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水稻抗坏血酸氧化酶基因家族生物信息学分析被引量：3: 2020年; 抗坏血酸氧化酶(ascorbic acid oxidase,AAO)是多铜氧化酶家族中的一员,在植物生长发育过程中起重要作用。为深入研究水稻AAO基因家族的功能特征及表达模式,采用生物信息学从Phytozome的水稻数据库鉴定出14个AAO成员,并对其染色体定位、蛋白理化性质及二级结构、基因结构、保守基序、系统发生树和表达模式等方面进行预测分析。结果显示,14个OsAAO不均匀地分布在8条染色体上,多为碱性蛋白;蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分;基因结构和保守基序分析表明,OsAAO内含子数目变化差异较大,但氨基酸序列具有较强的保守性;系统发生树可分为3个亚家族,OsAAOs与玉米、高粱簇在一起,亲缘关系较近;另外表达模式分析发现,OsAAO在不同的组织部位表达水平具有差异,这表明其行使功能不同。这些结果为今后研究该基因家族的生物学功能和培育耐旱品种提供理论依据。; 柯笑楠胡海超黄霞贾玉芳; 关键词：AAO 基因家族生物信息学分析

一个水稻铜锌SOD酶基因在应答亚砷酸盐胁迫中的作用被引量：1: 2018年; 【目的】水稻Os08g44770.1基因编码一个铜锌SOD酶,但其在响应亚砷酸盐[As(Ⅲ)]胁迫中的生物学功能未知。本研究旨在深入揭示由该基因调控水稻砷耐性改变的分子机理并为水稻抗逆育种提供理论参考。【方法】以野生型日本晴(WT)和2个Os08g44770.1过表达转基因株系为试材,通过胁迫处理、生理指标测定和基因表达分析等,系统探究了转基因植株对As(Ⅲ)的耐受性表现,并初步揭示了其调控水稻砷耐性的生理和分子机理。【结果】与WT相比,过表达转基因株系对As(Ⅲ)更加敏感;转基因植株在砷胁迫下的根系相对伸长量、生物量(干质量)、叶绿素含量、根系细胞质膜完整性、叶片抗氧化程度等均显著低于WT;Os08g44770.1在砷处理后的WT和转基因植株叶片中的表达模式略有不同,但均表现为处理24 h时被显著诱导表达。【结论】过度表达Os08g44770.1基因可导致水稻的砷耐受性极显著下降。; 窦玲玲胡海超马龙柯笑楠刘明月练旺民金珂谢玲娟刘庆坡; 关键词：水稻亚砷酸盐生理机理

全基因组鉴定和分析水稻AP2基因家族被引量：3: 2021年; AP2亚组类转录因子是植物特有的一类转录因子,属于AP2/ERF基因家族,在植物生长发育、细胞分化以及响应生物和非生物胁迫过程中起着重要的作用。本研究通过生物信息学的方式共鉴定到16个水稻AP2基因,并对这些基因的理化性质、基因结构、进化途径、顺式调控元件、表达谱等方面进行分析。结果显示这些基因不均匀地分布在8条染色体上,根据同源性差异又可以分成3个亚组。每个亚组成员在基因结构以及保守基序的位置和数目上具有相似性,而且大部分OsAP2基因受到一个或者多个miRNA基因的调控。另一方面,这些基因在不同组织的表达水平有很大的差异,其中茎和花药中表达量相对较高,且部分OsAP2基因的表达量受到激素的诱导。这些结果为下一步研究水稻AP2基因的生物学功能打下坚实的基础。; 黄霞柯笑楠胡海超郭文萍蒋小玥潘项健; 关键词：进化树表达谱顺式作用元件 MIRNA

miR3979在水稻砷耐受性中的作用被引量：1: 2016年; miR3979可能参与水稻Oryza sativa应答亚砷酸盐和过氧化氢胁迫,但其具体的生物学功能未知。以mi R3979过表达转基因株系(As21-2,As21-3)和野生型品种中花11为试材,系统研究了转基因植株对亚砷酸盐的耐受性表现及其初步生理机制。结果表明:与野生型相比,mi R3979过表达转基因植株对亚砷酸盐更加敏感,其对砷的吸收与转移能力明显增强;转基因植株在砷胁迫下,其根部脯氨酸、可溶性蛋白质量浓度显著升高,但各抗氧化酶活性却受到明显抑制,mi R3979在亚砷酸盐处理后的野生型和转基因植株叶片中的表达谱截然不同。这些结果可为进一步揭示由该基因介导的水稻对砷耐性改变的分子机制以及抗逆育种提供理论参考。; 张丽清陈霞胡海超张俊艇官慧谦刘庆坡; 关键词：作物遗传育种水稻砷转基因生理机制

水稻MIR528基因启动子及其应用: 本发明提供了一种水稻MIR528基因启动子及其应用，该启动子分离自粳稻日本晴，其序列含有多个逆境胁迫应答及植物生长发育相关调控元件。转基因证明，其为广谱性表达启动子；正常条件下其在水稻茎干中的表达活性优于35S启动子；而...; 刘庆坡胡海超张恒木; 文献传递

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胡海超