王鹏飞 作品数:37 被引量:117 H指数:6 供职机构: 甘肃农业大学动物科学技术学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 甘肃省科技重大专项计划 甘肃省科技创新项目 更多>> 相关领域: 农业科学 文化科学 生物学 医药卫生 更多>>
SLA-DQA基因多态性与新生仔猪粪便菌群的相关性 杨巧丽 黄晓宇 闫尊强 王鹏飞 石海仁 滚双宝猪miR-204组织表达与重要靶基因筛选 被引量:5 2020年 基于Illumina Hiseq 4000高通量测序技术筛选得到仔猪感染C型产气荚膜梭菌耐受和易感组中显著上调表达的miR-204。为研究miR-204在各组织中的表达,进一步筛选miR-204参与调控仔猪C型产气荚膜梭菌感染的关键靶基因,采用实时荧光定量PCR方法检测了miR-204在7日龄仔猪各组织中的表达,利用MEGA7.0软件对其成熟体序列保守性进行分析,运用TargetScan、miRDB、PicTar软件进行靶基因预测,并用DAVID软件对靶基因进行Gene Ontology和KEGG Pathway通路富集分析,进一步采用qRT-PCR方法对筛选得到的关键靶基因在猪肠上皮细胞(IPEC-J2)中进行靶向关系验证。结果表明,miR-204在7日龄仔猪肾脏、肝脏、胸腺、淋巴、十二指肠和回肠组织中均高度表达,其成熟体序列在脊椎动物间高度保守。3种软件预测到的共同靶基因有114个,这些靶基因显著(P<0.05)富集在15个GO功能和13个信号通路。结合前期得到的抗性基因,筛选到4个关键靶基因NR3C1、SIRT1、BCL2L2和DLG5,转染miR-204 mimics后,靶基因SIRT1、BCL2L2和DLG5极显著(P<0.01)下调表达。miR-204是参与调控仔猪抵抗C型产气荚膜梭菌感染的重要因子,SIRT1、BCL2L2和DLG5可能是miR-204的关键靶基因,其功能还需进一步验证。 王伟 滚双宝 王鹏飞 王鹏飞 黄晓宇 雒瑞瑞 高小莉 高小莉 闫尊强 杨巧丽 马艳萍关键词:靶基因 产气荚膜梭菌 猪miR-96-5p组织表达谱及其关键靶基因分析 被引量:2 2021年 【目的】在前期感染C型产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens type C,C.perfringens type C)攻毒组及对照组仔猪回肠组织高通量测序结果的基础上,为研究猪miR-96-5p在不同组织中的表达,分析其关键靶基因在仔猪感染C型产气荚膜梭菌导致腹泻过程中的调控作用.【方法】采用RT-qPCR方法检测miR-96-5p在仔猪各组织的表达量,构建组织表达谱,并检测对照组(IC)、易感组(IS)和耐受组(IR)回肠组织中miR-96-5p及其靶基因的表达量;利用生物信息学软件对miR-96-5p进行保守性分析、靶基因预测、GO功能和KEGG信号通路富集分析.【结果】miR-96-5p成熟体序列在不同物种间高度保守;预测到靶基因179个;预测获得与免疫炎症反应相关的信号通路有ErbB和MAPK;筛选到与仔猪抵抗C型产气荚膜梭菌感染相关的靶基因有FOXO1、MAP2K1;RT-qPCR结果显示,miR-96-5p在回肠组织中高表达,且其在IC、IS、IR组回肠组织中的表达量与高通量测序结果趋势一致,其靶基因FOXO1、MAP2K1在IR和IS组的表达量均极显著低于IC组(P<0.01),IS组极显著低于IR组(P<0.01).【结论】miR-96-5p可能靶向调控FOXO1、MAP2K1参与仔猪感染C型产气荚膜梭菌性腹泻的过程. 杨敏 滚双宝 闫尊强 王鹏飞 王鹏飞 黄晓宇 黄晓宇 石海霞 马艳萍 马艳萍关键词:C型产气荚膜梭菌 仔猪 腹泻 葵花托盘替代不同比例苜蓿草粉对獭兔生长性能、胴体肉品质及血液生化指标的影响 被引量:2 2020年 【目的】探索葵花托盘替代苜蓿草粉对獭兔生产性能、血液生化指标和经济效益的影响.【方法】将采食量和日增重无差异的32只獭兔随机分成4个处理组(各组公母比例相同),每组8个重复,其中,对照组饲喂基础饲粮,试验Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ组饲喂用葵花托盘分别替代基础饲粮中50%、70%和100%苜蓿草粉的饲粮,测定其生产性能和血液生化指标,并分析其经济效益.【结果】在试验期1~70 d,对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ平均日采食量分别为88.68、88.39、86.16、79.10 g;平均日增重分别为20.37、19.93、22.00、19.42 g;饲料转化率分别为4.35、4.44、3.92和4.07.试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的平均日采食量、平均日增重和饲料转化率与对照组差异不显著(P>0.05).净肉率对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别为36.61%、33.49%、40.10%和41.89%,其中,试验组Ⅲ显著高于对照组和试验组Ⅰ(P<0.01),试验组Ⅱ显著高于试验组Ⅰ(P<0.01),显著高于对照组(P<0.05),对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ差异不显著(P>0.05);全净膛率对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别为52.10%、52.03%、53.19%、51.69%;半净膛率对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别为56.33%、56.14%、56.43%和55.51%.全净膛率和半净膛率试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ与对照组均差异不显著(P>0.05).肌肉a~*对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别为3.78、-0.16、-0.27、-0.27,试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ极显著低于对照组(P<0.01),肌肉L~*、b~*、熟肉率、嫩度、失水率和pH试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ与对照组差异不显著(P>0.05).血液生化指标中,GLU的含量对照组和试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别为5.37、5.83、7.23、6.77 mmol/g,试验组Ⅱ和试验组Ⅲ极显著高于对照组和试验组Ⅰ(P<0.01).其他血液生化指标试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ与对照组差异不显著(P>0.05).试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ与对照组的增重效益分别为15.89、14.72、18.13、14.68元/只.【结论】用葵花托盘替代70%的苜蓿草粉饲喂獭兔 王鹏飞 滚双宝 闫尊强 王利 马艳萍 马艳萍 封洋 黄晓宇 黄晓宇关键词:獭兔 苜蓿草粉 胴体肉品质 血液生化指标 高繁殖力猪新品系HN的遗传分析 被引量:2 2017年 【目的】对高繁殖力猪新品系HN进行遗传评定.【方法】采用多性状动物模型BLUP法(最佳线性无偏预测法)和REML法(非求导约束最大似然法)对高繁殖力猪新品系HN繁殖性状的表型参数和遗传参数进行了估测.【结果】高繁殖力猪新品系HN繁殖性状的变异系数较小,在1.75%~6.42%之间;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数、有效乳头数、初生个体质量、初生窝质量、21日龄个体质量、21日龄窝质量、断奶个体质量和断奶窝质量的遗传力分别为0.160、0.091、0.112、0.072、0.167、0.170、0.116、0.119、0.202和0.114;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数与初生个体质量、21日龄个体质量、断奶个体质量的表性相关(-0.220、-0.121、-0.061、-0.249、-0.125、-0.099、-0.179、-0.057、-0.217)呈弱的负相关,其他繁殖性状间的表型相关和遗传相关都呈正相关,且断奶窝质量与其他繁殖性状间的表型相关和遗传相关均呈中等或强的正相关;总产仔数、产活仔数、断奶存活仔数、有效乳头数、初生个体质量、初生窝质量、21日龄个体质量、21日龄窝质量、断奶个体质量和断奶窝质量的世代遗传进展分别为0.000 440头/世代、0.001 019头世代、0.000 112头/世代、0.003 106对/世代、0.004 361kg/世代、0.000 115 kg/世代、0.002 620 kg/世代0.010 261 kg/世代、0.001 875 kg/世代和0.011 226kg/世代.【结论】各性状的表型参数变异系数较小,繁殖性状的遗传力符合一般规律,说明高繁殖力猪新品系HN已具有稳定的遗传基础,已达到选育的目标;在选育过程中,可以把总产仔数和断奶窝质量作为主选性状,用于选择高繁殖力个体. 王鹏飞 李生贵 张生伟 黄旺洲 闫尊强 滚双宝 马艳萍 马艳萍 魏万鹏关键词:繁殖力 繁殖性状 性状遗传 C型产气荚膜梭菌性腹泻仔猪脾脏转录组分析 2023年 旨在获得C型产气荚膜梭菌性腹泻仔猪血清炎症因子含量、脾脏病理变化及转录组表达谱特征,为其防治提供参考。选择健康状况良好、体质量相近的7日龄二元仔猪6头,随机分为2组,即对照组(CS)和处理组(TS)。TS组每头仔猪每天灌服1 mL菌液(1×109 cfu/mL),连续5 d,CS组仔猪灌服不含菌液的培养液,感染后0,1,3,5 d采集血液分离血清,用ELISA方法检测IL-8、IFN-α和IFN-γ含量。试验结束后屠宰仔猪采集脾脏,进行HE染色和RNA-Seq测序,对测序获得的差异表达基因进行GO功能和KEGG信号通路富集分析,并采用RT-qPCR检测仔猪感染C型产气荚膜梭菌过程中关键差异表达基因的表达量。结果表明:TS组仔猪脾脏出现明显炎症,中性粒细胞浸润,伴有变性及坏死的实质细胞;第3,5天CS组血清中IL-8、IFN-α和IFN-γ含量极显著低于(P<0.01)TS组;TS组与CS组间有1079个差异表达基因,上调583个,下调496个;差异表达基因富集的GO功能主要有细胞对β干扰素的反应、细胞对DNA损伤刺激的反应、炎症反应的负调控等,富集的KEGG信号通路主要有肺结核、乙型肝炎、B细胞受体等;抵抗C型产气荚膜梭菌感染的候选基因(如JAK3、TLR3、ILF2、CXXC1等)RNA-Seq结果与RT-qPCR结果一致。以上结果表明,JAK3、TLR3等基因通过关键信号通路可能在仔猪脾脏抵抗C型产气荚膜梭菌感染过程中发挥了重要功能。 闫尊强 王鹏飞 杨巧丽 黄晓宇 高小莉 滚双宝关键词:仔猪 腹泻 脾脏 C型产气荚膜梭菌 转录组 合作猪夏冬季的肠道菌群结构 被引量:6 2021年 【目的】探究合作猪夏季和冬季肠道微生物菌群多样性和组成特征.【方法】采用16S rRNA基因测序技术分析夏季和冬季半放牧饲养的6月龄健康合作猪的粪便菌群结构特征.【结果】合作猪冬季与夏季肠道菌群α多样性指数差异不显著(P>0.05),但β多样性冬季显著高于夏季(P<0.05);厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和螺旋体门(Spirochaetes)为夏季合作猪和冬季合作猪粪便菌群优势菌门,unidentified_Clostridiales细菌属和Terrisporobacter为夏季合作猪和冬季合作猪粪便菌群的优势菌属.菌群组成差异分析显示,在科水平,夏季合作猪粪便菌群中链球菌科(Streptococcaceae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、丹毒丝菌科(Erysipelotrichaceae)、乳杆菌科(Lactobacillaceae)和消化球菌科(Peptococcaceae)的相对丰度显著高于冬季合作猪(P<0.05),而冬季合作猪粪便菌群中甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae)的相对丰度显著高于夏季合作猪(P<0.05);在种水平,拟普雷沃菌309(Alloprevotella_sp_feline_oral_taxon_309)、梭菌属细菌ID5(Clostridium_sp_ID5)、柏林密螺旋体菌(Treponema_berlinense)和溶纸梭菌(Clostridium papyrosolvens)在夏季合作猪粪便菌群中的相对丰度均显著高于冬季合作猪(P<0.05);反刍甲烷杆菌(Methanobrevibacter_ruminantium)、瘤胃菌属细菌YS3(Rumen_bacterium_YS3)以及毛螺旋菌科细菌YE64(Bacterium YE64)在冬季合作猪粪便菌群中的相对丰度均显著高于夏季合作猪(P<0.05).【结论】合作猪肠道菌群多样性和组成与其适应不同季节气候和饲草种类的变化有关. 裴利君 杨巧丽 王鹏飞 滚双宝关键词:合作猪 肠道菌群 FABP2基因在不同比例花椒籽饲喂育肥猪的组织差异表达、克隆及生物信息学分析 2022年 旨在分析不同比例花椒籽替代部分玉米饲喂三元杂交育肥猪不同组织FABP2的差异表达,寻找肌内脂肪沉积的关键基因;同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区序列,并用生物信息学方法对其进行分析。选取288头90日龄杜×长×大三元杂交育肥猪(33 kg),随机分为4组,每组4个重复,每个重复18头猪;对照组饲喂基础日粮,试验组分别用花椒籽代替饲粮中2.5%(试验Ⅰ组),5.0%(试验Ⅱ组),7.5%(试验Ⅲ组)的玉米,预试验7 d,正试期100 d。采用qRT-PCR检测试验组不同组织中FABP2的相对表达量,同时克隆三元杂交育肥猪FABP2编码区,利用生物信息学分析软件,预测FABP2蛋白理化性质、结构域和磷酸化激酶位点等。结果表明:FABP2在各组织中均有不同程度表达,其中空肠和肝脏中FABP2显著高表达。与对照组相比,各试验组心脏、肺脏、肾脏、十二指肠、空肠和盲肠组织中FABP2显著下调表达;试验Ⅱ组和试验Ⅲ组脾脏和回肠组织中FABP2显著上调表达;试验Ⅰ组肝脏、结肠、直肠和背肌组织中FABP2显著上调表达,说明饲粮中添加花椒籽对三元杂交育肥猪FABP2基因的表达谱具有显著影响。成功克隆并鉴定出三元杂交育肥猪FABP2编码区全长(399 bp),编码132个氨基酸,存在2处错义突变;FABP2蛋白是一种酸性稳定的非分泌蛋白,二级结构主要由延伸链和无规则卷曲构成,含有一个Lipocalin-FABP2超家族保守结构域和3个无序化区域。 李杰 黄晓宇 尚学峰 杨姣姣 张娟丽 谢开会 张亚丽 闫尊强 王鹏飞 高小莉 杨巧丽 马艳萍 滚双宝关键词:花椒籽 克隆 生物信息学分析 结直肠癌生殖器官移植性肿瘤动物模型的建立 2018年 【目的】建立CT26细胞株BALB/c小鼠生殖器官移植肿瘤模型的方法.【方法】将CT26细胞株传代培养于小鼠皮下3代后取指数生长期细胞制成悬液,采用纤维蛋白凝胶移植接种和荷包缝合移植接种2种手术方法,移植固定于小鼠生殖器官皮下,观察小鼠生理状况、成瘤率、移植瘤成长形状和组织病理学变化.【结果】纤维蛋白凝胶移植接种成瘤率为72%,雄性雌性分组平均成瘤时间(13.37±3.06)d和(12.33±2.45)d,荷包缝合移植接种成瘤率为59%,雄性雌性组成瘤时间(15.66±3.77)d和(14.25±2.08)d,成瘤组织病理切片无明显差异.【结论】纤维蛋白凝胶移植成瘤组织病理特征符合肿瘤学动物模型需求且建模成功率高. 陈征 刘凌云 滚双宝 王占彬 刘忠于 李生贵 王鹏飞关键词:转移性肿瘤 结直肠癌 纤维蛋白凝胶 生殖器官 动物模型 新生仔猪C性产气荚膜梭菌性腹泻的研究进展 被引量:4 2018年 C型产气荚膜梭菌是引起仔猪腹泻的主要细菌性病原菌之一,主要感染7日龄以内的新生仔猪,该菌通过接触感染,引起坏死性肠炎、仔猪腹泻等疾病,影响发病仔猪的生长发育,甚至导致仔猪死亡.近几年C型产气荚膜梭菌的危害日益严重,每年因产气荚膜梭菌感染导致许多动物患病和死亡,给我国乃至世界养猪业带来严重的经济损失.本文主要从C型产气荚膜梭菌的毒素类型、致病机制、防治措施及调控机制等方面就仔猪C型产气荚膜梭菌性腹泻的研究进展进行了综述,以期为将来深入开展相关研究提供参考. 孙文阳 黄晓宇 杨巧丽 闫尊强 王鹏飞 高小莉 雒瑞瑞 王伟 谢开会 滚双宝关键词:仔猪 C型产气荚膜梭菌 致病机制