任洪伟
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
- 供职机构：大连海洋大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金海洋公益性行业科研专项国家海洋局重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 双齿围沙蚕Cu/Zn-SOD cDNA基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2014年
- 根据已知多毛类Alitta succinea铜锌超氧化物歧化酶(Cu/Zn-SOD)基因序列设计引物,利用同源克隆及RACE方法首次从双齿围沙蚕Perinereis aibuhitensis中克隆得到Cu/Zn-SOD基因全长cDNA序列。结果表明:双齿围沙蚕Cu/Zn-SOD基因cDNA全长870 bp,其中包括156 bp的5'端非编码区,261 bp 3'端非翻译区和453 bp开放阅读框,编码150个氨基酸;该蛋白序列具有典型的Cu2+和Zn2+结合位点,并具有两处Cu/Zn-SOD蛋白家族标签序列。通过生物信息学分析表明,该蛋白属于胞内Cu/Zn-SOD,理论相对分子质量为15 249 900,等电点为5.66,无信号肽和跨膜区,推测为亲水性蛋白。同源性分析表明,双齿围沙蚕Cu/Zn-SOD氨基酸序列与部分软体动物、鱼类和昆虫的Cu/Zn-SOD蛋白序列具有很高的相似性。该研究结果为后续研究Cu/Zn-SOD与环境污染物之间的剂量效应关系奠定了基础,为研究双齿围沙蚕机体的防御机制提供了基础资料。
- 岳宗豪樊鑫赵欢任洪伟张旭峰周一兵
- 关键词：双齿围沙蚕铜锌超氧化物歧化酶生物信息学分析同源性分析
- 应用ISSR和线粒体COI序列对不同地理种群双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)遗传多样性的分析被引量：4
- 2014年
- 采用COI基因序列和ISSR分子标记对分布于我国大连(DL)、乳山(RS)、盘锦(PJ)、青岛(QD)、盐城(YC)、晋江(JJ)和朝鲜西海岸(CX)7个地理种群双齿围沙蚕(Perinereis aibuhitensis)的遗传多样性和遗传结构进行了研究。10个ISSR引物在7个种群中共扩增出116条条带,其中多态性条带109条,总多态位点比率为93.97%,Nei's基因多样性指数为0.365 2,Shannon's信息指数为0.518 6,群体间遗传分化系数Gst值为0.246 0。数据表明24.60%的遗传分化发生在不同地理种群间,76.40%的遗传分化发生在整个种群内,群体内分化大于群体间分化。对7个群体70个个体COI基因序列进行分析,对比长度包括469个位点,其中变异位点68个,简约信息位点47个。在68个变异位点中,62个位点发生转换,6个位点发生颠换,简约信息位点率达9.611%,系统树分析表明供试群体内具有较高的遗传多样性,与ISSR分析结果相一致。该结果为科学有效的利用和保护沙蚕种质资源提供了理论依据。
- 王一枭任洪伟朱迎军赵欢杨大佐周一兵
- 关键词：双齿围沙蚕ISSRCOI
