaqMan探针.以定量方式提取副溶血性弧菌基因组DNA,以tdh+菌株为阳性对照,建立实时荧光定量PCR方法.以tdh荧光定量结果与绝对菌数浓度作参比,以确定tdh基因在菌群中的拷贝水平.结果:使用正向序列5′-CGAAG ATGTT TATGG TCAAT C-3′(位置在467～487bp处),反向序列5′-ACCGC TGCCA TTG-TA TAGTC T-3′(位置在571～551bp处),TaqMan探针5′-FAM-TGACA TCCTA CATGA CTGTG AAC-ECLIPSE-3′(位置在517～539bp处)建立一个实时荧光定量PCR反应,目的片段长度105bp.建立反应的DNA拷贝数对数值与Ct值线性关系为y=-3.144logx+43.229(r=0.997,P<0.001).建立了菌液A值与显微镜下绝对菌数浓度的相关关系为y=2.0452x+6.2845(r=0.7828,P<0.01).根据tdh基因拷贝数与绝对菌数相比可计算tdh基因的单菌体拷贝量.结论:建立了一个定量副溶血性弧菌tdh基因拷贝水平的实时荧光定量PCR检测方法,可应用于副溶血性弧菌致病性的标准化定量测定体系.
- 王宏萍周晓明张继伦姜婷李雯雯鲍依稀
- 关键词：弧菌副溶血性聚合酶链反应
